NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Urinary Pathogen ID/AMR Panel（UPIP）は、尿路感染症（UTI）と共感染の原因である170を超える尿路病原体の検出と定量化を可能にし、3700を超えるマーカーとその抗菌薬耐性（AMR）に関連するアリルをカバーする次世代シーケンサー（NGS）研究パネルです。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
一般的で認知度の低い尿路病原体やAMR遺伝子を培養なしで高感度に検出および解析できるライブラリー調製および濃縮キット。
ライブラリー調製および濃縮時間<9時間
アッセイ時間
ライブラリー調製および濃縮時間<2時間
ハンズオンタイム
容量に基づく（濃度に依存しない）
インプット量
概要
主な機能
合理的なワークフロー
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Panelキットには、オンビーズタグメンテーション用のすべてのライブラリー調製試薬およびエンリッチメント試薬、インデックス、パネルプローブが含まれ、その後、濃縮ライブラリーを生成するための単一のハイブリダイゼーションステップが続きます。 エンリッチメントキットをDNA抽出、シーケンシング、Explify UPIP Data Analysisと統合することで、UTIの検出と同定のための包括的でシンプルなワークフローが可能になります。
仕様
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing |
| Specialized sample types | Not FFPE-Compatible |
| アッセイ時間 | ライブラリー調製および濃縮時間<9時間 |
| インプット量 | 容量に基づく（濃度に依存しない） |
| コンテンツ仕様 |
120種類以上の細菌、14種類の真菌、35種類のウイルス、27種類の性感染症病原体を含む4種類の寄生虫、>3,700種類の抗菌剤耐性マーカーを検出します |
| サンプルタイプの詳細 |
ヒトの臨床研究用尿サンプルおよび廃水などのサーベイランス関連サンプルから抽出したDNA |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | ライブラリー調製および濃縮時間<2時間 |
| マルチプレックス | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル |
| 作用機序 | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ |
| 核酸の種類 | DNA |
| 生物種 | Other, ヒト, Virus, Bacteria |
| 生物種詳細 |
真菌、寄生虫 |
| 説明 |
DNA 抽出、Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit を使用したライブラリー調製、シーケンス、およびさまざまな種類のサンプルから尿路病原体および抗菌剤耐性マーカーを検出し同定するためのExplify UPIP Data Analysisを組み込んだ合理的なワークフローです。 |
必要な製品
アクセサリーは必要ありません。
/
アプリケーション
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichmentキットは、臨床尿研究・環境・その他のサンプルタイプを含むさまざまなサンプルタイプから、170種類を超える尿路病原体、3700種類以上の抗菌剤耐性マーカー、およびそれらの対立遺伝子を検出および同定するために使用されます。
注目のワークフロー
ライブラリー調製
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
プロジェクトの推奨事項
関連するアプリケーションとメソッド
仮説の不要なメソッドとして、NGSは、わずか1つのSNPだけ異なる感染症株を区別し、複数の検査を置き換えることができます。
ターゲットエンリッチメントは、ハイブリダイゼーションを使用して目的のゲノム領域を捕捉します。ターゲットエンリッチメントについて、また、複数サンプルを一度に評価するためにどのように使用できるかについて学ぶ。
特定の複雑なサンプルに存在するすべての生物のすべての遺伝子を包括的にサンプリングして、細菌の多様性を評価し、培養不可能な微生物を検出します。
比較する
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
尿路病原体ID/AMRパネルでカバーされる微生物
Urinary Pathogen ID/AMR Panel Kitは、一般的なおよびあまり一般的ではない尿路病原体と27の性感染症病原体を含む174の生物を検出し、定量化することができます。
高感度病原体検出
Urinary Pathogen ID/AMR Panel（UPIP）キットは、ショットガンメタゲノミクス（SM）および培養法よりも高感度な病原体同定を提供します。UPIPによる尿サンプル399例中342例（86%）、SMによる尿サンプル399例中262例（66%）、尿培養による尿サンプル399例中205例（51%）で1つ以上の尿路病原体が検出されました。
分析感度の向上
UPIPで測定した細菌負荷は、SM陰性サンプルよりもSM陽性で高く（p < 0.0001）、SMと比較してターゲットエンリッチメントシーケンスの分析感度が改善するとの予測と一致していました。SM陰性サンプル中のバクテリアの検出は、ショットガンメタゲノミクスと比較して、エンリッチメントの感度が向上することをさらに示しています。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set A (RUO) (96 indexes,96 samples)
20090308
タグメンテーションとPCR試薬、イルミナDNA/RNA UD Indexes Set A用IDT、96サンプルからライブラリーを調製するための尿病原体ID/AMR Panel、32の3プレックス濃縮反応など、ライブラリー調製と濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set B (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20090309
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit（UPIP）には、3,500の抗菌薬耐性（AMR）マーカー、121の細菌、14の真菌、および35のウイルスと4つの寄生虫をターゲットとするために使用されるすべてのライブラリー調製試薬、インデックス、パネルが含まれています。BaseSpace Sequence HubのUPIP ExplifyアプリとIllumina DNA prep with Enrichmentキットおよび解析を組み合わせることで、UPIPエンリッチメントパネルは、尿路病原体の幅広い検出と混合性重複感染の同定のためのAMRのプロファイリングを可能にします。キットにはライブラリー調製試薬、インデックス（セットB）、パネルが含まれており、3プレックスで96サンプルを調製し、UPIP Explifyアプリで解析します。
List Price:
Discounts:
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set C (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20090310
タグメンテーションおよびPCR試薬、イルミナDNA/RNA UD Indexes Set C用IDT、96サンプルからライブラリーを調製し、その後32の3プレックス濃縮反応を行うUrinary Pathogen ID/AMR Panelなど、ライブラリー調製および濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set D (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20090311
タグメンテーションとPCR試薬、イルミナDNA/RNA UD Indexes Set D用IDT、96サンプルからライブラリーを調製するための尿病原体ID/AMRパネル、32の3プレックス濃縮反応など、ライブラリー調製と濃縮に必要なすべての試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
表示されている結果 : /
選択中の製品一覧
製品名
数量
Unit Price
製品をカートに追加
製品一覧
製品名
カタログ番号
量
単価
-
カタログ番号:数量:
よくある質問（FAQ）
いいえ、DNA抽出前にサンプルを培養する必要はありません。Urinary Pathogen ID/AMR Enrichmentキットには、すべてのライブラリー調製およびエンリッチメント試薬、インデックス、およびオンビーズタグメンテーション用のパネルプローブが含まれており、その後単一のハイブリダイゼーションステップにより、シーケンス用の濃縮ライブラリーを作成する迅速なワークフローを提供します。
スピンカラムキットは最も信頼性が高く、NGSに一般的に使用されているため、DNAの分離にはスピンカラムキットの使用をお勧めします。Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment KitのDNA抽出プロトコールについては、こちらをご覧ください。
病原体の種類に関係なく、ベンチトップシーケンスシステムでは、ライブラリー調製とシーケンスステップは2日間で完了できます。ただし、シーケンスプロセス中にMiniSeqシーケンスシステムおよびMiniSeq Rapid Reagent Kitを使用する場合、検出は< 24時間で完了できます。
このキットのパネルには、市販のコントロール10種類を認識するプローブが含まれています。ただし、これらのコントロールは本キットの一部としては提供されるものではなく、別途購入し、DNAおよびRNA抽出前にサンプルに添加する必要があります。各実験/サンプルに必要な添加コントロールは1つだけです。
通常、最低 1 × 100 bp または 2 × 100 bpのシーケンス化学を使用して、サンプルごとに1Mシングルリードまたは2Mペアエンドリードから開始することを推奨しています。これらの数値は出発点に過ぎず、サンプルタイプやターゲット量に基づいて最適化する必要があります。
はい。このパネルで取り上げたターゲットが実験の目的と合致していれば、さまざまなサンプルタイプから抽出したDNAを使用できます。廃水サンプルは、これらの病原体やそれに関連するAMRのサーベイランスのために、このキットを使用して検査されることがよくあります。廃水サンプルの場合、通常、リード数を10Mシングルリードまたは20Mペアエンドリードに増やすことを推奨します。
/
MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 500/550 v2.5 Kits
試薬v2.5キットは、開始蛍光強度を維持する弾力性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性とパフォーマンスが向上しています。
MiniSeq Reagent Kit
MiniSeqシステム試薬キットは、2チャンネルのSBSケミストリーを備えたすぐに使えるカートリッジで、サンプル数が少ない場合でもコスト効率の高いシーケンスが可能です。
MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
高感度で包括的な呼吸器病原体の同定と抗菌剤耐性に関する洞察を提供するライブラリー調製および濃縮キット。
製品情報のリクエスト
当社の製品およびサービスに関する情報、または当社のテクノロジーに関するご質問がございましたら、ぜひお問い合わせください。
Speak with a specialist
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。