NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、ビーズ上のタグメンテーションに続いて、90分のハイブリダイゼーションステップを簡素化することで、RNAシーケンス（RNA-Seq）アプリケーションに非常に高速なソリューションを提供します。
Illumina RNA Prep with Enrichment
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
<9時間
アッセイ時間
<2時間
ハンズオンタイム
10 ng RNA、20 ng FFPE RNA
インプット量
概要
迅速、シンプル、かつスケーラブルなワークフロー
2時間未満のハンズオンタイムで、合計9時間未満でシーケンス対応ライブラリーを調製し、濃縮します。イルミナのハイスループットシーケンス装置と組み合わせることで、ランごとに大幅に多くのサンプルが得られます。
困難なサンプルからの高品質なデータ
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織など、限られた出発物質および損傷または分解したサンプルから再現性のある結果を提供できます。
手頃な価格で徹底したRNA-Seq
シーケンス深度のほんの一部で検出力を最大化します。Illumina RNA Prep with Enrichmentは、優れたキャプチャー効率とカバレッジの均一性を提供することで、正確な検出に必要なシーケンス深度をバイアスなしで最小限に抑えるように設計されています。
柔軟なモジュラーパネル設計
事前に構築され検証されたさまざまなプローブやカスタムプローブを使用して、アレル特異的発現、融合検出、バイオマーカースクリーニングなどを検出し、発見することで、最大限の柔軟性を実現します。
仕様
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Low-Input Samples, FFPE Tissue |
| Strand specificity | Non-Stranded |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
| アッセイ時間 | <9時間 |
| インプット量 | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA |
| コンテンツ仕様 | Illumina Exome Panelと併用する場合、コーディング・トランスクリプトームをキャプチャー |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <2時間 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 核酸の種類 | RNA |
| 生物種 | ヒト, Virus |
| 説明 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織およびその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプおよびインプットからの標的転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション |
必要な製品
完全なRNA Prep with Enrichmentワークフローでは、ライブラリー調製・プローブパネル・インデックスアダプター（すべてのアイテムは別売）を使用する必要があります。
オプションのコンポーネントには、以下が含まれます：
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment：推奨とは異なるプレキシティで処理されるお客様専用のエンリッチメント試薬が含まれます
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation：推奨とは異なるプレキシティで処理されるお客様専用のプレエンリッチメント試薬が含まれます
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アプリケーション
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、対立遺伝子特異的発現・融合検出・バイオマーカースクリーニングなどの検出および探索研究をサポートする幅広いRNA-Seqアプリケーション用のターゲットシーケンスライブラリーの調製において、サンプルタイプとRNAインプット量の柔軟性を可能にします。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina RNA Prep with Enrichment
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel Mid output: 5 High output: 16 (based on 25M reads per sample) |
2 × 100 bp |
| NextSeq 1000 System, NextSeq 2000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel P2: 16 P3: 48 (based on 25M reads per sample) |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 (based on 25M reads per sample) |
2 × 100 bp |
| MiSeq System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel or Pan-Coronavirus Panel Up to 25 samples (based on 1M reads per sample) |
2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel or Pan-Coronavirus Panel Up to 384 samples (based on 1M reads per sample) |
2 × 150 bp |
アプリケーションノート
関連するアプリケーションとメソッド
NGSを使用して、新規の微生物の発見、感染拡大の監視、食料源の分析などを行うことができます。
RNA-Seq を用いて、がん遺伝子の発現およびトランスクリプトームの変化を検出し、新規がん転写産物を同定します。
治療反応を予測するRNAベースのバイオマーカーの評価は、医薬品開発プロセスにおいて不可欠なものとなりつつあります。
ドキュメント
製品資料
サポートドキュメント
- Illumina RNA Prep with Enrichment（L）タグメンテーションチェックリスト Documentation
- Illumina RNA Prep with Enrichment（L）タグメンテーション消耗品および装置 Documentation
- Illumina RNA Prep with Enrichment（L）タグメンテーションリファレンスガイド Documentation
- Illumina RNA Prep with Enrichment（L）タグメンテーション文書 Documentation
- All Illumina RNA Prep with Enrichment（L）タグメンテーションサポート Support
比較する
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| Automation capability | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots |
| Method | Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing | mRNA Sequencing, Exome Sequencing | mRNA Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Low-Input Samples, FFPE Tissue | Low-Input Samples, FFPE Tissue | Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples |
| Strand specificity | Non-Stranded | Stranded | Stranded |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
| アッセイ時間 | <9時間 | 約2日 | 6.5時間 |
| インプット量 | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA | 標準品質トータルRNA25～1,000 ng |
| コンテンツ仕様 | Illumina Exome Panelと併用する場合、コーディング・トランスクリプトームをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトームをストランド情報でキャプチャー |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeqシステム, NovaSeq 6000 System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, HiSeq 3000, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, HiSeq 4000 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <2時間 | 約11時間 | <3時間 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 | ポリAキャプチャー、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 |
| 核酸の種類 | RNA | RNA | RNA |
| 生物種 | ヒト, Virus | ヒト | Mammalian, ウシ, マウス, ヒト, ラット |
| 説明 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織およびその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプおよびインプットからの標的転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 | 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
Illumina RNA Prep with Enrichmentは高速ワークフローを実現します
オンビーズタグメンテーションと90分間のハイブリダイゼーションの手順を組み合わせることで、TruSeq RNA Exomeと比較して少ない手順でより迅速なワークフローを実現します。
ローインプットサンプルからの高品質データ
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、Universal Human Reference（UHR）からトータルRNAインプット量10 ngと100 ngの間で高いデータ整合性を実現します。
低インプットサンプルからのBCR-ABL1遺伝子融合の検出
Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを使用してK-562細胞株のRNA 10 ngから調製したライブラリーでは、BCR-ABL1遺伝子融合の検出に成功しました。上のアライメントトラックはすべてのリードを示し、下のトラックはBCR-ABL1融合遺伝子をサポートするリードのみを示しています。
Illumina RNA Prep with Enrichmentによるコーディング領域のカバレッジ
Illumina RNA Prep with EnrichmentとIllumina Exome Panelを用いて、10 ng UHR RNAと20 ng FFPE RNAから調製したライブラリーは、生成されたデータの85%以上がコーディング転写産物およびUTRにアラインされたことを示しています。比較のために、TruSeq RNA Exomeライブラリーのデータを示します。
低インプットサンプルおよびFFPEサンプルからの遺伝子融合検出
K-562BCR-ABL11およびTPM3-NTRK1遺伝子融合の100%コール率。 DV200 DV200
| 融合遺伝子（融合前） | RIN | RNAインプット | 検出 |
| BCR-ABL 1 （K-562） | 7.4 | 10 ng | 6/6レプリケート（100%） |
| TPM3-NTRK1 （大腸がん） | 2.5 | 20 ng | 6/6レプリケート（100%） |
リソース
Illumina RNA Prep with Enrichment: Introduction
RNA Sequencing Part I: Introduction to Illumina RNA library preparation workflows
RNA Sequencing Part II: Best practices for Illumina RNA Prep protocols
Advancements in translational biomarker identification from cell-free RNA
ライブラリー調製 (2)
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040536
16のライブラリー（16、1プレックスエンリッチメント反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)
20040537
96ライブラリー（32、3プレックスエンリッチメント反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
パネル (4)
Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only
20020183
イルミナDNA Prep with Enrichmentとペアで8回の濃縮反応、TruSeq RNA Exomeとペアで12回の反応、イルミナRNA prep with enrichmentとペアで32回の反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Respiratory Virus Oligos Panel V2
20044311
イルミナRNA Prep with Enrichment（96サンプル）キットと組み合わせると、32の3プレックス濃縮反応に十分です。ライブラリー調製およびエンリッチメントキットとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Viral Surveillance Panel, RUO 96 Rxns
20088154
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットと組み合わせた場合、32、3プレックスのエンリッチメント反応に十分なウイルスサーベイランスパネルが含まれます。ライブラリー調製およびエンリッチメントキットとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns
20088155
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットとペアにすると、32、3プレックスの濃縮反応に十分なウイルスサーベイランスパネルが含まれます。ライブラリー調製およびエンリッチメントキットとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
Illumina RNA Library Prep with Enrichment Training
20044763
アクセサリー製品 (2)
Illumina RNA Fast Hyb Enrichment (16 Samples)
20040540
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットの高速ハイブリダイゼーションエンリッチメント試薬を含み、16回の1プレックスエンリッチメント反応に対応します。推奨されるものとは異なるプレキシティで、お客様による処理をサポートします。濃縮前の試薬は含まれません。エンリッチメントによる完全な調製については、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットをご注文ください。
List Price:
Discounts:
Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040542
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットの16ライブラリー用のプリエンリッチメントモジュールが含まれています。推奨されるものとは異なるプレキシティで、お客様による処理をサポートします。濃縮試薬および精製ビーズは含まれません。濃縮による完全な調製には、Illumina RNA Prep with Enrichmentキットをご注文ください。
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
イルミナでは、陽性対照サンプルとしてAgilent Technologies Universal Human Reference RNA（UHR）（カタログ番号740000）の使用を推奨しています。
Illumina Exome Panel、Respiratory Virus Oligos Panel V2、Viral Surveillance Panel、Pan-Coronavirus Panelは、Illumina RNA Prep and Enrichmentキットと共に使用できます。
eBLTLは、1回の迅速な反応ステップでアダプタータグシーケンスを断片化し、追加することでcDNAにタグを付ける濃縮ビーズ結合トランスポソームです。
16サンプルキットは1プレックスのワークフローを可能にし、96サンプルキットは3プレックスのワークフローを可能にします。いずれかのワークフローにアクセサリー製品を追加することで、推奨されるものとは異なるプレキシティで処理できます。
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MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
高感度で包括的な呼吸器病原体の同定と抗菌剤耐性に関する洞察を提供するライブラリー調製および濃縮キット。
Viral Surveillance Panel
SARS-CoV-2、インフルエンザ、ポリオを含む66種類のウイルスの全ゲノムシーケンスと特性評価（ターゲット濃縮機能付き）。
NextSeq 1000/2000 Reagents
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
Illumina UD Indexes
ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
90分間のワークフローで、DNAインプットの必要性が低く、小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAシーケンス用のDNAライブラリーを調製できます。
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