MiniSeq サンプルデータセット

BaseSpaceのMiniSeq最新データにアクセスして、お客様ご自身で解析できます。

TruSight Cancer ライブラリー

TruSight Cancerシーケンスパネルを用いて、6つのヒトリファレンスサンプルを作製しました。作製したライブラリーのデュアルインデックスシーケンスをMiniSeqシステムで高出力キットを使い100bp x 2のリード長で行ったところ、合計で5.2Gbを産出し、Q30以上の塩基の割合は95.8%でした。

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TruSight Tumor 15 ライブラリー

TruSight Tumor 15キットを用いて、肺がん、大腸がん、黒色腫、および乳がん組織から3つのヒトリファレンスサンプルと5つのFFPE由来DNAサンプルを作製しました。作製したライブラリーのデュアルインデックスシーケンスをMiniSeqシステムで高出力キットを使い150bp x 2のリード長で行ったところ、合計で7.6Gbを産出し、Q30以上の塩基の割合は94.9%でした。

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TruSeq Small RNA ライブラリー

TruSeq Small RNAライブラリー調製キットを用いて、Human Brain Reference RNA(HBRR)とUniversal Human Reference RNA(UHRR)のサンプルを作製しました。作製したライブラリーのシーケンスをMiniSeqシステムで高出力キットを使い36bp x 1のリード長で行ったところ、合計で0.91Gbを産出し、Q30以上の塩基の割合は97%でした。

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TruSight RNA Pan-Cancer ライブラリー

TruSight RNA Pan-Cancerパネルを用いて、ヒトリファレンスRNA(HBRRおよびUHRR)、セルラインRNA(MCF7)、そして乳がんRNAのサンプルを作製しました。8つの作製したライブラリーのシングルインデックスシーケンスをMiniSeqシステムで76bp x 1のリード長で行ったところ、合計で4.2Gbを産出し、Q30以上の塩基の割合は96.8%でした。

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TruSeq Targeted RNA ライブラリー

TruSeq ターゲットRNA発現キットを細胞周期およびNFkBパネルと併用して、Human Brain Reference RNA(HBRR)、Universal Human Reference RNA(UHRR)、およびヒトの肝臓組織から抽出したRNAのサンプルを作製しました。作製したライブラリーのシーケンスをMiniSeqシステムで高出力キットを使い51bp x 1のリード長で行ったところ、合計で2.04Gbを産出し、Q30以上の塩基の割合は96.5%でした。

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