Illumina Connected Analyticsのコホート

プライベートデータと公開データセットを組み合わせた研究デザインツールで、コホートを迅速に構築し、探索します。

概要

Illumina Connected Analytics Cohortsは、イルIllumina Connected Analytics に統合され、マルチオミクスデータと表現型データを1か所にまとめることで、コホートの解析を強化し、新しい研究の洞察を深めます。Illumina Connected Analytics Cohortsは以下を実現します。 

  • TCGA、Broad RGP、DRAGEN 1kGP、GEOなどの高度にキュレーションされた公開データセットへのアクセス 

  • ゼロから始める必要なく、既存のコホートに対する新しいデータおよびフィルタリング基準 

  • 複雑なクエリの必要性を回避しながら、コホートを選択および視覚化するシンプルなビジュアルツール 

  • コホートの定義が下流の統計解析(GWAS、PheWAS)に完全であることを確認するためのコホートの実現可能性解析 

データ構築の簡素化

ゲノムデータと表現型データを組み合わせるデータモデルを活用し、カスタムローディングと調和のためのプロフェッショナルサービスにアクセスします。 

コホート基準の迅速な選択

ブラウザを使用してコホートに適した被験者を見つけ、ゲノムデータと表現型データを統合して要約統計量を確認します。 

ワークフローをシームレスに統合

DRAGENパイプラインを含むワークフローに簡単にアクセスし、イルIllumina Connected Analytics Benchにエクスポートして、データサイエンス研究を強化できます。 


コンプライアンス認証


ソフトウェアアップデート

Illumina Connected Analytics Cohorts v2.14.0の更新

  • ゲノム構築の検出とリフト:コホート文書には、コホートにインポートする前にhg19/GRCh37 VCFをGRCh38に変換するためのセットアップ手順が記載されています 

  • 属性クエリ:コホートを定義する際に、数値属性の値の範囲を選択するユーザーエクスペリエンスを改善 

  • ICAプロジェクトデータへのコホートのエクスポート:さらなる解析のために、コホート定義基準に一致する被験者のリストをICAプロジェクトにエクスポートするユーザーエクスペリエンスを改善 

  • 解析ビジュアライゼーションにおける被験者の選択:ユーザーは、ニードルプロットの被験者カウントのリンクに従って、選択したバリアントまたは変異を持つ被験者のリストを表示できます 


必要な製品

Illumina Connected Analyticsライセンスが必要です。ICAコホートのiCredits、保管、または消費に追加料金はありません。

 iCreditsの詳細はこちら 

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アプリケーション

Illumina Connected Analytics Cohortsは、被験者レベルおよびサンプルレベルのメタデータと分子データを組み合わせ、創薬、がん研究など、幅広いアプリケーションのために、選択した個人のサブセットに対して三次解析を実行します。

ソフトウェア製品ポートフォリオ

1
ラボ
2
ラン
3
アナリティクス
4
洞察

関連するアプリケーションとメソッド


Illumina Connected Analyticsコホートを使用した進歩

プランと価格

Illumina Connected Analyticsライセンスが必要です。イルIllumina Connected Analyticsコホートでは、iCredit、保管、消費に追加料金はかかりません。

詳細はこちら:

* 250 iCreditは、30日間のお試し期間後に無効となります。 
** Universal Copy Serviceをサポートする制御用ソフトウェアを搭載するシステムに使用できます。旧式のシステムでは利用できない場合があります。 

ドキュメント

製品資料

迅速で簡単なコホートの構築と探索

Illumina Connected Analytics Cohortsは、コホートのゲノムデータや表現型データをフィルタリングして可視化するための使いやすいユーザーインターフェースを提供します。特定のコホート定義における実現可能性解析のためのデータ比較を簡単に評価できます。 

リソース

ICA Cohorts Annual Subscription

20065842

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よくある質問(FAQ)

研究がIllumina Connected Analytics Cohortsにロードされている場合、お客様の管理者は共同研究者と研究を共有する許可を選択できます。

はい。プライベートデータはIllumina Connected Analyticsコホートにインポートし、個別に解析することも、公開データと組み合わせてコホート解析を拡大することもできます。

Illumina Connected Analytics Cohortsは、DNAシーケンス(一塩基変化、CNV、生殖細胞系列、体細胞コールなど)およびRNA-Seq(TPM、差次的発現など)研究からのゲノムデータ、医療特性の表現型データ(人口統計学的特性、病歴、治療介入など)、および公開データベース(TCGA、Broad RGP、DRAGEN 1kGP、GEOなど)全体で27,000を超える被験者レベルのデータセットをサポートしています。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

* 250 iCreditは、30日間のお試し期間後に無効となります。 
** Universal Copy Serviceをサポートする制御用ソフトウェアを搭載するシステムに使用できます。旧式のシステムでは利用できない場合があります。 

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