The Possibilites Are
Limitless
RNAハイブリッドキャプチャーにより、融合パートナーに依存せず融合を包括的に検出
ゲノム解析は、新規パートナーが関与する新たな発がん性融合事象を明らかにし続けます。そのような融合事象はさまざまな種類のがんでみられます。1 融合事象の複雑性の高まりと関連するバイオマーカーの増加に伴い、これからの腫瘍プロファイリングでは、融合パートナーに依存せずにすべての融合を検出する能力が必要になります。この能力を実現する唯一の方法が、RNAベースのハイブリッドキャプチャー法です。
多種類の腫瘍において、遺伝子融合の発生を促します
これまでに33種類のがんで20,000以上の遺伝子融合が発見されており、発がん性融合がほとんどのがんと関連していることが分かっています。2関連する融合のうち約35%がキナーゼ融合です。1
キナーゼ融合でこれまでにパートナーが判明しているのはわずか50%です。3
既知の融合も新規の融合も、治療上有用かつ治療研究にとって重要なターゲットとなる可能性があるため3,4、融合パートナーに依存しない検出法を使用することが不可欠です。
必要なのは融合パートナーを特定できるパネルであり、それはハイブリッドキャプチャーを用いたものである必要があります。融合事象だけではなく融合パートナーを検出することが非常に重要です。
Sabine Merkelbach-Bruse, PhD
Institute of Pathology, University Hospital of Cologne
遺伝子融合を見ると、ALK、RET、RAS、NTRK、FGFRなど、臨床医にとって重要な遺伝子融合が増え続けていることがわかります。NGSアプローチを用いて試験を実施すれば、1回の反応ですべて調べることができ、追加の組織が不要になります。
Marjolijn Ligtenberg, PhD
Laboratory of Tumor Genetics, Radboud university medical center
新しい包括的パネルの開発では、解析を統合できることが非常に重要です。新しい融合を用いた非常に優れた革新的な治療が多数市場に登場していますが、こうした新しい融合を検出する必要があります。
Ludovic Lacroix
Department of Medical Biology and Pathology,
Institut de Cancérologie Gustave Roussy
NTRK融合遺伝子腫瘍は標的とすることができ、アクショナブルです
新しいTRK阻害剤は、融合パートナーにかかわらず、進行性固形腫瘍においてNTRK融合を標的とするためのものです。4
標的となるキナーゼ融合の100%で、融合パートナーに関わらず、チロシンキナーゼ阻害剤に対する効果が確認されています。5
他のがん融合と同じく、NTRKの新しいパートナーは頻繁に確認されており、絶えず解析の複雑さがつきまといます。NTRK融合のパートナーは多様で、すでに80もの既知のパートナーが特定されており、融合検出はきわめて難しい挑戦です。6 すべてのがん種に対して治療における有用性があるため、既知か新規かに関わらずこれらの融合を検出することが非常に重要です。
すべてのNGS融合検出アッセイが同じというわけではありません。
アンプリコンアッセイは未知パートナーの融合を検出するようにはデザインされていないため、新規融合や未知のパートナーとの融合は特定されない可能性があり、追加の確認試験を行わない限り完全に解明することはできません。
NTRK融合パートナーの70%は、市販のアンプリコンアッセイでは見落とされてしまいます6-8
RNAハイブリッドキャプチャーNGSでのみ、融合パートナーに依存せずに、1回のアッセイで新規融合事象を検出できます。9この動画では、融合検出のさまざまな方法とすべてのアッセイが同じではない理由が説明されています。
RNAハイブリッドキャプチャー法は包括的な融合パートナー非依存的検出を実現します
すべてのNGS包括的ゲノムプロファイリングアッセイで未知パートナーを持つ融合を検出できるわけではありません。
RNAハイブリッドキャプチャーNGSケミストリーは、既知と未知の両方の遺伝子変化の特定に最適です。特に他の方法では検出されない可能性のある未知パートナーを持つ融合の特定に効果を発揮します。9
本ウェビナーでは、あらゆるがんにおける融合の役割と包括的検出の重要性について理解を深めていただけます。
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References
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- Hu X, Wang Q, Tang M, et al.TumorFusions: an integrative resource for cancer-associated transcript fusions.Nucleic Acids Res.2018;46:D1144-D1149.
- Kummar S. TRK Inhibition: A New Tumor-Agnostic Treatment Strategy.Target Oncol.2018;13(5):545-556.
- Vitravki [package insert].Stamford, CT: Loxo Oncology, Inc; November 2018.
- Medves S. Tyrosine kinase gene fusions in cancer: translating mechanisms into targeted therapies.J Cell Mol Med.2012;6(2):237–248.
- Hsiao SJ, Zehir A, Sireci AN, Aisner DL.Detection of tumor NTRK gene fusions to identify patients who may benefit from TRK inhibitor therapy.J Mol Diagn.2019. doi: 10.1016/j.jmoldx.2019.03.008.
- OncomineTM Focus Assay, AmpliSeqTM Library page.https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A35957.2019年2月14日にアクセス。
- St. James’s Hospital, Cancer Molecular Diagnostics Solid Tumour Service User Guide, http://www.stjames.ie/Departments/DepartmentsA-Z/C/CancerMolecularDiagnosticsLaboratory/DepartmentinDepth/User%20handbook%20v2.pdf.2019年2月14日にアクセス。
- Cheng DT, Mitchell TN, Zehir A, et al.Memorial Sloan Kettering-Integrated Mutation Proling of Actionable Cancer Targets (MSK-IMPACT): A hybridization capture-based next-generation sequencing clinical assay for solid tumor molecular oncology.J Mol Diagn.2015;17(3):251-264.