【イルミナiSchool 中級】 イルミナのコマンドラインツールを使う

【イルミナiSchool 中級】 イルミナのコマンドラインツールを使う

癸生川 絵里, イルミナ株式会社 バイオインフォマティクス サポートサイエンティスト
Topic: Sequencing : Software : Informatics

イルミナ株式会社
バイオインフォマティクス サポートサイエンティスト
癸生川 絵里

 

【要旨】
イルミナ株式会社 バイオインフォマティクス サポートサイエンティスト 癸生川 絵里 【要旨】 必要なリソースを、必要な時に、必要な分だけ利用する、クラウド利用の潮流はますます巨大になっています。 NGS解析においても、コスト・作業効率などの理由から、この流れは例外ではありません。

本ウェビナーでは、イルミナのインフォマティクス製品開発の広がりをご紹介するとともに、とくにBaseSpace Sequence Hub (クラウド)をユーザローカルLinuxからコマンドラインで使用する事ができるツールについて概説いたします。
例えば、ローカルLinuxからコマンドでBaseSpaceにサンプルリードのfastqをまとめてアップロード/ダウンロードしたり、アライメントの様子を確認したり、ランのクオリティメトリクスを取得したり、といった例をとりあげます。

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