イルミナテクノロジーを使ったがん研究者による発表

がん研究者によるウェビナーおよびビデオ

イルミナHiSeq2000を用いたがんゲノムシークエンス解析

理化学研究所 バイオマーカー探索・開発チーム
中川 英刀 先生

がん研究に次世代シーケンサーを既に使っている方、これから使おうと考えている方を対象としたWebinarです。先日Nature Genetics に掲載された肝臓がん27例の全ゲノム解析に関するご研究を中心に、癌研究の分野において次世代シーケンサーがどのように活用されているか、ご講演いただきました。

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次世代シーケンサーがどのようにがん診断を革新するか

Peter MacCallumがんセンターのDr. Andrew Fellowes が、TruSeq Amplicon –Cancer PanelとMiSeqを使い、これまでのテクノロジーでは不可能であった幅広い変異の包括的な腫瘍サンプルのプロファイリングを行う様子を語ります。

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病因がん変異を同定するための全ゲノムシーケンスWGS to Identify

Nicholas J. Schork(Ph.D.)が、ヒト全ゲノムにおける変異、がんのドライバー変異および臨床シーケンスについて話します。

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イルミナ次世代シーケンサー:大きく考え小さく始める

Clarient (GE Healthcare)のChief Medical Officer であるKenneth Bloom (MD, FCAP)が、どのようにがん遺伝子シーケンスが臨床ラボで応用されるかの実践面について議論しています。

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トランスクリプトーム、エピゲノム、エピトランスクリプトームのける腫瘍の進化

Weill Cornell Medical College の生理学/バイオ医学部門の助教授であるChristopher Masonが、がんサンプルにおけるトランスクリプトーム、エピゲノム、エピトランスクリプトームをシーケンス解析することで、どのように腫瘍の進化を明確にできるかを話しています。

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卵巣および子宮内膜腫瘍の早期発見のためのイルミナシーケンスアプローチ

Johns Hopkins のがん遺伝および治療センターの教授であるLuis Diaz (MD)が、ゲノム情報の臨床応用について講演しています。

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Cancer Transcriptome Analysis of Degraded and FFPE RNA

Dr. Patrick Hurban discusses RNA-Seq using degraded and FFPE-derived RNA.

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Cancer RNA-Sequencing for Transcriptome Analysis

Learn about RNA-Seq for transcriptome analysis of single cells.

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Sequencing Single-Cell DNA in Breast Cancer

Researchers devised an approach to sequence single cells from triple negative breast cancer by naturally duplicating cellular DNA. With this new technology, researchers are better able to characterize the heterogeneous microenvironment of the tumor.

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Easier Analysis and Storage

Alex Dickinson, senior VP of cloud genomics, explains how BaseSpace helps researchers easily run leading-edge bioinformatics tools.

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How to Open Tumor-Normal Sequencing Data in BaseSpace

This video describes how to log into BaseSpace to access tumor-normal sequencing data. It also provides a brief description of the BaseSpace Project page and describes the data contained within each section.

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What Does the Somatic Summary Report Show?

This video reviews the findings in the report produced following the Cancer Sequencing Workflow. The Cancer Sequencing Workflow is the analysis software available through the Illumina Genome Network cancer analysis service.

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Loading Tumor-Normal Sequencing Data into the Broad IGV

This video shows how to load the tumor sequencing data into the Broad Institute Integrative Genomics Viewer (IGV), a free app available in BaseSpace. It demonstrates how to load the files within this project for visualization, and provides a brief orientation to navigation within IGV.

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Viewing Tumor-Normal Sequencing Data in BaseSpace Using the Broad IGV

This video shows how to use IGV to visualize variants identified between tumor and normal samples. This example highlights an indel in TP53 and a translocation between chromosomes 1 and 8.

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