Infinium Global Screening Array-24 Kit

集団遺伝学、ファーマコゲノミクス研究、プレシジョンメディシン研究のためのスケーラブルで費用対効果の高いソリューションを提供するジェノタイピングアレイ。

1週間に約5,760サンプル

サンプルスループット

アレイあたり24サンプル

サンプル数

654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量: 最大100,000。 

マーカー数

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概要

Infinium Global Screening Array-24 BeadChipは、集団規模の遺伝子研究のための、高度で拡張性があり、費用対効果の高いソリューションです。

主な特長

  • 26,1000のゲノムプロジェクト集団すべてにおいて> 1%の高いインピュテーション精度のために選択されたマルチ民族ゲノムワイドコンテンツ

  • 集団規模の研究のための3日間のワークフローで、週あたり数百から数千のサンプルのハイスループット処理が可能

  • 臨床研究アプリケーションには、疾患リスクプロファイリング研究、ファーマコゲノミクス研究、ウェルネス特性評価、複雑な疾患発見が含まれます

最適化されたグローバルコンテンツ

v3.0の臨床研究コンテンツには、確立された疾患関連、関連するファーマコゲノミクスマーカー、ClinVar、NHGRI、PharmGKB、およびExACデータベースから派生したキュレーションされたエクソンコンテンツを持つバリアントが含まれます。

幅広く採用

グローバルスクリーニングアレイの1,500万を超えるサンプルが、研究者、医療ネットワーク、消費者ゲノミクス企業、およびゲノムサービスプロバイダーから注文されています。

幅広いアプリケーション

世界中のプレシジョンメディシン研究イニシアチブは、Global Screening Arrayを使用して、疾患リスクの研究、サンプルの層別化、およびさまざまな臨床アプリケーションにわたる参加の奨励を行っています。


仕様


必要な製品

一度に実行するサンプル数に合ったキットサイズを選択します。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。

DesignStudio Microarray Assay Designer を使用してコンテンツをカスタマイズするか、またはコンソーシアムブースターとして利用可能なアドオンコンテンツのリストから選択できます。ブースターアドオンコンテンツが利用可能です:

  • マルチ疾患(~50,000 SNP)

  • 一般的な精神疾患(約30,000のSNP)

  • 消費者直送のウェルネスとライフスタイル(約28,000 SNP)

  • 腫瘍学(~90,000 SNP) 

在庫状況と価格については、担当営業にご確認ください。

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アプリケーション

Infinium Global Screening Array-24は、集団規模の遺伝子研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究のための強力で費用対効果の高いBeadChipです。幅広い疾患をカバーし、疾患関連の検証、リスクプロファイリング、先制的なスクリーニング研究、ファーマコゲノミクス研究を可能にします。

ワークフローの例

1
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Infinium Global Screening Array-24 Kit

2
アレイの処理とスキャン
3

関連するアプリケーションとメソッド

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Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium Asian Screening Array-24 Kit Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24
Assay type Infinium HTS Infinium LCG Infinium HTS
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Instruments iScan System iScan System iScan System iScan System
Method Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array High-Throughput Genotyping Array, Cytogenomic Array
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA
Specialized sample types Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood, FFPE Tissue Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva
Species category Human Human Human Human
Technology Microarray Microarray Microarray Microarray
Variant class Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA gDNA 200 ng 200 ng DNA
サンプルスループット 1週間に約5,760サンプル 1週間に約1,728サンプル

1週間に約2,304サンプル(iScanシステム1台、AutoLoader1台、Tecanロボット2台、週5日勤務を想定) 

サンプル数 アレイあたり24サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり24サンプル アレイあたり24サンプル
マーカー数

654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量: 最大100,000。 

1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量:最大175,000。

固定マーカー:約660,000、カスタムマーカーアドオン容量最大50,000
説明

Infinium Global Screening Array-24 Kitは、最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツ、キュレーションされた臨床研究バリアント、およびQCマーカーを組み合わせることで、集団規模の遺伝学、トランスレーショナル研究、バリアントスクリーニング研究、プレシジョンメディシン研究を可能にする経済的な次世代ジェノタイピングアレイです。

8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。

東アジア母集団および東南アジア母集団における集団規模の遺伝学的研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究に、高価値でスケーラブル、かつ費用対効果の高いソリューションを提供する先進的なジェノタイピングアレイ。 

24サンプルのInfinium Global Screening Array with Cytogenetics-24は、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子をターゲットとしています。BeadChipには約70万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能2.5 Mbを提供します。

選択ツール:

Infinium Global Screening Arrayの内容

内側のパイは、ゲノムワイドカバレッジ、臨床研究、品質管理(QC)のために選択されたアレイの割合を示しています。外輪は、1kGPに存在する固有のバリアントの加重リファレンスグローバルアリル頻度を示します。1 1kGPにないバリアントにはラベルが付けられます。カウントは、固有のバリアントを表します。

グローバルスクリーニングアレイの臨床研究コンテンツ

コンテンツは、科学的に認知されたデータベースから専門的に選択され、臨床研究アプリケーションのための非常に有益なアレイを作成しました。バリアント数は変更される場合があります。

グローバルスクリーニングアレイにおける幅広いファーマコゲノミクスコンテンツ

CPICガイドラインとPharmGKBデータベースに基づいて選択。2 PGx公開データベースバリアント、PharmGKB、PharmVar、CPICに注釈付きバリアント。ゲノムワイドPGxカバレッジには、ターゲットインピュテーションタグSNPおよびCPICレベルA CNVタグを含む拡張ADME遺伝子またはCPICレベルA遺伝子に位置するマーカーが含まれます。

グローバルスクリーニングアレイでカバーされる幅広い疾患カテゴリー

Global Diversity Array臨床研究コンテンツは、NHGRIデータベースに基づく幅広い疾患カテゴリーにわたるマーカーを特徴としています。

(A)ClinVar American College of Medical Genetics(ACMG)アノテーションに従って、病理分類の範囲別にソートされたバリアント。

(B)ClinVarデータベース内のカテゴリー別のGlobal Diversity Array臨床研究コンテンツ。バリアントカウントは変更される場合があります。 

リソース

サムネール

費用対効果の高いハイスループットInfiniumマイクロアレイによって実現される集団規模のアプリケーションについて学びます。

固定コンテンツ (3)

Infinium Global Screening Array-24 v3.0 Kit (48 Samples)

20030770

Infinium Global Screening Array-24 v3.0は、高度に最適化されたユニバーサルなゲノムワイドバックボーン、専門的に選択された臨床研究バリアント、サンプル追跡コンテンツを組み合わせ、集団規模のゲノミクスとスクリーニングのための非常に経済的なアレイを作成します。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Screening Array-24 v3.0 Kit (288 Samples)

20030771

Infinium Global Screening Array-24 v3.0は、高度に最適化されたユニバーサルなゲノムワイドバックボーン、専門的に選択された臨床研究バリアント、サンプル追跡コンテンツを組み合わせ、集団規模のゲノミクスとスクリーニングのための非常に経済的なアレイを作成します。各キットには、12個のBeadChipと、288個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Screening Array-24 v3.0 Kit (1152 Samples)

20030772

Infinium Global Screening Array-24 v3.0は、高度に最適化されたユニバーサルなゲノムワイドバックボーン、専門的に選択された臨床研究バリアント、サンプル追跡コンテンツを組み合わせ、集団規模のゲノミクスとスクリーニングのための非常に経済的なアレイを作成します。各キットには、48個のBeadChipと、1152個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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追加製品 (5)

Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (48 Samples)

20030773

Infinium Global Screening Array-24 v3.0は、専門的に選定された関連する臨床研究バリアントを、全世界の集団をカバーする堅牢なゲノムワイドバックボーンと組み合わせて、集団規模のゲノミクスとスクリーニングのための非常に経済的なアレイを作成します。各キットには、カスタマイズ可能なBeadChipが2つ含まれており、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が付属しています。

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Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (288 Samples)

20030774

Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (288 Samples)

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Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (1152 Samples)

20030775

Infinium Global Screening Array-24 v3.0は、専門的に選定された関連する臨床研究バリアントを、全世界の集団をカバーする堅牢なゲノムワイドバックボーンと組み合わせて、集団規模のゲノミクスとスクリーニングのための非常に経済的なアレイを作成します。各キットには、カスタマイズ可能な48個のBeadChipと、1152 DNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(4,608 Spl)

20034098

Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(4,608 Spl)

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Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(23,040 Spl)

20034099

Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(23,040 Spl)

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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よくある質問(FAQ)

Global Screening Arrayは、集団規模の遺伝学とスクリーニング研究のために最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツと臨床研究バリアントを組み合わせた次世代ジェノタイピングアレイです。

Infinium Global Screening Array-24 BeadChipのバージョン3は研究目的でのみ使用できます。ClinVar、CPIC、PharmGKBから派生した最新の関連臨床研究スクリーニングマーカーを活用しています。

Infinium Global Screening Arrayは、高度にスケーラブルなInfinium HTSフォーマットを使用しており、週に数百から数千のサンプルの柔軟なスループット処理を提供します。このフォーマットは、最小限のハンズオン時間で迅速な3日間のワークフローを提供します。

InfiniumアッセイはハイスループットSNP解析ケミストリーで、ジェノタイピングとメチル化研究のためのSNPの同定を可能にします。Infiniumマイクロアレイ製品は、集団規模のジェノタイピング、エピゲノムワイド関連研究、プレシジョンメディシン研究、その他のアプリケーションにおいて、多くの主要な機関で採用されています。 イルミナマイクロアレイテクノロジーの詳細はこちら。またはマイクロアレイキットをご覧ください。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

参考文献
  1. 1000ゲノムプロジェクト。http://www.1000genomes.org。2020年5月20日にアクセス。
  2. PharmGKB、ファーマコゲノミクス知識ベース。www.pharmgkb.org. 2020年5月20日にアクセス。

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