cDNA合成とアダプタータグ付けをひとつの工程にまとめた、RNAエクソーム解析のための迅速でシンプルなライブラリー調製ワークフロー。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、イルミナのポートフォリオの中でも最も迅速かつシンプルなRNA-Seqエクソームライブラリー調製ソリューションです。cDNA合成とオンビーズタグメンテーションを組み合わせた30分間のシングルチューブ反応を採用し、効率化を実現しました。迅速なワークフローにより、低インプットまたは分解したRNAサンプルに対応し、高精度なターゲットデータを提供します。
濃縮を含むシンプルなワークフローにより、ハンズオンタイム1.5時間未満、合計では最短6.5時間で、シーケンス可能なエクソーム濃縮RNAライブラリーを生成します。
包括的な最新のTwist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panelと90分間のハイブリダイゼーションにより、コーディングトランスクリプトームを重点的にカバーします。
わずか1 ngの高品質RNAまたは20 ngのFFPE* RNAから再現性の高い結果を取得し、優れたターゲットカバレッジを実現します。
*FFPE：ホルマリン固定パラフィン包埋サンプル。
| アッセイ時間 | 6.5時間 |
|---|---|
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| Description | A fast and easy workflow for RNA exome analysis |
| ハンズオンタイム | < 1.5時間 |
| Input quantity | 1–1000 ng RNA or 20–1000 ng FFPE RNA |
| システム | NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100 Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソームタグメンテーション、ハイブリッドキャプチャエンリッチメント |
| 手法 | エクソームシーケンス, mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| 核酸の種類 | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 転写産物バリアント, 1塩基変異（SNV） |
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentキットには、Illumina Rapid RNA Prepキット、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel、ハイブリダイゼーション試薬、およびIllumina Purification Beadsが含まれます。インデックスセットは別売りです。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、ハンズオンタイム1.5時間未満、全体では最短6.5時間で、全トランスクリプトーム解析用のシーケンス可能なRNA-Seqライブラリーの調製を完了します。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| MiSeq i100 Plusシステム | フローセルあたりのサンプル数：1サンプルあたり25Mクラスター、25M：1、50M：2、100M：4 |
2 × 100 bp |
| NextSeq 2000システム | フローセルあたりのサンプル数：1サンプルあたり25Mクラスター、P1：4、P2：16、P3：48、P4：72 |
2 × 100 bp |
| NovaSeq Xシステム | フローセルあたりのサンプル数：1サンプルあたり25Mクラスター、1.5B：60（30/レーン）、5B：200（25/レーン）、10B：400（50/レーン）、25B：1,000（125/レーン） |
2 × 100 bp |
RNAエクソームの配列特異的なキャプチャーにより、困難なサンプルから高品質のRNA-Seqライブラリーを生成し、費用対効果の高いハイスループットのトランスクリプトーム解析を実現します。
劣化したFFPE組織やその他の低品質サンプルから高品質の結果を得るFFPE RNAシーケンスソリューションを見つけてください。
RNAシーケンス（RNA-Seq）により、がんの遺伝子発現とトランスクリプトームの変化を検出し、新しいがん遺伝子転写物を同定します。
| Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 6.5時間 | <9時間 | 約2日 |
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | |
| Description | A fast and easy workflow for RNA exome analysis | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織切片やその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプやインプットから、スプライスバリアント、遺伝子融合、および小型ヌクレオチドバリアントのターゲット転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 |
| ハンズオンタイム | < 1.5時間 | <2時間 | 約11時間 |
| Input quantity | 1–1000 ng RNA or 20–1000 ng FFPE RNA | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA、最大1000 ngの高品質RNA | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA |
| システム | NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100 Plusシステム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソームタグメンテーション、ハイブリッドキャプチャエンリッチメント | ビーズ結合トランスポソーム | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 |
| 手法 | エクソームシーケンス, mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | エクソームシーケンス, mRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル |
| 核酸の種類 | RNA | RNA | RNA |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル, FFPE組織 | 少量インプットサンプル, FFPE組織 | 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | Any species, ヒト, ウイルス | ヒト |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし | ストランド情報なし | ストランド情報あり |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 転写産物バリアント, 1塩基変異（SNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, 転写産物バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel） | 1塩基変異多型（SNP）, 新規点転写産物, 転写産物バリアント |
コーディング転写産物の効率的な濃縮
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentのマッピングメトリクスは、1 ng、10 ng、100 ngのUniversal Human Reference（UHR）RNAと、各25 ngのFFPE RNAリファレンスおよび融合RNAミックスの市販サンプルという幅広いインプット量において、98%を超えるオンターゲットリードを示しています。
長短のハイブリダイゼーション時間で、同等の濃縮メトリクスを生成
90分（オレンジ）または12時間（青）のハイブリダイゼーション時間における、幅広いインプット量（Universal Human Reference［UHR］RNA：1 ng、10 ng、100 ng）にわたる、Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentのアライメントされたリードの割合、パディングしたユニークリード濃縮、断片長中央値、重複率および平均ターゲットカバレッジを示しています。DRAGEN Enrichment v4.3.13によって生成されたPicard濃縮メトリクス。
RNAインプットの高低を問わず高い再現性
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、1 ngと100 ngのuniversal human reference（UHR）RNAインプット量の間で正規化された遺伝子カウントの相関が高いことを示しています（R2 = 0.99）。DRAGEN RNA v4.4により生成Transcripts per million（TPM）。
DNA抽出、断片化、ライブラリー調製、ライブラリーノーマライゼーションを効率的なワークフローに統合した新しいケミストリー、オンビーズタグメンテーションの詳細をご覧ください。幅広いインプット量に対応し、多様なサンプルタイプに柔軟に適用できます。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples)
20158825
Includes reagents for preparing and enriching 96 samples of Rapid RNA libraries (32 hybridization reactions with 3 libraries each), with Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel, and Illumina Purification Beads. UD Indexes sold separately.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルの標識に十分な96、10 bpインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Beads 30 ml
20119944
Illumina Purification Beads 30 ml
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器が1個含まれています。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器4個が含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
ステップ1―Illumina Rapid RNA Prepが、30分間のシングルチューブ反応でcDNA合成およびオンビーズタグメンテーションを実施
ステップ2―インデックスPCRおよびクリーンアップ
ステップ3―90分のハイブリダイゼーションでRNAエクソームを濃縮
ステップ4―PCR増幅とクリーンアップ
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、96サンプル構成で利用可能です。これらのキットは、3プレックス濃縮の2反応分で設計されています。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 EnrichmentにはTwist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panelが含まれており、Illumina RNA Prep with Enrichmentと比較して総アッセイ時間が30%短縮されます。
MiSeq i100シリーズ用試薬は、使いやすいカートリッジと、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフロー セル構成を備えています。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
NovaSeq Xシリーズ用試薬キットには、試薬カートリッジ、バッファーカートリッジ、フローセル、Lyo インサート、プレロードバッファー、ライブラリーチューブストリップが含まれます。
幅広いシーケンスアプリケーションに対応するライブラリー調製を実現する、高速で統合されたワークフローです。
cDNA合成とアダプタータグ付けをワンステップにまとめた、コーディングトランスクリプトーム解析用の迅速かつシンプルなmRNAライブラリー調製ワークフロー
cDNA合成とアダプタータグ付けをひとつのステップにまとめた、カスタムエンリッチメントによる迅速でシンプルなRNA-Seqライブラリー調製ワークフロー。
cDNA合成とアダプタータグ付けをひとつの工程にまとめた、全トランスクリプトーム解析のための迅速でシンプルなトータルRNAライブラリー調製ワークフロー
小規模ゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAのシーケンス用DNAライブラリーを、低DNAインプットから90分で調整できるワークフローを提供します。
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
イルミナの製品およびサービスに関する情報、またはテクノロジーに関する質問は、こちらからお問い合わせください。
