アグリゲノム

海藻のサステイナブルな秘密のシーケンス

ブラジルのコンソーシアムが、地球上で最も古い生命の1つである食糧不安に対するソリューションを探しています

海藻のサステイナブルな秘密のシーケンス
Rodrigo Cano and Scott Fahrenkrug of the Brazilian Consortium for Phycogenomics, winner of the Illumina Agricultural Greater Good Initiative Award, with Natalie Fontenla
2023年1月19日

ニックネームが進むにつれて、海洋藻類は鎖の短い端を握りました。非公式な“藻”という言葉は、望ましくない害虫のように聞こえます。ビーチで乾いた塊として、または波の中のスリミーな驚きとしてのみ遭遇したことがあるなら、そのように思えるかもしれません。しかし、表面の下の部分を見ると、海藻は、すべての植物の10億年前の祖先、世界の酸素の半分の供給源、そして世界の食糧生産、微生物学、医学の未来において重要な役割を担う、まばゆい生物の多様性にかかっていることがわかります。

国連は、持続可能な開発目標の一環として海藻栽培を認めています。食品として、これはタンパク質、ビタミン、鉄の主要な供給源です。また、食品として栽培されない作物は、二酸化炭素や汚染物質の優れた吸収体となり、海洋の酸性化を減らし、温室効果ガスを捕獲することができます。カラギーナンや寒天など、そこから抽出された特定の化合物には、他の微生物の増殖培地からデザートのゼラチンに代わるビーガンまで、多くの科学的応用があります。しかし、ブラジルなど、海藻類のバイオマスが最も多い地域の中には、8,000キロメートルの海岸線がある地域もありますが、この可能性をまだ十分に活用できていない地域もあります。

ブラジルの水産養殖業界の成長能力は、関連する海藻、特にエルクホルンの苔、またはKappaphycus alvareziiからの遺伝子シーケンスデータが不足していることによって妨げられています。しかし、ブラジルフィコゲノミクスコンソーシアム(BCP)は、これを変更することを決定しています。 この非営利プロジェクトは、2021年にRío de JaneiroのSENAI CETIQTの研究者によって設立されました。 リオデジャネイロ連邦大学 サンパウロ州立大学 7つの大学や企業 また、バイオテクノロジー研究会社ForjazulのScott Fahrenkrugと、フィリピン大学海洋科学研究所のMichael Roledaとの共同研究でも進歩を遂げています。 K. alvareziiの農業が始まった場所

“フィコゲノミクスプロジェクトは私の心に特別な場所があります”と、SENAI CETIQTのビジネスアナリストであり、BCPのプロジェクトマネージャーであるRodrigo Cano氏は述べています。シーケンスデータから新しい栽培品種の開発、そして情報に基づいた管理戦略に至るまで、ブラジルで海藻の大半を生産する小規模の利害関係者に直接影響を与える明確な道筋がわかります。

今週サンディエゴで開催されたPlant and Animal Genome Conferenceで発表されたSENAI CETIQTは、イルミナのAgricultural Greater Good Initiative助成金の最新受賞者です。この助成金は、食糧安全保障と持続可能性の研究を支援するプロジェクトに2011年から毎年授与されています。この助成金により、BCPはK. alvareziiの高品質なゲノムシーケンスを生成し、公開することができます。イルミナのNextSeqシーケンサーを使用して、コンソーシアムは、同コンソーシアムやその他の海藻類のために何兆もの塩基対相当のトランスクリプトームデータを収集し、その生育方法や有用な生体分子の合成方法の秘訣を探ります。

K. alvareziiだけでもフィコゲノミクスのモデル生物であり、その生体刺激剤と炭素隔離メカニズムに関する洞察は、環境への取り組みを促進し、世界中の農家を支援することができます。Fahrenkrug氏は、“分子遺伝学的手法は、遺伝的多様性の発見と保護に利用でき、気候条件の変化に直面しても、海藻生産の持続可能性と回復力に貢献し、世界ブルーエコノミーのために炭素を修復するためのすでに膨大な能力を活用する戦略を可能にすることができる”と説明しています。

生命の木の中で最も古い枝の1つが、人類の未来の鍵です。次回、寿司を食べるときは、そのことを心に留めておいてください。

次回のイルミナ農業グレーターグッドイニシアチブの申請期間が始まりました。 詳細については、ここをクリックしてください

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