AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。

6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)

アッセイ時間

<1.5時間

ハンズオンタイム

1~100 ng、プールあたり10 ngを推奨

インプット量

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概要

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelは、腫瘍と免疫系の相互作用に関与する395の遺伝子のがんバイオマーカーの発現を定量化するためのターゲットリシーケンス研究アッセイです。

パネルの特徴

  • 関連する遺伝子コンテンツ - 免疫療法の奏功を示す395のがんバイオマーカーのターゲット発現

  • 迅速かつ合理化されたワークフロー - わずか1 ngの高品質RNAまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)RNAのインプットサンプルから、1日でシーケンス対応ライブラリーを調製

  • 正確なデータ - 腫瘍と免疫の相互作用に関与する遺伝子の発現を検出

Immune Response Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づくライブラリー調製、イルミナのSequence by Synthesis(SBS)次世代シーケンサー(NGS)テクノロジー、および自動化解析を含む、RNAからアノテーションされたバリアントまでを統合したソリューションの一部です。

このパネルは、さまざまな白血球サブセット、抗原提示、チェックポイントパスウェイ、腫瘍進行に関連するバイオマーカーを検出します。このパネルはそのまますぐに使い始めることができるため、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。

仕様

必要な製品

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panelのワークフローには、Immune Response Panel、Library PLUSキット、インデックスアダプターが必要です。また、トータルRNAをcDNAに変換するには、cDNA合成キットが必要です。

/

アプリケーション

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel

プロジェクトの推奨事項

装置 推奨サンプル数 リード長
iSeq 100 System

1ランあたり4サンプル(1サンプルあたり100万リードを想定)

2 x 150 bp

MiniSeqシステム

1ランあたりのサンプル数:中出力:8、高出力:24(1サンプルあたり100万リードを想定)

2 x 150 bp

MiSeq System

1ランあたりのサンプル数(試薬キットバージョン別):v2 micro:4、v2:15、v3:24(サンプルあたり100万リードを想定)

2 x 150 bp

関連するアプリケーションと手法

パネル (1)

AmpliSeq™ Immune Response Panel for Illumina®

20019169

AmpliSeq Library PLUS for Illuminaと組み合わせると、24反応に十分です。ライブラリー調製、インデックスアダプター、アクセサリー製品は別売りです。

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ライブラリー調製 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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アクセサリー製品 (3)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

AmpliSeq for Illumina RNA Panels(AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど)で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります(例:AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応)。

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。

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NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

TruSight Oncology 500 v2

FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー(TMB、MSI、HRD)を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。

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