MiSeq Reporterソフトウェア

MiSeq Reporter内蔵データ解析ソフトウェア

シンプルな装置上のデータ解析

MiSeq Reporterソフトウェアは二次データ解析を実行し、MiSeqシーケンサーにプレインストールされています。Real Time Analysisソフトウェアによるシーケンスラン中に装置上で生成されたベースコールを処理します。

リアルタイム解析が完了すると、MiSeq Reporterが自動的に起動します。各ゲノムとサンプルについて、アライメント、構造バリアント、コンティグアセンブリに関する情報を生成します。サンプルシートで指定されたワークフローに基づいて解析を実行します。

直感的なグラフィック形式のデータ

MiSeq Reporterは、1次解析および2次解析からのデータ、ならびに各サンプルの品質およびカバレッジ情報を、シンプルで直感的なグラフィック形式で提供します。

プレインストールされたデータベースとリファレンスゲノム

ほとんどのワークフローでは、アライメントを実行するためにリファレンスゲノムが必要です。MiSeq Reporterには、あらかじめインストールされたいくつかのデータベースとゲノムが含まれています。

データベース: ヒト用miRbase、ヒト用dbSNP、ヒト用refGene

ゲノム: Arabidopsis thaliana、牛(Bos taurus)、 大腸菌 株DH10b、ヒト(Homo sapiens)ビルドhg19、マウス(Mus musculus)、ラット(Rattus norvegicus)、 黄色ブドウ球菌、および酵母(Saccharomyces cerevisiae)。

独自のリファレンスゲノムを高速フォーマット(*.fastaまたは*.fa)でアップロードすることもできます。

コンピューティング要件

MiSeq ReporterはWindowsサービスとして実行され、ウェブブラウザで閲覧できます。MiSeqシステムが次のランを実行中にデータを解析する場合は、別のコンピューターに別のソフトウェアのコピーをインストールすることができます。

その他の 要件については、MiSeq Reporterコンピューティング 要件サポートページを参照してください。

MiSeq Reporterをダウンロードするか、サポートを受けてください

MiSeq Reporterの最新バージョンで導入された変更を確認し、最新バージョンをダウンロードしてください。または、MiSeq Reporterテクニカルサポート情報にアクセスしてください。

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