NovaSeq 6000シーケンスシステムの仕様

強力なパフォーマンス

出力を調整できるスケーラブルなハイスループットシーケンス

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプット^a

リード長	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	該当なし	N/A	N/A	280～350 Gb
2 × 50 bp	65～80 Gb	134～167 Gb	333～417 Gb	該当なし
2 × 100 bp	134～167 Gb	266～333 Gb	667～833 Gb	1600～2000 Gb
2 × 150 bp	200～250 Gb	400～500 Gb	1000～1250 Gb	2400～3000 Gb
2 × 250 bp^b	325～400 Gb	該当なし	N/A	N/A

a. サポートされているクラスター密度でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づく出力仕様。

b. 最大リード長。

^ランごとの出力

リード長	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	該当なし	N/A	N/A	560～700 Gb
2 × 50 bp	130～160 Gb	268～334 Gb	666～834 Gb	N/A
2 × 100 bp	268～334 Gb	532～666 Gb	1334～1666 Gb	3200～4000 Gb
2 × 150 bp	400～500 Gb	800～1000 Gb	2000～2500 Gb	4800～6000 Gb
2 × 250 bp	650～800 Gb	N/A	N/A	N/A

a. サポートされているクラスター密度でイルミナPhiXコントロールライブラリーを使用して同時に実行される2つのフローセルに基づく出力仕様。

主要アプリケーションにおけるサンプルスループットの推定値^a

アプリケーション	SP	S1	S2	S4
ランごとのヒトゲノム	約4	約8	約20	約48
ランごとのエクソーム	約40	約80	約200	約500
ランあたりのトランスクリプトーム	約32	約64	約164	約400

a. すべてのサンプルスループットは推定値であり、デュアルフローセルランに基づいています。ヒトゲノムは、30xゲノムカバレッジを達成するために、1サンプル当たり>120 Gb超のデータを想定してます。エクソームは、約8 Gb/100×を想定しています。トランスクリプトームでは50Mリード以上を想定しています。スループットは、使用されるライブラリー調製キットに応じて変わります。

フローセルごとのパスフィルターの読み取り^a

リードタイプ	SP	S1	S2	S4
シングルエンドリード	6億5,000万～8億	13億～16億	33億～41億	8～10B
ペアエンドリード	13億～16億	26億～32億	66億～82億	16～200億

a. すべてのサンプルスループットは推定値であり、デュアルフローセルランに基づいています。ヒトゲノムは、30xゲノムカバレッジを達成するために、1サンプル当たり>120 Gb超のデータを想定してます。エクソームは、約8 Gb/100×を想定しています。トランスクリプトームでは50Mリード以上を想定しています。スループットは、使用されるライブラリー調製キットに応じて変わります。

クオリティスコア^a

リード長	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	該当なし	N/A	N/A	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 50 bp	Q30以上の塩基が90%以上			N/A
2 × 100 bp	Q30以上の塩基が85%以上
2 × 150 bp	Q30以上の塩基が85%以上
2 × 250 bp	Q30より高い塩基の≥ 75%	N/A	N/A	N/A

a. イルミナPhiXコントロールライブラリーを用いたNovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5に基づくクオリティスコア。

ランタイム^a

リード長	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	該当なし	N/A	該当なし	約14時間
2 × 50 bp	約13時間	約13時間	約16時間	該当なし
2 × 100 bp	約19時間	約19時間	約25時間	約36時間
2 × 150 bp	約25時間	約25時間	約36時間	約44時間
2 × 250 bp	約38時間	該当なし	N/A	N/A

a. NovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5に基づくランタイムで、イルミナPhiXコントロールライブラリーを使用し、同時に2つのフローセルを実行します。

装置の仕様

NovaSeq 6000 system specifications

NovaSeq 6000装置の仕様

装置の構成

コンピューターおよびタッチスクリーンディスプレイインストールセットアップおよびアクセサリーデータ収集および解析ソフトウェア
内蔵制御コンピューター
備考：コンピューター構成は定期的にアップグレードされます。現在の構成については、担当者にお問い合わせください

ベースユニット：Intel i7 4700EQ CPU搭載Portwell WADE-8022

メモリー：2 × 8 GB DDR3L SODIMM

ハードドライブ：なし

ソリッドステートドライブ(SSD)：256 GB mSATA

オペレーティングシステム：Windows 10
動作環境
屋内専用

温度：19°C-25°C（22°C ±3°C）、<2 °C change per hour

湿度：相対湿度20%～80%、結露なし

高度：2000メートル（6500フィート）未満

換気：最大8530BTU/hおよび平均6000BTU/h
レーザー
波長

532 nm、660 nm、780 nm、790 nm
モニター付き寸法
幅 × 奥行 × 高さ

80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm
（31.5インチ × 37.2インチ × 65.2インチ）
重量

481 kg（1059 lb）
リークトレイには3.5 kg（7.8 lb）、キーボードとマウスには0.9 kg（2 lb）が含まれます
梱包寸法
幅 × 奥行 × 高さ

92 cm × 120 cm × 118 cm
梱包重量

628 kg（1385 lb）
電源要件

200～240 VAC 50/60Hz、16A、単相、2500 W イルミナは地域固有の無停電電源装置を提供します
ネットワーク接続

システムとデータ管理システム間は、1Gb 接続専用。直接またはネットワーク経由で接続
ネットワーク接続の帯域幅

装置1台につき200 Mb/s：内部ネットワークでのアップロード

装置1台につき200 Mb/s：BaseSpace Sequence Hubでのアップロード

装置1台につき5 Mb/s：装置のオペレーションデータのアップロード

詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）テクノロジー

NovaSeq 6000システムは、実績のあるイルミナの合成によるシーケンス（SBS）テクノロジーを活用して、正確なデータと堅牢な性能を提供します。SBSケミストリーは、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法を使用します。この手法では、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出し、数十億もの配列を並行して読み取ります。

パターン化フローセルテクノロジー

NovaSeq 6000システムは、パターンフローセルテクノロジーを採用しており、幅広いシーケンスアプリケーションに対応する前例のないレベルのスループットを実現します。パターン化フローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数とシステムの総出力を飛躍的に向上させることができました。