Nextera Mate Pair Sample Preparation Kit と BaseSpaceで完結するバクテリアゲノムアセンブリー【イルミナiSchool 中級】

Nextera Mate Pair Sample Preparation Kit と BaseSpaceで完結するバクテリアゲノムアセンブリー【イルミナiSchool 中級】

陳 盈光, イルミナ株式会社 フィールド アプリケーション サイエンティスト
Topic: Microbiology & Infectious Disease : Sequencing

本セッションでは、Nextera Mate Pair Sample Prep KitとBaseSpaceを用いたバクテリアゲノムアセンブリーをご紹介します。低コストかつ迅速に最少1μgのDNAから長さ12kbまでのメイトペアライブラリーが得られる本キットを用いたライブラリー調製方法を注意点を交えてご案内します。くわえて、BaseSpaceアプリを用いたバクテリアゲノムのde novoアセンブリー(Velvet de novo Assembly)から遺伝子アノテーション(Prokka Genome Annotation)までの一連の解析方法もご紹介します。

 



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