NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
TruSight Tumor 15は、固形腫瘍において、15個の通常変異遺伝子を評価するNGSアッセイです。
TruSight Tumor 15
固形腫瘍において、15個の通常変異遺伝子を1つのシンプルで、迅速なワークフローで評価するためのフォーカスされた次世代シーケンサー（NGS）パネル。
7時間
アッセイ時間
3.5時間
ハンズオンタイム
FFPE DNA 20 ng
インプット量
概要
関連遺伝子コンテンツ
コンテンツは、業界団体によって引用された遺伝子や遺伝子領域、独立したコンソーシアムの出版物や後期薬剤臨床試験による情報に基づいて厳選されています。コンテンツには、固形腫瘍への関与が実証されている1塩基変異（SNV）およびIndelが含まれます。
包括的なワークフロー
TruSight Tumor 15は、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）による単一の反復遺伝子検査に代わる、シンプルで迅速なワークフローで15個の遺伝子を評価します。装置上のレポート作成ソフトウェアまたはTruSight Tumor 15 BaseSpace Sequence Hubアプリでデータを解析します。
加速する腫瘍プロファイリング
わずか3.5時間のハンズオンタイムで、DNAからデータに約36時間で移行します。複数の腫瘍タイプにわたるサンプル成功率を最大化し、限られたサンプルとリソースを節約します。
仕様
| Cancer type | Pan-Cancer, Solid Tumor |
|---|---|
| Method | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | FFPE Tissue |
| Variant class | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) |
| アッセイ時間 | 7時間 |
| インプット量 |
FFPE DNA 20 ng |
| コンテンツ仕様 | 固形腫瘍に関連する15の遺伝子から250アンプリコンを増幅 |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | 3.5時間 |
| マルチプレックス | 1～24プレックス |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | ヒト |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 |
20 ng DNAを用いた固形腫瘍の15の一般的な変異遺伝子に対するNGSアッセイ。 |
必要な製品
TruSight Tumor 15 MiSeqまたはMiniSeq Kitの購入、あるいはTruSight Tumor 15 (Library Prep Only)の購入が必要です。すべての製品は24サンプル分です。TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)を購入する場合は、システム用のシーケンス試薬も別途購入する必要があります。
TruSight Tumor 15 MiSeq Kitには、MiSeq Software v2.6以降またはIllumina Annotation Engineが必要です。ファイルのダウンロード
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アプリケーション
TruSight Tumor 15は、単一のアッセイで固形腫瘍に通常関連する15の遺伝子の体細胞バリアントを評価する包括的なワークフローソリューションであり、ラボはNGSの力を利用して腫瘍形成に関与する可能性が最も高い遺伝子に焦点を当て、FFPE DNAから低頻度バリアントを自信を持って解析することができます。
ワークフローの例
ライブラリー調製
TruSight Tumor 15
シーケンス
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum) |
2 × 150 bp（推奨最大値） |
| MiSeq System | 8 samples per run with v3 reagents (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum) |
2 × 151 bp（推奨最大値） |
関連するアプリケーションとメソッド
次世代シーケンサー（NGS）ベースのがんシーケンス法は、単一遺伝子およびアレイベースのアプローチと比較して、より短い時間でより多くの情報を提供します。
Our clinical cancer research solutions deliver accurate genomic information, and enable labs to analyze multiple genes in a single test.
PCRアンプリコンの超ディープシーケンスにより、目的のゲノム領域を特定した解析が可能です。アンプリコンシーケンスの詳細と包括的なソリューションをご覧ください。
ドキュメント
製品資料
Support documentation
比較する
| TruSight Tumor 15 | TruSight Tumor 170 | |
|---|---|---|
| Cancer type | Pan-Cancer, Solid Tumor | Solid Tumor |
| Method | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
| Specialized sample types | FFPE Tissue | Low-Input Samples, FFPE Tissue |
| Variant class | Somatic variants, Insertions-deletions (indels) | Gene fusions, Somatic variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
| アッセイ時間 | 7時間 | 約2日 |
| インプット量 |
FFPE DNA 20 ng |
40 ngのDNAおよび/またはRNA |
| コンテンツ仕様 | 固形腫瘍に関連する15の遺伝子から250アンプリコンを増幅 | 170の遺伝子の完全なコード配列を濃縮するプローブ。151の遺伝子における1塩基変異（SNV）、小さな挿入、および欠失、59の遺伝子における増幅、および55の遺伝子における融合＋スプライスバリアントの呼び出し。 |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 500 Desktop Sequencer, HiSeq 2500 |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | 3.5時間 | 約10.5時間 |
| マルチプレックス | 1～24プレックス | 両方のインデックスセットを使用したDNAに最大32プレックス、RNAに最大16プレックス |
| 核酸の種類 | DNA | DNA, RNA |
| 生物種 | ヒト | ヒト |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 |
20 ng DNAを用いた固形腫瘍の15の一般的な変異遺伝子に対するNGSアッセイ。 |
DNAとRNAの両方からのバリアントコーリング情報を使用して、固形腫瘍の包括的な体細胞バリアント検出研究を実施します。 |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
TruSight Tumor 15ケミストリー
TruSight Tumor 15アッセイは、マルチプレックスPCR法を採用しており、高い精度と感度が得られます。
| TruSight Tumor 15 遺伝子リスト | ||
|---|---|---|
| AKT1 | GNA11 | NRAS |
| BRAF | GNAQ | PDGFRA |
| EGFR | KIT | PIK3CA |
| ERBB2 | KRAS | RET |
| FOXL2 | MET | TP53 |
TruSight Tumor 15 MiSeq Kit
OP-101-1001
ライブラリー調製キット1個と、24サンプルに十分なMiSeq試薬3個が含まれます。
List Price:
Discounts:
TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)
OP-101-1002
24サンプルに十分なライブラリー調製キットが1つ含まれています。
List Price:
Discounts:
TruSight Tumor 15 MiniSeq Kit
20005610
ライブラリー調製キット1個と24サンプルに十分なMiniSeq試薬3個が含まれます。
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
TruSight Tumor 15は、MiniSeqシステムおよびMiSeqシステム（v3ケミストリー）、MiSeqDx装置（研究（RUO）モード、v3ケミストリー）でサポートされています。他のイルミナシステムでのシーケンスは可能ですが、テストは行っていません。
TruSight Tumor 15キットには、以下のサーマルサイクラーの使用を推奨します。TruSight Tumor 15リファレンスガイドに記載されている推奨ランプレート設定に従ってください。
Bio-Rad C1000
Bio-Rad S1000
Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700
Applied Biosystems Veritiサーマルサイクラー
Eppendorf Mastercycler ep Gradient
Eppendorf Mastercycler ep Gradient-S
Bio-Rad C1000、Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700、Eppendorf MasterCycler ep Gradientは、社内で検証済みです
TruSight Tumor 15は、MiniSeq、MiSeq、MiSeq Dx（v3ケミストリー）システムでアンプリコンシーケンスとターゲットDNAシーケンスを使用して、固形腫瘍で15個の通常変異遺伝子をターゲットとしています。TruSight Tumor 170は、NextSeq 500、NextSeq 550システム上で、ターゲットエンリッチメントおよびターゲットDNAやRNAシーケンスを用いて170の遺伝子をターゲットにします。
はい、サンプルランとサンプルプロジェクトを表示できます。 データにアクセスするには、BaseSpace Sequence Hubへのログインが必要です。
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MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 500/550 v2.5 Kits
試薬v2.5キットは、開始蛍光強度を維持する弾力性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性とパフォーマンスが向上しています。
AmpliSeq for Illumina Focus Panel
固形腫瘍との関連が判明している52種の遺伝子を調べるターゲットDNA／RNA研究パネル。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
TruSight RNA Pan-Cancer Panel
血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋組織など、多種多様なRNAサンプルタイプを用いる遺伝子発現・バリアント検出・融合検出の研究のために、1,385のがん遺伝子をターゲットとします。
参考文献
1. 社内計算データ Illumina, Inc. 2016.
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