次世代シーケンス（NGS）による環境DNA（eDNA）メタバーコーディングは、生物多様性の研究や生態系の変化をモニタリングするために急速に広がった手法です。生物が環境中に残したDNAを利用するeDNA分析では、生態系を壊すことなく存在している生物種の手がかりを見つけることができます。eDNAの潜在的なアプリケーションには、港湾モニタリング、生物多様性調査、バラスト水試験、土壌試験などがあります。