鍵となる遺伝子にフォーカスして調査

興味のあるゲノム領域にターゲットしてシーケンスすることで
シーケンスコスト、時間、データ解析を低減

ターゲットリシーケンス

ターゲットリシーケンスは、ゲノムのある特定領域のみを抽出し、シーケンスする手法で、コスト効率よく系統的に生殖細胞および体細胞変異の検出を実施できます。イルミナでは全エクソームから疾患パネル、アンプリコンまで、様々な研究デザインをサポートする複数のターゲットシーケンス用キットをご提供しています。

Introduction to Targeted Resequencing
  • 興味のある領域にフォーカスし、小さく管理可能なデータセットを取得
  • シーケンスコストと解析負荷を低減
  • 幅広い手法と比べ、データ取得までの時間を短縮
  • 低頻度変異同定のために高いカバレッジのディープシーケンスが可能
Advantages of Targeted Resequencing

全ゲノムシーケンスなどの幅広い手法と比べて、ターゲットリシーケンスではコスト効率よく興味のある領域を調査することができる手法です。ターゲットリシーケンスにより研究者は、プロジェクトの表現型に最も関与していると思われる領域にフォーカスすることができ、研究リソースを保ちながら小さくて管理可能なデータセットを入手できます。ターゲットアプローチでは高いカバレッジの達成ができるため、全ゲノムあるいはサンガーシーケンスで同定するには高い費用がかかる低頻度な変異の同定を可能にします。

Affordable Sequencing With Focused Content
Sequencing Method Explorer

Use this interactive tool to explore experimental next-generation sequencing (NGS) library preparation methods compiled from the scientific literature.

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エクソームシーケンス

エクソームシーケンスは多くの疾患原因変異が報告されているゲノムのタンパク質コーディング領域を解析します。全ゲノムシーケンスと比べて、コスト効率のよい手法です。

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アンプリコンシーケンス

PCRアンプリコンを超ディープにシーケンスするこの手法は、ゲノムの特定領域をターゲットとします。1遺伝子アッセイと比べてほぼ同等のコストで、数百の遺伝子を同時にシーケンスすることができます。

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ターゲット遺伝子パネル

ターゲットパネルはある特定の遺伝子セットをフォーカスとするプローブセットで定義されています。事前に選択したコンテンツの遺伝子パネルのほか、興味のある領域に沿ってカスタムデザインも可能です。

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ジェノタイピング by シーケンス

ジェノタイピング by シーケンス(GBS)あるいは次世代ジェノタイピングとよばれる手法は、低コストの遺伝スクリーニングで新規の動植物SNPを探索し、ジェノタイピング研究を実施することができます。この手法は特に農業研究において注目を浴びています。

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ミトコンドリアシーケンス

ミトコンドリア疾患の不均一性により課題であったミトコンドリアシーケンスにおいて、変異の包括的な同定と解析が可能となりました。

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Somatic mutations in cerebral cortical malformations.

N Engl J Med 371 733-43 2014

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Massively parallel multiplex DNA sequencing for specimen identification using an Illumina MiSeq platform.

Sci Rep 5 9687 2015

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Identification of minority resistance mutations in the HIV-1 integrase coding region using next generation sequencing.

J Clin Virol 73 95-100 2015

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シーケンス手法エクスプローラー

このベータ版の直観的なツールでは、科学論文からまとめられた次世代シーケンサー(NGS)ライブラリー調製手法を探すことができるツールです。このツールは、上記にあるシーケンス手法レビュー記事、およびポスターの手法が含まれています。新しい手法については、継続的に追加する予定です。

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がん遺伝子シーケンス
Cancer Gene Sequencing

ターゲットシーケンスではがんに関連する遺伝子セットあるいは領域にフォーカスします。ターゲットリシーケンスがもたらすディープカバレッジは、稀な腫瘍さぶクローンにおける変異を精度よくコールできます。
がんターゲットシーケンス >>

疾患スクリーニング
Condition Screening

自閉症や心臓血管系の疾患など、ある疾患に関与する基地の遺伝子をシーケンスすることで、遺伝性疾患の原因とおなる変異を同定できます。NGSはこれまでの繰り返し行うアプローチと比べて、研究コストを低減し、答えまでの時間を短縮しました。
疾患スクリーニングの詳細 >>

遺伝性疾患研究
Genetic Disease Research

メンデル型遺伝病は稀な遺伝的変異から生じます。エクソームシーケンスによりゲノムのタンパク質コーディング領域を探索し、複雑な遺伝性疾患に寄与する稀な変異を同定します。
遺伝性疾患研究 >>

ゲノム創薬のためのNGS
NGS for Drug Development

近い将来、ターゲットシーケンスは薬剤ターゲットを検証し、がん治療やそのほかの治療の変異を確認するのに使われるかもしれません。
ゲノム創薬のためのNGS >>

法医学ゲノム
Forensic Genomics

人物同定に使われる遺伝子のターゲットシーケンスは法医学DNA検査に情報を提供し、犯罪ケースワーク、行方不明者、あるいは被災者の同定においてより確実な結果を提供します。
法医学ゲノム >>

16S rRNA シーケンス
16S rRNA Sequencing

微生物の16SリボゾーマルRNA遺伝子をシーケンスするのは、ある特定サンプルに存在する微生物を同定し比較する手法としてよく使われるアンプリコンシーケンスです。複雑なマイクロビオーム、あるいは環境サンプルに有用です。
16S rRNA シーケンス >>

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Improving Drought Tolerance in Corn Hybrids
ゲノムを使いトウモロコシの干ばつ耐性を改良

Syngentaではシーケンスを使い、トウモロコシArtesian交配種の干ばつ耐性の候補遺伝子を同定しています。

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Analysis of Archival Cancer Specimens with Sequencing
保管されたがん検体でシーケンス解析

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)腫瘍サンプルからエクソームシーケンスを行うQC手法を研究者が開発しました。

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Library Prep and Array Kit Selector
ライブラリー調製とアレイキットセレクター

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NGSアプリケーションガイド

ライブラリー調製からシーケンスの選択、そして解析まで。必要とする情報がすべてここにあります。お客様の研究室に最適なツールをお選びください。

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Illumina NGS Application Guide
ターゲットリシーケンス ライブラリー調製キット 製品ガイド

本製品ガイドでは、各キットの原理や特長、さらには推奨のシーケンス条件やシステム毎の処理可能なサンプル数などを説明しています。ぜひご活用ください。

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Sequencing Troubleshooting Tips
シーケンストラブルシューティングのヒント

これらのショートビデオでは、オーバークラスタリング、不安定な定量、そしてインサートを含むシーケンスなど、よくあるトラブルについて専門的なヒントをご紹介しています。

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View Sequencing Coverage Tips
シーケンスカバレッジのヒント

実験に必要なシーケンスカバレッジの予測と達成について、説明します。

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