装置上の自動データ解析
Local Run Managerは、ランの準備、稼働状況のモニタリング、シーケンスデータの解析、そして結果の表示を行う、装置に内蔵の統合ソリューションです。装置制御ソフトウェアと統合され、使いやすいタッチスクリーンインターフェースを備えたウェブブラウザから簡単にアクセスできます。
Local Run Managerは、装置上のデータ解析を自動的に実行します。さまざまなライブラリータイプ用に設計された解析手順を実行するために、さまざまなオプションソフトウェアモジュールが利用可能です。Local Run Managerは現在、以下の解析ソフトウェアモジュールに対応しています。
互換性のあるライブラリー調製キットを探す
ほとんどのLocal Run Manager解析モジュールでは、特定のラン用のライブラリー調製キットを選択するよう求められます。各Local Run Managerソフトウェア解析モジュールと互換性のあるキットをご確認ください。
利用可能な解析モジュール
TruSight Tumor 15解析モジュール
固形腫瘍に関連する15の遺伝子について、TruSightTumor 15アッセイを使用して調製されたサンプルについて、フィルターされたレポートを解析し、生成します。
アンプリコン解析モジュール
Illumina TruSeq Ampliconパネルのバリアント検出と合理化された解析を可能にします。
アンプリコンDS解析モジュール
イルミナTruSight Tumor 26とデュアルプール（デュアルストランド）TruSeq Custom Ampliconパネルの合理化された解析を可能にします。
DNAエンリッチメント解析モジュール
全ゲノムリファレンスに対してリードをアライメントし、特定の関心領域に対してバリアント解析を実行します。
小型RNA解析モジュール
リードと出力のヒットをアライメントします。オプションの新規前駆体発見とペアワイズ差次発現解析を実行します。
ターゲットRNA解析モジュール
TruSeq Targeted RNA Expression Kitを用いて調製したRNAサンプルを解析します。リードをアライメントし、相対発現を定量化します。
リシーケンス解析モジュール
リードをアライメントし、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスのためのバリアント解析を実行します。
FASTQ解析モジュールの生成
デマルチプレックスされたFASTQファイルを生成し、さらなる下流解析を可能にします。
テクニカルサポートのお知らせ
テクニカルサポートの掲示板には、一般的な手順の詳細とよくある質問への回答が記載されています。Local Run Managerの使用の詳細については、以下の資料を参照してください。
解析モジュールのダウンロードまたはサポート
特定の解析ソフトウェアモジュールをダウンロードするか、Local Run Managerテクニカルサポート情報にアクセスしてください。
Local Run ManagerモジュールのダウンロードLocal Run Managerサポートへのアクセス