Correlation Engine

研究者がデータを生物学的な状況に当てはめるのに役立つ、高度にキュレーションされた公開データを用いてプライベートオミクスデータを解析するインタラクティブなオミクスナレッジベース。

概要

Correlation Engineは、世界最大の生物学的データベースの1つであり、ライフサイエンス研究者に、膨大な数の高品質な全ゲノム解析と洞察に富んだ科学ツールへの前例のないアクセスを提供します。ナレッジベースは、全ゲノム研究の標準化された解析から得られた数十億のデータポイントを調査することで、新しい発見を可能にします。

Correlation Engineが提供するもの:

  • 生物学的状況を判断するための一連のアプリケーション、キュレーションされたデータセットの絶え間ない拡大を続けるライブラリー、複数の種とマルチオミクスデータセットをサポートする包括的なプラットフォーム

  • ガイド付きワークフロー、プッシュボタンアプリケーション、APIを活用する使いやすいグラフィカルユーザーインターフェース

  • 相関解析を自動化および簡素化し、プライベートデータや数千の公開データセットをスキャンして同等の洞察を見つける独自のアルゴリズム

オミカルデータから発見までの道のりを加速

Correlation Engineの256 Kのキュレーションオミクスシグネチャーにより、データを迅速に相関付け、データに関する質問します。


仕様

コンプライアンス認証

アプリケーション

Correlation Engineは、プライベートデータを生物学的な状況に、高度にキュレーションされた公開データとともに置く、使いやすいインタラクティブなゲノミクス解析プラットフォームを提供します。アプリケーションは、疾患のメカニズム、薬剤ターゲット、予後バイオマーカーまたは予測バイオマーカーを特定するための早期研究をサポートします。

ソフトウェア製品ポートフォリオ

1
ラボ
2
ラン
3
アナリティクス
4
洞察

Correlation Engine

プライベートなオミクスデータを、高度にキュレーションされた公開データとともに生物学的な文脈に当てはめるインタラクティブなオミクス知識ベース。


主なユースケース

バイオマーカーの発見と検証

重要なバイオマーカーを同定し、シグネチャー中のどの遺伝子が主な疾患領域の最良マーカー、最適な治療ターゲット、および作用機序を提供するのかを発見します。

薬剤の再利用

逆相関を探して、薬剤の新たな目的を示す遺伝子と疾患の化合物の関連性を発見します。

大学全体の研究ライブラリー

キャンパス全体の研究者が、高度にキュレーションされたパブリックオミクスデータを照会し、使用して、データを状況に合わせ、研究プロジェクトを加速し、出版物を作成できるようにします。

薬物安全性と毒性ゲノミクス

公開されている毒性試験を活用して化合物のシグネチャを評価し、キュレーションされた研究やメタ解析アプリを使用して、他の既知の毒性ゲノムシグネチャとの重複を明らかにします。


関連するアプリケーションとメソッド

ドキュメント

製品資料

さまざまなデータタイプを関連付ける

特定のクエリに対する新しい相関や関連性が迅速に特定され、遺伝子、疾患、化合物、組織、パスウェイ間のデータ主導の関連性が明らかになります。

Body Atlas

Body Atlasは、遺伝子が発現する場所とその場所における発現レベルに関する洞察を提供します。

Disease Atlas

疾患アトラスは、照会されたデータに関連する疾患、形質、および状態間の相関関係を提供します。

Pharmaco Atlas

Pharmaco Atlasは、化合物の発見、化合物に対するゲノムおよびエピゲノムの応答、およびクエリデータに関連する治療を支援します。

リソース

バリアントアノテーションと解析ソフトウェアツールは研究者が、膨大なゲノムデータから生物学的洞察を抽出してレポート作成するのに役立ちます。

Correlation Engineを活用した高度なマルチオミクス解析ワークフローをご覧ください。

 

よくある質問(FAQ)

いいえ。現在、Correlation Engineはヒト生物学と動物モデルシステムのみをサポートしています。しかし、このプラットフォームは感染に対する宿主の反応を解析するために使用することができます。

Correlation Engineは、RNA発現(RNA-Seq)、ジェノタイピング/SNP GWAS、DNAタンパク質相互作用解析、体細胞変異解析、DNAメチル化解析をサポートします。 

Correlation Engineは、インタラクティブで使いやすいインターフェースとあらかじめ構築されたワークフローを、高品質でキュレーションされた包括的な公開データと組み合わせて、ユーザーが遅延なく次の実験に進むことができるように迅速な結果を可能にします。 

Correlation Engineには23,000を超える研究があります。Correlation Engineの研究は毎週更新されます。 

Correlation Engineは、NCBI Gene ID、遺伝子記号、NCBIアクセッション番号、ENSEMBL ID、RefSeq識別子、IPI ID、およびほとんどのAffymetrix、Illumina、Agilent、およびGE HealthcareプラットフォームからのカスタムIDを含む、ほとんどの公開および標準商用プラットフォーム識別子を認識します。

Correlation Engineは、独自のランクベースの統計を使用して、インポートするデータと他のすべての実験データの間の関連性を計算します。これにより、実験結果を世界の実験の文脈に当てはめて、結果を検証し、新しい関連性を発見し、新しい実験を設計することができます。すべてのバイオグループとデータを関連付けるため、研究を構成する遺伝子やタンパク質に共通する特徴を発見できます。

Correlation Engineは、PubMedの1,900万を超える抄録とPubMed Centralの130,000を超える全文論文のインデックスを作成します。文献検索では、Correlation Engineは以下のようないくつかのヒューリスティックを使用します。

  • 用語と同義語、用語階層の関係を持つ広範なオントロジー
  • 専門用語を強調するカスタマイズされたドメイン固有のストップワードリストとアナライザー
  • 論文が発表されたジャーナルの全体的な権限
  • 発行日
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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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