NextSeq 1000/2000 および NovaSeq Xシリーズシステムで採用されているXLEAP-SBS試薬シーケンスでは、青と緑の 2 色の蛍光物質とその蛍光シグナルを検出して、塩基を決定します（図1）。
シトシン（C）塩基は青と緑、アデニン（A）塩基は青のみ、チミン（T）塩基は緑シグナルのみで識別されます。グアニン（G）塩基には蛍光物質が付加されていません。
各サイクルで青と緑のシグナルがバランスよく出現するようにインデックスを組み合わせてください。

[図1] NextSeq 1000/2000およびNovaSeq XシリーズのXLEAP-SBSケミストリー

MiSeq i100シリーズシステムでも青と緑の蛍光を取得します。塩基の割り当てがNextSeq 1000/2000 XLEAP-SBSおよびNovaSeq Xシリーズシステムとは一部異なり、アデニン（A）塩基が青と緑、シトシン（C）塩基が青で識別されます（図2）。
インデックスシーケンスについては、NextSeq 1000/2000 XLEAP-SBSおよびNovaSeq Xシリーズシステムと同様に塩基の多様性を高める必要があります。

[図2] MiSeq i100シリーズのXLEAP-SBSケミストリー

Index Adapters Pooling Guideでは、各種イルミナインデックスキットについて、少数サンプル時のインデックスの組み合わせの推奨をご案内しています。
*注意：XLEAP-SBS試薬で推奨されるカラーバランス（インデックス組み合わせ）は、他のSBS試薬を使用する装置で推奨されるインデックスの組み合わせとは異なりますので、ご注意ください。

[例] Illumina DNA/RNA UD Indexesの場合

1. Nextera & Illumina Kitsを選択してください。
   
2. インデックスキットの種類をご選択ください。
   
3. [XLEAP-SBS Chemistry] Two-Plex Through Eight-Plex Pooling Strategiesを ご選択ください。
   *注意：[XLEAP-SBS Chemistry]と表記の無い項目は従来の標準SBS試薬を使用する場合の説明の為、こちらは参照しないでください。
   
4. 少数サンプル時の推奨のインデックス組み合わせをご確認ください。
   例えば画像のページのインデックス製品（Illumina DNA/RNA UD index）では、2または3サンプルの場合のインデックス組み合わせ例、4～8サンプルの場合には推奨されないインデックス組み合わせ例をご紹介しています。
   ＊注意：Index Plate CおよびDは、少数サンプルでのシーケンスラン用にデザインされておりません。
   

   *参考：Index Adapters Pooling GuideのSequencing Chemistry（Color Balance項目内）にイルミナ社システム毎のインデックス選択時の注意事項が記載されています。

   

Third Party社インデックス製品の推奨組み合わせは、基本的に販売元からの情報をご確認ください。また、XLEAP-SBS試薬で推奨されるカラーバランス（インデックス組合せ）は、他のSBS試薬を使用する装置で推奨されるインデックスの組合せとは異なりますのでご注意ください。

例として、10x Genomics社様から、シングルセルRNAライブラリーをXLEAP-SBS試薬でシーケンスする場合のインデックス組み合わせ例が下記にて公開されています。

• What index combinations should I select when sequencing low plex pools of 10x Genomics Libraries generated with the Dual Index TT or Dual Index TS plates? (10x Genomics社様ページリンク)
  
  その他、New England Biolabs社様のインデックスに関しては、少数サンプルラン時の蛍光バランスをチェックするためのページが用意されています。
• NEBNext Index Oligo Selector
  (New England Biolabs社様ページリンク)
  
  ＊すべて2025年5月現在の情報です。