骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Myeloid Panelは、血液悪性腫瘍に関連するバイオマーカーを研究するための単一アッセイで、血液サンプルと骨髄サンプルからのDNAとRNAの両方を同時に解析することができます。このパネルでは、急性骨髄性白血病（AML）、骨髄異形成症候群（MDS）、骨髄増殖性腫瘍（MPN）、慢性骨髄性白血病（CML）、慢性骨髄単球性白血病（CMML）、および若年性骨髄単球性白血病（JMML）などの主要な骨髄性障害に関連するターゲットをカバーしています。主な特徴には以下があります：
Myeloid Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction（PCR）ベースのライブラリー調製、Illumina sequencing by synthesis（SBS）、NGSテクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
| Cancer type | Hematologic |
|---|---|
| Method | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Bone Marrow |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
| インプット量 |
20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA （プールあたり10ngを推奨） |
| コンテンツ仕様 | 69の遺伝子（関連する40の主要なDNAターゲット遺伝子、29のRNA融合ドライバー遺伝子、5つの遺伝子発現レベル）にわたるバイオマーカーをターゲットとする |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, MiniSeqシステム |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 |
| マルチプレックス | 最大96プレックス |
| 核酸の種類 | DNA, RNA |
| 生物種 | ヒト |
| 説明 | 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 |
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panelワークフローには、Myeloid Panelオリゴ、AmpliSeq Library PLUSキットの1つ、および少なくとも1つのAmpliSeqインデックスキットが必要です。全RNAをcDNAに変換するには、cDNA合成が必要です。
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run (mid output): 4 DNA, 32 RNA, 3 combined samples (based on >95% at 500x minimum coverage) |
2 x 151 bp |
| MiSeq System | Samples per run with v2 reagents: 7 DNA, 60 RNA, 6 combined samples |
2 x 151 bp |
ターゲットリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたはゲノム領域を単離しシーケンスすることで、ラボのリソースを節約できます。
イルミナのがん研究向けNGSとマイクロアレイテクノロジーが、がんゲノム分野における革新を牽引します。
| AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Myeloid Sequencing Panel | |
|---|---|---|---|
| Cancer type | Hematologic | Pan-Cancer, Solid Tumor | Hematologic |
| Method | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, Not FFPE-Compatible, Bone Marrow | FFPE Tissue | Not FFPE-Compatible |
| Variant class | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 8時間 |
| インプット量 |
20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA （プールあたり10ngを推奨） |
1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨 | 50 ng |
| コンテンツ仕様 | 69の遺伝子（関連する40の主要なDNAターゲット遺伝子、29のRNA融合ドライバー遺伝子、5つの遺伝子発現レベル）にわたるバイオマーカーをターゲットとする | がんとの関連性が確認されている50の遺伝子のホットスポット | 骨髄性悪性腫瘍に関連する54の遺伝子をターゲットとする。プローブは、がん抑制遺伝子および変異ホットスポットから568のアンプリコンを増幅する。 |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, MiniSeqシステム | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム | MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 | <1.5時間 | 3時間 |
| マルチプレックス | 最大96プレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 最大96プレックス |
| 核酸の種類 | DNA, RNA | DNA | DNA |
| 生物種 | ヒト | ヒト | ヒト |
| 説明 | 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 | 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 | 骨髄性悪性腫瘍における体細胞変異検出研究用。 |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
CEBPA遺伝子の高いカバレッジ
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panelで評価されたDNAは、遺伝子転写産物全体にわたる高いリード深度カバレッジを示します。
AmpliSeq™ for Illumina® Myeloid Panel
20024478
固定パネルには、血液悪性腫瘍に関連する74の遺伝子が含まれます。キットには24の反応（24のDNAライブラリーと24のRNAライブラリー）が含まれています。LP PLUSの48反応が必要です。Library PLUS、インデックス、cDNA合成は別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
AmpliSeq for Illumina RNA Panels（AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど）で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります（例：AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
最大1200の関心ゲノムターゲットのシーケンスに最適化されたターゲット化されたカスタムRNA研究パネル。
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
広範囲のがん型との関連が判明している161種のバリアントを調べるためのターゲットDNA／RNA研究パネル。
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