複雑な環境サンプルにおける
微生物コミュニティをプロファイリング

環境メタゲノム

環境メタゲノミクスは、環境サンプル中のDNA解析を基にした、微生物群における生物の研究です。環境サンプルとしては、海底の熱水噴出孔から採取した水サンプル、または採掘中の鉱床のような人間が作った環境から採取した土壌サンプル中の微生物群のプロファイリングなどが挙げられます。環境メタゲノミクスの研究データは、農学的なマイクロバイオーム解析、生態学的な改善またはその他の生物学的調査のために用いられます。

Environmental Metagenomics

次世代シーケンサー(NGS)が登場する以前、一分野としての環境メタゲノミクスは、きわめて限られたものでした。次世代シーケンサーは、複雑なサンプルから微生物群全体のプロファイルを把握し、新しい微生物を発見し、変化する条件下にある微生物群の動的性質を調査する能力を研究者に提供します。

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16S rRNAメタゲノミクス

あるサンプルに存在する微生物を同定し比較するために使われる、16SリボゾーマルRNA遺伝子のシーケンス手法です。

ショットガンメタゲノミクス

ある特定の複雑な微生物サンプルにおける、全生物種および全遺伝子を対象とする包括的なサンプリングを可能にするDNAシーケンス手法です。

メタトランスクリプトミクス

複雑なサンプルにおいて全てのRNAを解析することで微生物集団を理解します。

全ゲノムシーケンスおよびde novoアセンブリ

既知微生物のゲノムフィニッシング、参照配列のない新規微生物のゲノム情報を決定します。

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H3MPプロジェクトからの講義

3つのH(house, hospital human)の相互影響に関する微生物学な意味を論じたJack Gilbert博士の講義をお聞きください。

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環境水サンプルからのメタゲノム解析

NextSeq 500システムを使ったショットガンメタゲノムシーケンスで、貯水池における環境に対する微生物の反応を捉えることができます。

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de novo ゲノムアセンブリー

イルミナの新しいアルゴリズム的アプローチおよびデータ解析ソリューションは、迅速で正確な

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