AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2

がんとの関連性が確認されている50個の遺伝子のホットスポットを調べる標的研究パネル。 続きを読む...
製品の選択
どのような製品が必要ですか?
パネル

AmpliSeq作られています。Illumina®用がんホットスポットパネルv2

20019161

価格
 
 

ライブラリー調製

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数24回)

20019101

価格
 
 

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数96回)

20019102

価格
 
 

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数384回)

20019103

価格
 
 

インデックスアダプター

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®(24インデックス、24サンプル)

20019104

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®(384インデックス、384サンプル)

20031676

価格
 
 
アクセサリー製品

AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

価格
 
 

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

価格
 
 

AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

価格
 
 

製品のハイライト

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer(COSMIC)1データベースで特定されたように、がんとの関連が知られている50の遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を研究するためのターゲットリシーケンスアッセイです。主な特徴には以下があります:

関連する遺伝子コンテンツ
  • 50のがん遺伝子と腫瘍抑制遺伝子から約2800のCOSMIC変異をターゲット
高速かつ合理的なワークフロー
  • わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから、1日でシーケンス可能なライブラリーを調製
正確なデータ
  • ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、5%バリアントアリル頻度までの体細胞変異を検出

Cancer HotSpot Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction(PCR)ベースのライブラリー調製、イルミナのSequencing by Synthesis(SBS)次世代シーケンス(NGS)テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。

このパネルにより、肺、結腸、乳房、卵巣、黒色腫、前立腺など、複数のがんタイプ内で高感度なバリアント検出が可能になります。すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。

AmpliSeq for Illuminaの詳細はこちら

よく一緒に購入される製品

仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
iSeq 100 System ランあたり16サンプル(最低カバレッジ500×を想定) 2 × 150 bp
MiniSeq System ランあたりのサンプル数:中出力:32、高出力:96(最低カバレッジ500×を想定) 2 × 150 bp
MiSeq System ランごとのサンプル(試薬キットバージョン別):v2 nano:4、v2 micro:16、v2:60、v3:96(最低カバレッジ500×を想定) 2 × 150 bp

製品比較

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 AmpliSeq for Illumina Focus Panel AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 TruSight Tumor 15
がんの種類 固形腫瘍 固形腫瘍 固形腫瘍 固形腫瘍
アッセイ時間 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)
マルチプレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ 96のデュアルインデックスの組み合わせ 96のデュアルインデックスの組み合わせ
方法 アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス
核酸タイプ DNA DNA, RNA DNA, RNA DNA
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト ヒト
説明 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 固形腫瘍がんに関連する52の遺伝子の体細胞解析研究。

関連製品

参考文献
  1. Kingsmore S. Catalogue of Somatic Mutations in Cancer – ホームページ。http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic. 2017年10月25日にアクセス。