がんとの関連性が確認されている50個の遺伝子のホットスポットを調べる標的研究パネル。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer（COSMIC）1 データベースで特定されたように、がんとの関連が知られている50の遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を研究するためのターゲットリシーケンスアッセイです。
Cancer HotSpot Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナ合成シーケンス（SBS）次世代シーケンス（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このパネルは、肺、結腸、乳房、卵巣、黒色腫、前立腺など、複数のがんタイプ内で高感度なバリアント検出を可能にします。すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
| Cancer type | Pan-Cancer, Solid Tumor |
|---|---|
| Method | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | FFPE Tissue |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
| アッセイ時間 | 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
| アンプリコン数 | 合計207（1プール） |
| インプット量 | 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 |
| コンテンツ仕様 | がんとの関連性が確認されている50の遺伝子のホットスポット |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 |
| マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | ヒト |
| 説明 | 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 |
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panelワークフローには、Cancer Hotspot Panel、Library PLUSキット、およびインデックスアダプターが必要です。
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | 16 samples per run (assumes minimum coverage of 500×) |
2 × 150 bp |
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 32, high output: 96 (assumes minimum coverage of 500×) |
2 × 150 bp |
| MiSeq System | Samples per run (by reagent kit version): v2 nano: 4, v2 micro: 16, v2: 60, v3: 96 (assumes minimum coverage of 500×) |
2 × 150 bp |
ターゲットリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたはゲノム領域を単離しシーケンスすることで、ラボのリソースを節約できます。
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
| AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 15 | |
|---|---|---|---|---|
| Cancer type | Pan-Cancer, Solid Tumor | Solid Tumor | Solid Tumor | Pan-Cancer, Solid Tumor |
| Method | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | FFPE Tissue | FFPE Tissue | FFPE Tissue | FFPE Tissue |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
| アッセイ時間 | 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5～6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5～6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 7時間 |
| アンプリコン数 | 合計207（1プール） | 合計553（2プール） （DNAプール：269アンプリコン。 RNAプール：284アンプリコン） | 合計4,648、4プール（DNAプール1：1,891アンプリコン。DNAプール2：1,890アンプリコン。RNAプール1：447アンプリコン。RNAプール2：420アンプリコン。） | |
| インプット量 | 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 | 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 | 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 |
FFPE DNA 20 ng |
| コンテンツ仕様 | がんとの関連性が確認されている50の遺伝子のホットスポット | 52のがん遺伝子のDNAおよびRNAターゲット | 161のがん遺伝子のDNAおよびRNAターゲット | 固形腫瘍に関連する15の遺伝子から250アンプリコンを増幅 |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode | MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 | <1.5時間 | <1.5時間 | 3.5時間 |
| マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 1～24プレックス |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 | マルチプレックスPCR法 | マルチプレックスPCR法 | |
| 核酸の種類 | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
| 生物種 | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト |
| 説明 | 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 | 固形腫瘍がんに関連する52の遺伝子の体細胞解析研究。 | 固形がんに関連する遺伝子*のホットスポットおよび完全長ターゲットに関する身体解析研究。 |
20 ng DNAを用いた固形腫瘍の15の一般的な変異遺伝子に対するNGSアッセイ。 |
AmpliSeq™ Cancer HotSpot Panel v2 for Illumina®
20019161
50のがん関連遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を評価するターゲットパネル。キットには24の反応が含まれます。Library PLUSおよびインデックス付きアダプターは別売です。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel
20019162
AmpliSeq Library PLUS for Illuminaとペアにすると、96反応に十分な8つの一塩基多型（SNP）ターゲットプライマーペアと1つの性差別プライマーペアが含まれます。迅速かつ正確なサンプル同定を可能にします。ライブラリー調製、プローブパネル、インデックスアダプターは別途ご購入ください。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
5,000を超えるプレテスト済み遺伝子のカタログから選択することで、ヒト疾患研究のためのパネルデザインを効率的かつ便利にカスタマイズできます。
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
小児および若年成人のがんに関連する203の遺伝子を調べるためのターゲットパネル。
参考文献
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