数千もの微生物種を同時にシーケンス

複雑なサンプル中に存在する微生物すべての全遺伝子を包括的に抽出

ショットガンメタゲノミクスシーケンス

ショットガンメタゲノミクスは、採取した複雑なサンプル中に存在する微生物すべての全遺伝子の包括的な標本抽出法です。この手法によって、研究者は、細菌の多様性を評価し、自然環境および様々な条件下における豊富な種を検出することができます。ショットガンメタゲノミクスはまた、研究室で培養できないか、研究するのが困難または不可能な微生物の研究を可能にします。

キャピラリーシーケンスまたはPCRをベースとするアプローチとは異なり、次世代シーケンサー(NGS)は、研究者が何千もの微生物を並列してシーケンスできるようにします。次世代シーケンサーは、1回のシーケンスで多くのサンプルを組み合わせ、サンプル当たりの高いシーケンスカバレッジが得られるため、微生物群において、他の手法では見逃されるか、コストが膨大になり同定できないような非常に少数の微生物の検出を可能にします。

メタゲノミクス研究で用いられる方法には、他に16S rRNAシーケンス があります。

こうした実験を行うには多くの手法がありますが、それらの手法はワークフローのステップごとに製品としてご提案することができます。

以下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。

Meta-G-Nome™ DNA単離キット

水、土壌および堆肥サンプル中の微生物から、フォスミドクローニングが即可能なメタゲノムDNAを単離。

QuickExtract細菌DNA抽出キット

グラム陽性菌およびグラム陰性菌からDNAを抽出する簡便な方法。

MasterAmp頬スワブキット

哺乳類の頬側(頬)細胞から採取したDNAの迅速な調製のための、使いやすいシングルチューブシステム。

水サンプルを対象としたメタゲノムDNA単離キット

このキットは、水サンプル中の培養が可能または不可能な微生物からメタゲノムDNAを直接単離するために開発されました。

Nextera XTサンプル調製キット

小さなゲノム(細菌、古細菌、ウイルス)、アンプリコンおよびプラスミドを対象とするシーケンス用ライブラリーで、ワークフローは90分以内(ハンズオンタイム15分)に終了します。

TruSeq DNA PCRフリーサンプル調製キット

全ゲノムシーケンスアプリケーションを対象としたシンプルで包括的なサンプル調製。 細菌などの小さなゲノムから全ヒトゲノムまで、多種多様な微生物をシーケンスできます。

MiSeqシステム

 

MiSeq v3試薬キット

最高出力15 Gbの使いやすいベンチトップ型シーケンサーおよび試薬

NextSeq 500

The NextSeq desktop sequencing system is the first and only desktop sequencer to offer exome, transcriptome, and whole-genome sequencing.

HiSeq 2500システム

 

HiSeq 2500 試薬キット

最高出力600 Gbのハイスループットのシーケンサーおよび試薬

MiSeq Reporter

各サンプルに関する品質およびカバレッジの情報のみならず、一次および二次解析データは、シンプルかつ直観的なグラフィック形式でご利用できます。 HiSeqまたはMiSeqの出力には、データ解釈用のfastqファイルが必要とされる点にご注意ください。

BaseSpace

BaseSpaceのファイルをダウンロードして共有します。

Met-BEETL

異種微生物群のショットガンDNAシーケンスを用いたハイスループット解析

メタゲノミクス解析サーバ(MG-Rast)

微生物群の定量的知見をシーケンスデータに基づいて提供する、メタゲノム自動解析プラットフォーム。

電子メールにて微生物ゲノムにおける最新のニュース、事例研究、アプリケーションなどの情報をご提供します。ぜひご登録ください。

Lungs, Germs and Metabolites: A Cystic Fibrosis Story
Lungs, Germs and Metabolites: A Cystic Fibrosis Story

Overview of Illumina next generation sequencing platforms and relevant applications and use cases for food pathogen testing.

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Metagenomic Analysis of Environmental Water Samples
環境水サンプルからのメタゲノム解析

NextSeq 500システムを使ったショットガンメタゲノムシーケンスで、貯水池における環境に対する微生物の反応を捉えることができます。

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Metagenomics Research Review
メタゲノミクス研究レビュー

微生物群をより十分に理解するために、シーケンスに関する論文をご覧ください。

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HiSeq and Shotgun Metagenomics
HiSeqとショットガンシーケンス

HiSeqシーケンサーは、ショットガンメタゲノムシーケンスのための理想的なシステムです。

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