最大1200の関心ゲノムターゲットのシーケンスに最適化されたターゲット化されたカスタムRNA研究パネル。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panelsを使用して、1回のアッセイで12～1200の遺伝子ターゲットの遺伝子発現を測定します。ウェブベースのアッセイデザインソフトウェアツールであるDesignStudio Softwareを使用して、20,000を超えるヒトRefSeq遺伝子のメニューからカスタムターゲットパネルを簡単にデザインできます。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）に基づくライブラリー調製、イルミナのSequence by Synthesis（SBS）ケミストリー、次世代シーケンサー（NGS）技術、および自動化解析を含む統合されたワークフローの一部です。
| Method | Targeted RNA Sequencing, Custom Sequencing, Amplicon Sequencing |
|---|---|
| Specialized sample types | Blood, FFPE Tissue |
| Variant class | Transcript variants |
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間 |
| アンプリコン数 | 異なる |
| インプット量 | 1 ng |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 |
| マルチプレックス | 最大384プレックス |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 |
| 核酸の種類 | RNA |
| 生物種 | ヒト |
AmpliSeq for Illuminaのライブラリー調製ワークフローには、パネル、ライブラリー調製試薬（Library Plus）およびインデックスが必要です。cDNA合成およびサンプル同定用のアクセサリー製品もご用意しております。
AmpliSeq for Illumina RNA Panelsを使って作業する際は、トータルRNAをcDNAに変換する時にAmpliSeq cDNA Synthesis for Illuminaが必要となります。
AmpliSeq Library Equalizer for Illuminaはオプションですが、AmpliSeq for Illuminaライブラリー調製法を使用する際にライブラリーをノーマライズするための使いやすいソリューションとして推奨されています。
AmpliSeq ERCC RNA Spike-In Mix for Illuminaは、External RNA Controls Consortium（ERCC）が開発した一連の外部RNAコントロールです。コントロールは、標識されていないポリアデニル化転写産物のセットで構成されており、AmpliSeq for Illuminaアッセイとトランスクリプトームパネルを併用して差次的遺伝子発現を定量化することができます。AmpliSeq ERCC RNA Companion Panel for Illumina（イルミナ別売）が必要です。
AmpliSeq ERCC RNA Companion Panel for Illuminaは、AmpliSeq ERCC RNA Spike-In Mix for Illumina（イルミナが別売り）と併用して、トランスクリプトームパネルを用いたイルミナのAmpliSeqアッセイの実施時に差次的遺伝子発現を定量化することを目的としています。
ターゲットリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたはゲノム領域を単離しシーケンスすることで、ラボのリソースを節約できます。
PCRアンプリコンのウルトラディープシーケンスにより、目的のゲノム領域を特定した解析が可能です。アンプリコンシーケンスの詳細と包括的なソリューションをご覧ください。
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
レプリケート間の高い一致
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel（208アンプリコンパネルサイズ）を用いて10 ngのUniversal Human RNAからライブラリーを調製し、MiSeqシステムでシーケンスしました。結果は、同じRNAサンプルの2つのレプリケート間の高い一致率（R2 = 0.997）を示しています。R2 はデータ相関の統計的測定です。
ハイリードアライメント
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panelは、研究対象遺伝子全体の差次的遺伝子発現を解析することを可能にします。アッセイ性能を実証するため、ヒト脳リファレンスRNAおよびユニバーサルヒトRNAを、さまざまなサイズのイルミナカスタムRNAパネル（アンプリコン数）用の5つのAmpliSeqを用いて解析しました。ライブラリーはMiSeqシステムでシーケンスされました。
AmpliSeq™ for Illumina® Custom RNA Panel
20020496
ターゲットカスタムRNAパネル。Library PLUSおよびインデックス付きアダプターは別売です。
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq for Illumina RNA Library Prep Training
20023393
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
AmpliSeq for Illumina RNA Panels（AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど）で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります（例：AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
広範囲のがん型との関連が判明している161種のバリアントを調べるためのターゲットDNA／RNA研究パネル。
小児および若年成人のがんに関連する203の遺伝子を調べるためのターゲットパネル。
骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。
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