イルミナテクノロジーを使った
微生物ゲノム研究における画期的な成果

微生物ゲノム研究者によるビデオおよびウェビナー

微生物ゲノムのde novoアセンブル

イルミナのゲノム解析クラウドプラットフォームであるBaseSpaceで簡単に行えるde novoアセンブルについての概説をご覧ください。

ビデオの視聴
画像
Accelerate microbial breakthroughs

Next-generation sequencing (NGS) enables many types of microbial studies, including direct evolution, mutation screening, and epidemiology.

View Video
Accelerate microbial breakthroughs
Next-generation sequencing for microbiology

Comprehensive next-generation sequencing (NGS) solutions can provide high-resolution genomic data for microbiome studies or environmental surveillance.

View Video
Next-generation sequencing for microbiology
Researching symbiotic microbial communities

Herbivores rely on symbiotic microbial communities to convert indigestible plant materials into accessible nutrients. Sloths are thought to be especially dependent on this symbiosis, as their mostly leaf-based diet severely limits their nutrient intake. University of Wisconsin-Madison researchers explore a microbe-cycling hypothesis with tree sloths and paired-end 16S amplicon sequencing.

View Webinar
Researching symbiotic microbial communities
Metagenomic end-to-end solution: From samples to automated bioinformatics

Metagenomic studies are becoming more and more popular. From sample extraction, to sequencing, a simple workflow is described in this session, featuring a metagenomics application from CosmosID, a bioinformatics company.

View Webinar
Metagenomic end-to-end solution: From samples to automated bioinformatics
Next-Generation Sequencing Technology Drives Discoveries in Disease Pathology

Tony Goldberg and Sam Sibley discuss how NGS is driving progress in infectious disease epidemiology for veterinary medicine.

View Webinar
Next-Generation Sequencing Technology Drives Discoveries in Disease Pathology
Archaeology of the Invisible

Dental calculus, the hard deposit the dentist scrapes off your teeth, is the only part of your body that fossilizes during your lifetime.

View Video
Archaeology of the Invisible
16S ribosomal RNA遺伝子から始める腸内細菌叢解析

森永乳業株式会社 食品基盤研究所 生物機能研究部
小田巻 俊孝 博士

森永乳業株式会社食品基盤研究所において、腸内細菌解析を行なっておられる小田巻博士から、イルミナのデスクトップ型シーケンサーMiSeqを用いた最新の解析結果をご講演いただきます。

ビデオをみる
Image
Nexteraによるライブラリー調製:実験の流れ、注意点、応用例について

宮崎大学医学部 感染症学講座微生物学分野
小椋 義俊 先生

病原性大腸菌など微生物のゲノム解析において豊富な経験と実績をお持ちの小椋先生から、イルミナのデスクトップ型シーケンサーMiSeqと画期的なサンプル調製用キットNexteraを用いてゲノム解析を行なう際の、実際の実験のポイントを、ご講演いただきました。

ビデオをみる
Image
非モデル生物のRNA-seq解析 -- 実験デザインから解析パイプラインまで

基礎生物学研究所 生物機能解析センター
重信 秀治 先生

次世代DNAシークエンサーによって、非モデル生物のゲノム・遺伝情報へのアクセスは飛躍的に容易になりつつある。ゲノムが未知であっても、イルミナの ショートリードをde novo アセンブルすることによりトランスクリプトームのかなりの部分を網羅することが可能である。得られたアセンブルは発現比較解析、多型探 索、プロテオーム解析用データベース、分子進化解析など多様な用途に利用できる。

近年のシークエンスコストの低下とインフォマティクス技 術の進歩により、de novo RNA-seqは費用対効果が極めて高い技術となっている。本講演では、非モデル生物のRNA-seq解析の一連の流れを、実験デザインから、ライブラリ 作製、インフォマティクスのパイプラインまで概説する。

ビデオをみる
Image
Miseqでのde novo実験

沖縄科学技術大学院大学 DNAシーケンシングセクション
藤江 学 氏、小柳 亮 氏

サンゴ、アコヤガイなどのゲノム解析を実施された沖縄科学技術大学院大学のDNAシーケンシングセクションにおいてMiSeqがどのように活用されているか、MiSeqの250塩基のペアエンド解析を、どのようなに活用しておられるか、ご講演いただきました。

ビデオをみる
Image
DDBJパイプラインによるRNA-seq配列のde novoアセンブル

国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室
中村 保一 先生、長崎 英樹 先生、谷沢 靖洋 先生

遺伝研で解析パイプラインについて、またパイプライン内部のスパコン利用、DDBJパイプラインの概要などについてご講演いただきました。また、遺伝研で 公開しているDDBJパイプライン上にてTrinityを実行し、公開RNA-Seq配列に対してde novoアセンブルするデモも実施いただきました。

ビデオをみる
Image
Accelerate microbial breakthroughs

Next-generation sequencing (NGS) enables many types of microbial studies, including direct evolution, mutation screening, and epidemiology.

View Video
Accelerate microbial breakthroughs
Next-generation sequencing for microbiology

Comprehensive next-generation sequencing (NGS) solutions can provide high-resolution genomic data for microbiome studies or environmental surveillance.

View Video
Next-generation sequencing for microbiology
Metagenomic end-to-end solution: From samples to automated bioinformatics

Metagenomic studies are becoming more and more popular. From sample extraction, to sequencing, a simple workflow is described in this session, featuring a metagenomics application from CosmosID, a bioinformatics company.

View Webinar
Metagenomic end-to-end solution: From samples to automated bioinformatics
Next-Generation Sequencing Technology Drives Discoveries in Disease Pathology

Tony Goldberg and Sam Sibley discuss how NGS is driving progress in infectious disease epidemiology for veterinary medicine.

View Webinar
Next-Generation Sequencing Technology Drives Discoveries in Disease Pathology
Archaeology of the Invisible

Dental calculus, the hard deposit the dentist scrapes off your teeth, is the only part of your body that fossilizes during your lifetime.

View Video
Archaeology of the Invisible
HIVの詳細なシーケンス

ウィルスハプロタイプのトラッキングおよび薬剤耐性変異の検出について、Dr. L. Gordon Bentleyが議論ししています。

ビデオをみる
Image
ヒトと地球のマイクロバイオーム

Dr. Rob Knight に Human and Earch Microbiome プロジェクトについてご講演いただきました。

ビデオをみる 
Image
病原の変化をトラッキング

近年広がるゲノム疫学分野の内容です。カナダのブリティッシュコロンビア州でおこった結核のアウトブレイクについて、次世代シーケンサーでどのように調査したかについて、Dr. Jennifer Gardyにお話いただきました。

ビデオをみる 
Image

電子メールにて微生物ゲノムにおける最新のニュース、事例研究、アプリケーションなどの情報をご提供します。ぜひご登録ください。