NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Infinium Custom Methylation Kitには、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipと試薬が含まれており、研究者や商業ユーザーが重要なエピジェネティック研究アプリケーションのための画期的なアッセイを開発できます。
Infinium Custom Methylation Kit
大規模でターゲットを絞ったエピジェネティックなアプリケーション向けに完全にカスタマイズ可能なメチル化マイクロアレイ。
概要
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコルとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減し、ユーザーは年間数十万サンプルまでのオペレーションを拡張できます。
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコルとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減し、ユーザーは年間数十万サンプルまでのオペレーションを拡張できます。
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコルとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減し、ユーザーは年間数十万サンプルまでのオペレーションを拡張できます。
Infinium Custom Methylation Kitの主な機能
仕様
必要な製品
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip-24キットの購入が必要です。各キットには、BeadChipが2個含まれており、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬も含まれています。
iScanシーケンスシステムが必要です。
Infiniumプロトコールのすべての必須ステップを網羅する、3日間のハンズオンインストラクションのためのオプションの入門コースは、サンプルとBeadChipの準備、サンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析など、購入可能です。
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アプリケーション
Infinium Custom Methylation Kitでは、一般的な疾患研究、がん研究、エピジェネティックエイジング、およびナトリピゲノミクスなどの商業および学術的なエピジェネティックアプリケーションのために、ゲノムのターゲット領域におけるDNAメチル化を測定するカスタムハイスループットアッセイを作成できます。
ワークフローの例
手法
メチル化アレイにより、1塩基の解像度でゲノム全体のメチル化部位をハイスループットで定量化できるようになります。
スキャン
iScanマイクロアレイスキャナーは、ハイスループットのBeadChip処理をサポートし、数百から数千に及ぶサンプルを迅速かつ正確にスキャンします。
解析
GenomeStudioデータ解析ソフトウェアにより、イルミナのマイクロアレイプラットフォームで生成されたデータを可視化し、解析します。
関連するアプリケーションとメソッド
イルミナは、エピジェネティックな修飾とその遺伝子制御への影響を研究するためのソリューションを提供します。
ゲノムワイドなDNAメチル化解析は、NGSを使用して高い透明度を得るか、マイクロアレイを使用してサンプルあたりのコストを最小限に抑えることができます。
マイクロアレイを用いた大規模なジェノタイピングにより、大規模なコホートまたは母集団における疾患リスクに関連するバリアントを同定することができます。
比較する
選択ツール
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。
DesignStudioは、カスタムシーケンスプローブのデザインと注文、カスタムジェノタイピングアレイアッセイの作製に役立つウェブベースのアッセイデザインツールです。
図
Infinium IおよびIIアッセイにより、CpG部位の広範なカバレッジが可能
イルミナのメチル化BeadChipは、Infinium IアッセイとInfinium IIアッセイの両方を採用しており、全体的なカバレッジの幅を広げています。（A）Infinium Iプローブの設計では、CpG遺伝子座ごとに2種類のビーズを使用し、メチル化状態と非メチル化状態にそれぞれ1種類ずつ使用します。（B）Infinium IIプローブの設計では、両方の州で1種類のビーズを使用しています。
設計と製造プロセス
研究者はイルミナのテクニカルデザインチームやカスタマーサービスチームと協力し、BeadChipマーカーの内容を改良し、注文と生産プロセスを調整します。
- Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. ハイスループット全ゲノムバイサルファイトシーケンスのためのライブラリー調製法とシーケンスプラットフォームの系統的評価。 Sci Rep. 2019;9(1):10383。2019年7月17日発行。doi:10.1038/s41598-019- 46875-5
リソース
柔軟でスケーラブルなInfiniumワークフローについて
Infinium Methyl Custom-24 Kit (48 Spl)
20042146
Infinium HTS iSelect Methyl Custom Beadchip、48サンプル
サービス (1)
Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site
20015273
Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。
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よくある質問（FAQ）
Infinium HTS iSelect Custom BeadChipには、メチル化EPIC BeadChipで利用可能な標準SNPコントロールが含まれています。
GenomeStudio Methylation Moduleはベータ値を抽出し、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipデータのサンプルクラスター解析を提供します。BeadArray Controls Reporterソフトウェアツールは、現時点ではサポートされていません。
特に、Bioconductorには、強化されたノーマライゼーションと視覚化のオプションを提供するSeSAMeなどの多くのフリーウェアアプリケーションがあります。イルミナはこれらのフリーウェアソリューションを直接サポートしていません。
いいえ、イルIllumina LIMSは現時点ではInfinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipsをサポートしていません。
いいえ、FFPEサンプルは現在サポートされていません。
手動および自動フォーマットのZymo Research EZ-96 Methylation-Lightning MagPrep Kitは、Infinium Methylationアッセイの上流での使用に対応しています。詳細については、このテクニカルノートの結果を確認してください。
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MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
CpGアイランド、遺伝子、エピゲノムワイド関連解析用エンハンサーを広範囲にカバーする頑強なメチル化プロファイルマイクロアレイ。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
多様なマウス系統の高分解能エピジェネティック解析用のメチローム全体の> 28.5万マーカーが特徴です。
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