ゲノム全体の高解像度な姿

NGSを使った全ゲノムシーケンスで包括的な遺伝解析を実施

全ゲノムシーケンス

全ゲノムシーケンスはゲノムを解析する上で最も包括的な手法です。遺伝情報は、遺伝性疾患の同定、がん進行に関与する変異の特徴づけ、感染症アウトブレークのトラッキングなどに不可欠なものとなりました。急速なシーケンスコストの低下と大規模データを産出する能力により、全ゲノムシーケンスはゲノム研究において強力なツールとなりました。

全ゲノムシーケンスは主にヒトゲノムのシーケンスを思い浮かべますが、拡張性と柔軟性をもつ次世代シーケンサー(NGS)では、農業的に重要な家畜や農作物、その他疾患に関与する病原体など、どんな生物種においても同等に使用できる手法です。

  • 高解像度な1塩基ごとの姿をゲノム全体で捉えることができる
  • 大規模および小規模な変異の両方を観察できる
  • 遺伝子発現や制御メカニズムのフォローアップ解析につながる原因変異の候補を同定することができる
  • 大規模なデータを産出し、新規ゲノムをアセンブルまで最短で行える
Advantages of Whole-Genome Sequencing

ゲノムの特定領域のみを調べるエクソームやターゲットリシーケンスのようなフォーカスした手法とは異なり、全ゲノムシーケンスはゲノム全体の包括的な姿を捉えることができます。このため、原因変異の同定や新規ゲノムアセンブルなどの探索アプリケーションに適しています。全ゲノムシーケンスは1塩基変異だけでなく、挿入・欠失、コピー数変化、大規模な構造変異などを検出することができます。最近のテクノロジーの改革により、最新ゲノムシーケンサーは以前と比べて飛躍的に効率よく全ゲノムシーケンスを実施できるようになりました。

An Uncompromised View of the Genome
大きいゲノムの全ゲノムシーケンス

5Mb以上の大きいゲノム(ヒト、植物、動物など)では、疾患研究や集団遺伝学において貴重な情報をもたらします。

詳細はこちらから
小さいゲノムの全ゲノムシーケンス

5Mb以下の小さいゲノムでは、微生物、ウィルスなどの全ゲノムをシーケンスします。NGSを使えば、数百から数千のゲノム解析を並列して行うことができます。

詳細はこちらから
de novoシーケンス

de novo シーケンスは新規ゲノムの配列決定を意味し、これまで配列情報がわからなかった生物種を対象としています。NGSでは迅速に高精度なゲノム特徴づけをどの生物種でも行うことができます。

詳細はこちらから
フェージングシーケンス

フェージングシーケンス、あるいはゲノムフェージングと呼ばれるアプローチは、相同染色体のアリル間の違いを捉え、全ゲノムのハプロタイプを行います。この情報は疾患研究にて重要です。

詳細はこちらから
Sequencing Method Explorer
Sequencing Method Explorer

Use this interactive tool to explore experimental NGS library preparation methods compiled from the scientific literature.

Find a Method
がん全ゲノムシーケンス
Cancer Whole-Genome Sequencing

腫瘍サンプルの全ゲノムシーケンスは、がん組織における特有の変異の包括的な像を捉えることができ、がん関連遺伝子、腫瘍抑制遺伝子、その他リスク要因などの情報を得ることができます。
がん全ゲノムシーケンス >>

微生物全ゲノムシーケンス
Microbial Whole-genome Sequencing

微生物全ゲノムシーケンスは、高精度のリファレンスゲノムの産出、微生物同定、そして比較ゲノム研究において重要です。
微生物全ゲノムシーケンス >>

ショットガンメタゲノミクス
Shotgun Metagenomics

ショットガンメタゲノミクスにより、研究者はある複雑なサンプル下のすべての生物種のすべての遺伝子を評価することができます。この手法を使うことで、微生物学者は微生物の多様性を解析し、様々な環境における微生物の存在を検出することができます。
ショットガンメタゲノミクス >>

原因変異の探索
Causal Variant Discovery

全ゲノムシーケンスは複雑な疾患や形質に関連する原因変異を同定し、疾患メカニズムの特徴づけを行う遺伝子のターゲットを研究することができます。
原因変異の探索 >>

電子メールにてゲノム解析研究手法における最新のニュース、事例研究、アプリケーションなどの情報をご提供します。ぜひご登録ください。

次世代シーケンサー(NGS)アプリケーションガイド
次世代シーケンサー(NGS)アプリケーションガイド

ライブラリー調製からシーケンサーの選択や解析まで。お客様のラボに最適なツールをお選びください。

PDFをダウンロード
最新のゲノムシーケンサー
最新のゲノムシーケンサー

NovaSeqシリーズは実績あるイルミナの技術を活用し、さらなる技術革新を果たしました。拡張性の高いスケーラブルなスループットと、すべてのゲノム、シーケンス手法、サンプル規模に対応するフレキシビリティーを手にすることができます。

システムを見る
シーケンスプラットフォームを比較
シーケンスプラットフォームを比較

業界をリードするデータクオリティと精度をもたらす様々なNGSプラットフォーム。最適なシステムをお探しください。

NGSを比較する
ライブラリー調製とアレイキットセレクター
ライブラリー調製とアレイキットセレクター

プロジェクトタイプ、出発材料、興味のある手法に応じた最適なキットをお選びください。

最適なキットを探す
シーケンストラブルシューティングのヒント
シーケンストラブルシューティングのヒント

これらのショートビデオでは、オーバークラスタリング、不安定な定量、そしてインサートを含むシーケンスなど、よくあるトラブルについて専門的なヒントをご紹介しています。

ビデオを見る
シーケンスカバレッジのヒント
シーケンスカバレッジのヒント

実験に必要なシーケンスカバレッジの予測と達成について、説明します。

詳細はこちら