【イルミナiSchool 中級】 Nextera Mate Pair Sample Preparation Kit と BaseSpaceで完結するバクテリアゲノムアセンブリー

【イルミナiSchool 中級】 Nextera Mate Pair Sample Preparation Kit と BaseSpaceで完結するバクテリアゲノムアセンブリー

陳 盈光, イルミナ株式会社 フィールド アプリケーション サイエンティスト
Topic: Microbiology & Infectious Disease : Sequencing

本セッションでは、Nextera Mate Pair Sample Prep KitとBaseSpaceを用いたバクテリアゲノムアセンブリーをご紹介します。低コストかつ迅速に最少1μgのDNAから長さ12kbまでのメイトペアライブラリーが得られる本キットを用いたライブラリー調製方法を注意点を交えてご案内します。くわえて、BaseSpaceアプリを用いたバクテリアゲノムのde novoアセンブリー(Velvet de novo Assembly)から遺伝子アノテーション(Prokka Genome Annotation)までの一連の解析方法もご紹介します。

 

【イルミナiSchool 初級】BaseSpace Variant Interpreter (Beta!) 、ことはじめ
イルミナ株式会社
シニアバイオインフォマティクス サポートサイエンティスト
癸生川 絵里
Topic: Sequencing
【イルミナiSchool 中級】BaseSpace QIIMEアプリで簡単に環境サンプルのバクテリア多様性を解析する
イルミナ株式会社
アプリケーションコンサルタント
陳 盈光
Topic: Sequencing
【イルミナiSchool 初級】MiSeqのランのセットアップ時・開始時によくあるトラブルの対処方法
イルミナ株式会社
テクニカル アプリケーション サイエンティスト
米田 瑞穂
Topic: Sequencing