複雑な環境サンプルにおける
微生物コミュニティをプロファイリング

環境メタゲノム

環境メタゲノミクスは、環境サンプル中のDNA解析を基にした、微生物群における生物の研究です。環境サンプルとしては、海底の熱水噴出孔から採取した水サンプル、または採掘中の鉱床のような人間が作った環境から採取した土壌サンプル中の微生物群のプロファイリングなどが挙げられます。環境メタゲノミクスの研究データは、農学的なマイクロバイオーム解析、生態学的な改善またはその他の生物学的調査のために用いられます。


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Environmental Metagenomics

次世代シーケンサー(NGS)が登場する以前、一分野としての環境メタゲノミクスは、きわめて限られたものでした。次世代シーケンサーは、複雑なサンプルから微生物群全体のプロファイルを把握し、新しい微生物を発見し、変化する条件下にある微生物群の動的性質を調査する能力を研究者に提供します。

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16S rRNAメタゲノミクス

あるサンプルに存在する微生物を同定し比較するために使われる、16SリボゾーマルRNA遺伝子のシーケンス手法です。

ショットガンメタゲノミクス

ある特定の複雑な微生物サンプルにおける、全生物種および全遺伝子を対象とする包括的なサンプリングを可能にするDNAシーケンス手法です。

メタトランスクリプトミクス

複雑なサンプルにおいて全てのRNAを解析することで微生物集団を理解します。

全ゲノムシーケンスおよびde novoアセンブリ

既知微生物のゲノムフィニッシング、参照配列のない新規微生物のゲノム情報を決定します。

MiSeqシステム

16SrRNA v3-v4領域をターゲットにしたアンプリコン解析から、単離微生物のDenovoまで幅広い微生物解析アプリケーションに対応。これまで微生物関連研究において実績No.1!

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16SrRNA 16SrRNA遺伝子v4領域や、参照配列が存在する微生物のResequenceに対応。初期投資費用を抑えて微生物解析を始めたい方に最適。

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環境水サンプルからのメタゲノム解析
環境水サンプルからのメタゲノム解析

NextSeq 500システムを使ったショットガンメタゲノムシーケンスで、貯水池における環境に対する微生物の反応を捉えることができます。

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メタゲノミクス研究レビュー
メタゲノミクス研究レビュー

微生物群をより十分に理解するために、シーケンスに関する論文をご覧ください。

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微生物ゲノム解析アプリケーションガイド
微生物ゲノム解析アプリケーションガイド

微生物解析にNGSを利用する最大の利点は、培養できない生物など予備知識が得られない場合でもゲノム情報を取得し、1 塩基の解像度で解析できることです。NGSでどのような研究が拡がるか、このガイドでご確認ください。

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