【イルミナiSchool プロフェッショナル】 RNA-Seqをはじめよう!:Session 3 - データ解析のリテラシー

【イルミナiSchool プロフェッショナル】 RNA-Seqをはじめよう!:Session 3 - データ解析のリテラシー

門田 幸二 先生, 東京大学大学院 農学生命科学研究科
Topic: Sequencing : Customer

第3回のセッションは、東京大学の門田先生によるデータ解析です。
(1) RNA-Seqデータ取得(マップする側)
・基本形式(FASTQ形式)
・公共データベースから取得する場合
・クオリティのカットオフ
(2) マッピングに使うリファレンス配列(マップされる側)
・ゲノム配列、(RefSeqのような)トランスクリプトーム配列
(3) リード数のカウントやデータの正規化(RPKM)
(4) データの分布とデータ解析ガイドライン

【イルミナiSchool 初級】SAV(Sequencing Analysis Viewer)でランの評価と改善を行う
イルミナ株式会社
テクニカル アプリケーション サイエンティスト
西田 圭伸
Topic: Sequencing
【プロフェッショナル】次世代シーケンサーを利用した新規genotyping技術GRAS-Diの開発
トヨタ自動車株式会社
新事業企画部バイオ・緑化研究所
榎 宏征 先生
Topic: Customer
【イルミナiSchool 初級】BaseSpace Variant Interpreter (Beta!) 、ことはじめ
イルミナ株式会社
シニアバイオインフォマティクス サポートサイエンティスト
癸生川 絵里
Topic: Sequencing