OvineSNP50 DNA解析キット

このヒツジマイクロアレイは、ゲノムワイド関連解析、ゲノムワイド選択、および遺伝的メリットの判定のために、54,241を超える等間隔のSNPプローブを特徴としています。 続きを読む...

BeadChipは、AgResearch、Baylor UCSC、CSIRO、およびUSDAの一流のウシ研究者と共同で、International Sheep Genomics Consortiumの一部として開発されました。一塩基多型(SNP)をターゲットにした54,241を超える等間隔のプローブを備えています。

製品のハイライト

OvineSNP50 BeadChipアレイは、SNPをターゲットとする54,241を超える等間隔のプローブを備えており、ゲノムワイドなアソシエーション研究や、ゲノムワイドな選択、遺伝的メリットの決定、量的形質遺伝子座の同定、比較遺伝子研究などのその他のアプリケーションに十分なSNP密度を提供します。

これらのマーカーのうち18,000個以上が、イルミナゲノムアナライザーIIxを用いたシーケンスにより、縮小された表現ライブラリーによって発見されました。23種の品種から403匹を超える動物について、BACエンドシーケンスにより600のSNPセットを同定し、イルミナのGoldenGate Genotyping Assaysで検証しました。残りのSNPは、ウシゲノムの草案から派生しました。

OvineSNP50 BeadChipは、平均で46kbあたり1マーカーと推定され、ゲノム全体のカバレッジが均一です。

BeadChipは、高いコールレートを提供し、柔軟なコンテンツ展開を可能にし、コピー数バリエーションの検出と測定を可能にします。

  • BeadChipは、研究者が最大12のサンプルを同時に調査できるようにすることで、実験のばらつきをさらに低減します
  • PCRやライゲーションステップを行わずに、アッセイのシングルチューブサンプル調製を行うことで、労力やサンプル取り扱いエラーの可能性を大幅に削減できます。

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仕様

メソッド別のワークフロー例

 

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