ライブラリー調製の自動化

ライブラリー調製ポートフォリオにまたがる自動化手法

エラーを最小化し、ハンズオンタイムを短縮し、より高いスループットを実現

ライブラリー調製の自動化

自動リキッドハンドリングシステムは、ラボが効率を高めながら一貫した結果を得て維持するのに役立ちます。また、自動化により、追加のハンズオンタイムを必要とせず、スループットの迅速なスケーリングが可能になります。

オートメーションパートナー

イルミナは、主要な自動化ベンダーと提携し、主力システムでライブラリー調製キットの自動化メソッドの提供を支援しています。同社の自動化の知識とライブラリー調製およびシーケンスの専門知識を組み合わせることで、NGS構成の自動化システムのための貴重なソリューションを生み出すことができます。

イルミナ認定メソッド

イルミナの認定メソッドは、ほとんどのライブラリー調製ポートフォリオで利用できます。これらの手法は、当社のパートナーが開発、テスト、配布、所有、サポートしています。イルミナは、メソッドのパフォーマンスとデータ品質を保証するためにデータを確認します。

ベンダーが開発した手法

ベンダーが開発した手法とは、パートナーによって開発されたものの、イルミナによるデータレビューを受けていない手法です。これらの方法は下の表に記載されていますが、イルミナ認定識別子はありません。

ライブラリー調製自動化パートナーチャート

下のチャートおよび関連する凡例を参照して、イルミナの認定を受ける方法を決定してください。

パートナーの文書を表示するには、チャート上部のパートナー名をクリックしてください。

 イルミナ認定(イルミナの解析では、これらの方法で調製されたライブラリーは、手動で調製されたものと同等の性能を発揮することが示されています)

  アジレント ベックマン・コールター エッペンドルフ ハミルトン PerkinElmer テカン
イルミナストランドトータルRNA   Biomek i7 epMotion 5075t NGSスター シクロン ドリームプレップ
イルミナストランドmRNA   Biomek i7 epMotion 5075t NGSスター シクロン  
Illumina RNA Prep with Enrichment BravoオプションA Biomek i7 epMotion 5075t NGSスター シクロン  
イルミナDNA PCRフリー   Biomek i5
Biomek i7
epMotion 5075t NGSスター シクロン
Zephyr
ドリームプレップ
Freedom EVO NGS
Illumina DNA Prep BravoオプションB
BravoオプションA
Biomek FXp
Biomek iシリーズ
NGeniuS
epMotion 5075t NGSスター シクロン Freedom EVO NGS
Illumina DNA Prep with Enrichment BravoオプションB
BravoオプションA
Biomek FXp
Biomek iシリーズ
epMotion 5075t NGSスター シクロン Freedom EVO NGS
Nextera XT DNA BravoオプションB Biomek FXp
Biomek iシリーズ
epMotion 5075t NGSスター シクロン Freedom EVO NGS
AmpliSeq for Illumina*   Biomek i5 epMotion 5075t
epMotion 5073
NGSスター
NGSスターレット
シクロン  
TruSight Oncology 500HT   Biomek i7   NGS STARと96 MPH/SBS STAR MOA    
TruSight Oncology 500   Biomek NXp
Biomek i5
  NGS STAR/SBS STAR LSA
NGSスターレット
シクロン  
TruSight Tumor 15   Biomek 4000 epMotion 5075t   Zephyr  
TruSight Tumor 170   Biomek NXp   NGSスター    
TruSeq DNA PCR-Free BravoオプションB Biomek FXp epMotion 5075t NGSスター Sciclone NGSおよびNGSx Freedom EVO NGS
TruSeq Nano DNA BravoオプションB Biomek FXp
Biomek iシリーズ
epMotion 5075t NGSスター Sciclone NGSおよびNGSx Freedom EVO NGS
TruSeq Stranded mRNA BravoオプションB
BravoオプションA
Biomek FXp
Biomek iシリーズ
epMotion 5075t NGSスター Sciclone NGSおよびNGSx Freedom EVO NGS
TruSeq Stranded Total RNA BravoオプションB Biomek FXp epMotion 5075t NGSスター Sciclone NGSおよびNGSx Freedom EVO NGS

2022年1月より、Hamiltonは、TruSight Oncologyライブラリー調製用のNGS STAR構成をSBS STAR LSAとして参照します。既存のイルミナ認定メソッドはすべて下位互換性があり、この変更は名前のみのものであるため、このシステムで引き続き実行されます。

*自動化プラットフォームに関連する高いデッドボリューム要件と、元の試薬メーカーによる過充填量の変動に対応するため、1キットあたりの最大ライブラリー数を調製する場合、複数のAmpliSeq for Illuminaキットが必要になる場合があります。

追加情報が必要ですか?

オートメーションパートナーとイルミナ認定メソッドの詳細については、オートメーションスペシャリストにお問い合わせください。

お問い合わせ

自動ライブラリー調製ワークフローの例

Agilent Fragment Analyzerシステムによる核酸品質の評価

Fragment Analyzerは、シーケンス中のクラスター形成を最適化するために、単離された核酸と調製されたライブラリーの品質と量を正確に評価します。システムオプションは、ロースループットとハイスループットの両方のラボに対応します。

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ハイスループットメタゲノミクスのための自動化されたNextera DNA Flex Library Prep(現在のIllumina DNA Prep)ワークフロー

合理化された自動化されたワークフローにより、非常に均一なライブラリーが生成され、種同定、メタゲノムプロファイリング、およびde novoゲノムアセンブリのための優れたデータが得られます。

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TSO 500ハイスループット自動化 詳細はこちら
TruSight Oncology 500ハイスループットの自動化

ベックマン・コールター社とハミルトン社の自動化手法により、ライブラリー調製を合理化し、一貫性を持たせています。詳細をご覧ください。

Hamiltonのテクニカルノートを読む
ベックマン・コールター社のテクニカルノートを読む
イルミナのハイスループットシーケンス

ラボでハイスループットシーケンスを採用

ハイスループットシーケンスは、費用対効果の高い方法でデータ豊富なアプリケーションを実行し、より多くのサンプルを処理して統計的有意性を向上させることができます。より多くのデータにすばやくアクセスして、より多くの洞察を得ることができます。

詳細はこちら

ライブラリー調製の技術的ヒント

DNA/RNA単離の際の検討事項

ライブラリー調製前にDNA/RNAを精製しながら、コンタミネーションを回避するためのガイダンスをご覧ください。

dsDNAライブラリー濃縮

イルミナのライブラリー調製方法の一部について、ライブラリー濃度をng/μLからnMに変換する方法をご覧ください。

定量と品質管理

シーケンスランを成功させるための最終ライブラリーの定量化と検証方法をご覧ください。