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1665年に細胞が発見されたのち、細胞は生物の構造と組織の基本単位で、生物は1つ以上の細胞で構成されると定義されています。
生物の生体組織は多種多様な細胞種によって構成されており、それぞれの細胞が独自の役割を果たしながら、最終的に生物全体として機能します。
それら細胞は、他の細胞やその微小環境などに影響されながら、どのような振る舞いを行うがが決まります。また、同じタイプの細胞のサブポピュレーションでも、時間経過に伴う確率的な変化により、他の細胞タイプと同様に互いに遺伝的に異種であることがよくあります。
このような生物の複雑さにより、組織や細胞のバルク分析を通じて細胞機能を理解するだけではなく、個々の細胞を個別に評価しながら全体像を把握することの重要性についての認識が高まってきています。
次世代シーケンシング(NGS)は、配列情報に関する予備知識がなくても新規遺伝子を検出することが可能で、希少な変異体および転写物を定量化するための高い感度と網羅的な解析を可能にするため、シングルセル解析において広く用いられています。
本資料では、NGSを用いたシングルセルシーケンスの各ステップにおける重要なポイントと、幅広い実験手法についての概略をご確認いただくことができます。

 

目次

  1. はじめに
  2. ステップ 1:組織調製
  3. ステップ 2:シングルセル単離およびライブラリー調製
  4. ステップ 3:シーケンス
  5. ステップ 4:データ解析、可視化、および解釈
  6. まとめ
  7. 用語集
  8. 参考文献

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