Infinium XT iSelect-96 Kit

非ヒトには最大100,000の単一または複数種のカスタムバリアント、ヒトには50,000のカスタムバリアントの生産規模のジェノタイピングを可能にする包括的なマイクロアレイソリューションです。

最大>100万サンプル/年。範囲:10万~>100万サンプル/年。

サンプルスループット

アレイあたり96サンプル

サンプル数

最大50,000のカスタムマーカー

マーカー数

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概要

Infinium XT iSelect-96 Kitは、ユーザーが定義したコンテンツを持つあらゆる種で大規模なスクリーニングアプリケーションを可能にするハイスループットジェノタイピングソリューションを提供します。アグリゲノミクスにおける大規模な遺伝子改善プログラム、バイオバンクの大規模なスクリーニング、個別化医療イニシアチブなどのアプリケーションは、Infinium XTソリューションの正確性と堅牢性から恩恵を受けることができます。  

  • 生産規模のジェノタイピング:最適化されたアッセイと96サンプルBeadChipにより、年間数十万から100万を超えるサンプルを処理できます

  • 柔軟なコンテンツ:数百~50KSNPのターゲット単一または複数種のアッセイで、95%以上の変換率が保証されているカスタムパネル

  • 高効率ワークフロー:総アッセイターンアラウンドタイムを3日から2日に短縮し、ハンズオンタイムを短縮

合理化されたサンプル調製とデータ解析

完全自動化、高効率のInfinium XTワークフローにより、ジェノタイピングサンプルの調製と解析が合理化されます。イルミナの自動化制御(IAC)ソフトウェアの更新と LIMSの統合により、サンプル処理の効率 が向上し、 GenomeStudio と Beelineソフトウェア の強化により、リアルタイムのデータ生成とオンデマンドQCレポート機能が提供されます。 


仕様


必要な製品

Infinium XT iSelect-96キットにはBeadChipと試薬のみが含まれます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けることはできません。複数のロースループットバッチを処理するために、複数の小型キットを注文してください。

必須: 

  • Infinium XT Starter and Upgrade Kits:新規ユーザー(スターター)および既存のInfiniumユーザー向けにInfinium XTアッセイを実行するためのハードウェアおよびアクセサリで、XTワークフローを初めて(アップグレード)

  • Infinium XT Assay PB20 Kit:濃縮試薬バッファー  

  • iScanシステム:イメージング用のスキャナーと付属品

オプション: 

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アプリケーション

Infinium XT iSelect-96 Kitは、≤ 50Kのカスタマイズ可能なマーカーをサポートする96サンプルBeadChipを搭載しており、アグリゲノミクスにおける遺伝子改善プログラム、バイオバンクの大規模スクリーニング、個別化医療イニシアチブなど、大規模なジェノタイピングアプリケーションを可能にします。

ワークフローの例


関連するアプリケーションとメソッド

ドキュメント

製品資料

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Infinium XT iSelect-96 Kit Infinium HTS iSelect Custom Beadchip Infinium Global Screening Array-24 Kit BovineSNP50 v3 DNA Analysis BeadChip
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Instruments iScan System iScan System iScan System iScan System
Method Custom Array, High-Throughput Genotyping Array Custom Array Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA
Species category Drosophila, Any species, Shrimp, Mammalian, Tomato, Bovine, Mouse, Canine, Yeast, Rice, Zebrafish, Ovine, Hamster, Chicken, Porcine, Human, Rat, Equine, Plant, Virus, Maize, Nematode, Bacteria, Soybean Drosophila, Any species, Shrimp, Mammalian, Tomato, Bovine, Mouse, Canine, Yeast, Rice, Zebrafish, Ovine, Hamster, Chicken, Porcine, Human, Rat, Equine, Plant, Virus, Maize, Nematode, Bacteria, Soybean Human Bovine
Technology Microarray Microarray Microarray Microarray
Variant class Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Insertions-deletions (indels) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs)
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA(150 ng/ulで)
サンプルスループット 最大>100万サンプル/年。範囲:10万~>100万サンプル/年。 1週間に最大5,760サンプル(iScanシステム2台、AutoLoader 2x 1台、Tecanロボット2台、1日8時間勤務の場合) 1週間に約5,760サンプル
サンプル数

アレイあたり96サンプル

アレイあたり24サンプル アレイあたり24サンプル
マーカー数 最大50,000のカスタムマーカー 最大700,000のカスタムマーカー

654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量: 最大100,000。 

固定マーカー:ゲノム全体で等間隔のSNP53,218
カスタムマーカーアドオン容量:最大600,000(キットバージョン以上)
説明

Infinium XT iSelect-96 Kitは、年間5万~>100万のサンプルのスループット範囲で、事実上あらゆる種の大規模研究のための費用対効果の高いジェノタイピングを可能にします。BeadChipは、事前検証済みまたは新規のカスタムコンテンツで、最大10万の非ヒトマーカーと5万のヒトマーカーをサポートします。

Infinium HTS iSelect Custom BeadChipにより、研究者は、完全にカスタマイズされたハイスループットスクリーニングパネルを設計し、研究ニーズに合ったあらゆる種のゲノム中のあらゆるマーカーを精査することができます。 

Infinium Global Screening Array-24 Kitは、最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツ、キュレーションされた臨床研究バリアント、およびQCマーカーを組み合わせることで、集団規模の遺伝学、トランスレーショナル研究、バリアントスクリーニング研究、プレシジョンメディシン研究を可能にする経済的な次世代ジェノタイピングアレイです。

選択ツール:

infinium xt workflow improvements

Infinium XT iSelect-96キットワークフローの改善

各ステップはInfinium XT iSelect-96 Kitワークフローで最適化されており、ターンアラウンドタイムを3日から2日に短縮します。

リソース

サムネール

Infiniumジェノタイピング:DesignStudio Microarray Assay Designerの概要

カスタムコンテンツ (9)

Infinium® XT iSelect-96 Kit (1152 samples)

20006613

このキットには、Infinium XT-96 Semi-High Throughput(ST)マニュアルまたは自動化ワークフローを通じて、4、8または12のBeadChipバッチで1152のサンプルを処理するための12のカスタムBeadChipおよびチューブベースの試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium XT iSelect-96 Kit (4608 samples)

20006614

このキットには、Infinium XT-96 High-Throughput(HT)およびUltra High-Throughput(UHT)ワークフローを通じて、24または48のBeadChipバッチで4,608のサンプルを処理するための48のカスタムBeadChipとプレートベースの試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium XT iSelect-96 Kit (23040 samples)

20006615

このキットには、Infinium XT-96 High-Throughput(HT)およびUltra High-Throughput(UHT)ワークフローを通じて、24または48のBeadChipバッチで23,040のサンプルを処理するための240のカスタムBeadChipとプレートベースの試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium XT Starter Kit (48 BeadChip batches)

20011069

このキットは、Infinium XTワークフローを利用して、ハイスループットレベルでターゲットジェノタイピングを実行したいと考えているInfiniumの新規のお客様をサポートします。これには、Infinium XTワークフローを通して24のBeadChipバッチを処理するために必要な付属機器が含まれます。チップガイド、iScan、Autoloader 2.x、自動化ロボットは別売りです。

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Infinium® XT Starter Kit (24 Beadchips)

20011100

各Infinium XT Starter Kitには、24のBeadChipバッチの処理に必要なすべてのアクセサリハードウェアが含まれています。

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Infinium XT Starter Kit (24 Beadchip) 220V

20031992

Infinium XT Starter Kit (24 Beadchip) 220V

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Infinium XT Starter Kit (24 Beadchip) 110V

20031915

Infinium XT Starter Kit(24 Beadchip)110V

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Infinium XT Starter Kit (48 Beadchip) 110V

20031916

Infinium XT Starter Kit(48 Beadchip)110V

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Infinium XT Starter Kit (48 Beadchip) 220V

20031993

Infinium XT Starter Kit(48 Beadchip)220V

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オートメーション (4)

AutoLoader 2.x, Single-Scanner Configuration (110/220 V)

SY-202-1001

Autoloader 2.xロボット1台、ホテル5軒、ブラックキャリア10台、Autoloader 2.xベースプレート1枚、iScanベースプレート1枚、インストール、イルミナAutoloaderソフトウェア、1年間の標準保証が付属しており、1台のiScanシステムをサポートします。iScanシステムは別売りです。

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AutoLoader 2.x, Dual-Scanner Configuration (110/220 V)

SY-202-1002

このキットは、2台のiScanの自動ローディングを可能にすることで、iScanとサンプルスループット能力を最大限に活用したいお客様をサポートします。AutoLoaderロボット1台、キャリア収納5か所、キャリア20個、ベースプレート、設置、Illumina AutoLoaderソフトウェアが含まれます。iScanは別売りです。1年間の標準保証。

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Infinium Automated Pipetting System with IAC (110V)

SC-30-403

このパッケージは、Infinium処理を自動化し、LIMSシステム(別売り)を統合することを希望するお客様をサポートします。LIMS対応Tecan Freedom EVO 150 cmリキッドハンドラーとRoMA ARMを搭載し、Pre-AMPまたはPost-AMP Infinium Assayプロトコール、ロボットアクセサリー、ロボット制御ソフトウェアを実行することができます。LIMSサーバー、ソフトウェアおよびライセンスは別売りです。

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Infinium Automated Pipetting System with IAC (220V)

SC-30-404

このパッケージは、Infinium処理を自動化し、LIMSシステム(別売り)を統合することを希望するお客様をサポートします。LIMS対応Tecan Freedom EVO 150 cmリキッドハンドラーとRoMA ARMを搭載し、Pre-AMPまたはPost-AMP Infinium Assayプロトコール、ロボットアクセサリー、ロボット制御ソフトウェアを実行することができます。LIMSサーバー、ソフトウェアおよびライセンスは別売りです。注記:これには、Infiniumワークフローに必要なTe-Flow Rack/Water Circulatorキットは含まれておらず、別途注文する必要があります(PN 20028404)

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装置 (1)

iScan® System (110/220V)

SY-101-1001

iScan Reader、アイソレーションテーブル、コンピューター、インストール、およびInfinium BeadArray製品のイメージングをサポートする12か月の保証が含まれます。100~120 V/220~240 V、50~60 Hzの場所で使用。

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アクセサリー製品 (9)

Infinium® XT Assay PB20 Kit

20007420

Infinium XTアッセイワークフロー用の濃縮(バルク)試薬バッファー。

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Infinium® XT Upgrade Kit (24 Beadchips)

20011101

各Infinium XT Upgrade Kitには、96-XT BeadChipの処理に固有のすべてのアクセサリハードウェアが24のBeadChipバッチサイズで含まれています。

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Infinium XT ST Upgrade Kit (Up to 12 BeadChip Batches)

20015526

各Infinium XT ST Upgrade Kitには、ST自動または手動ワークフローを使用した最大12バッチのBeadChip処理に必要なすべてのアクセサリハードウェアが含まれています。Infinium Assayをすでに実行し、Infinium XT STワークフローを組み込むためにラボをアップグレードしているお客様を対象としています。

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Infinium® 96-XT Tip Guide Set

20011102

各Infinium 96-XT Tip Guide Setには、各BeadChipに96サンプルをハイブリダイズするために使用する3つのチップガイドが3セット付属しています。

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XT Dual Hyb Insert and Baseplate

20011759

Infinium XT Hybridization Chamberインサート。これらの部品には、チャンバーアセンブリインサートと、サンプルハイブリダイゼーションプロセス中のTecan上の96-XT BeadChip用のベースプレートとして、2つの目的があります。

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XT Flow-Through Chamber Assembly Tray

20011760

フロースルーアセンブリプロセス中にInfinium 96-XT BeadChipをサポートするトレイ。

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Infinium® XT HT Workflow Training Kit, Reagents Only

20012126

Infinium XT HTワークフローの処理のみを目的としたプレートベースの試薬がイルミナのオンサイトトレーニングにのみ含まれています。BeadChipは別途注文する必要があります。BeadChip部品番号をコメント欄に明記し、カスタマーサービスと協力して注文してください。

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お問い合わせ

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XT Hyb Chamber Gasket

20012127

DNAサンプルのBeadChipsへのハイブリダイゼーションをサポートするInfinium XT Hybridization Chamber用ガスケットインサート

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XT Flow Through Chamber (8 pack)

20012129

XT Flow Through Chamber (8 pack)

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よくある質問(FAQ)

Infinium XTワークフローの主な特徴は次のとおりです。

  • DNA増幅:バッチサイズを3倍に増やし、インキュベーション時間を短縮 

  • 酵素による断片化:時間を50%短縮

  • アルコール沈殿:30分間のインキュベーションステップを削除し、乾燥時間を75%短縮 

  • DNA再懸濁:全体的なインキュベーション時間を75%短縮

  • BeadChipハイブリダイゼーション:Tecanロボットシステムを使用してサンプル容量を3倍に増加 

  • サンプル延長/染色:容量が2倍に増加、ランあたり4,608サンプル

GenomeStudio Softwareは、マイクロアレイベースのジェノタイピングデータのためのイルミナの視覚化および解析プログラムです。ソフトウェアの重要な更新により、ジェノタイプクラスター生成の速度が向上し、解析全体のターンアラウンドタイムが短縮されます。 

 

Beeline Softwareは、ハイスループット処理からデータをプレフィルターし、レポートするためのイルミナのマイクロアレイデータ解析ツールです。これにより、大規模なInfiniumジェノタイピングプロジェクトに最適です。

DesignStudio Softwareにはカスタムジェノタイピングマイクロアレイプローブデザイナーが含まれており、ガイド付きの使いやすいインターフェースを介してカスタムコンテンツを開発し、注文することができます。また、95%以上のカスタムコンテンツ変換率が保証されています。

Infinium XT iSelect-96 Kitは、現在のInfinium自動化(Tecanロボット、LIMS、アッセイアクセサリーハードウェア)で処理できます。Tecanリキッドハンドリングロボット用のIACソフトウェアの最適化により、PCR前のリキッド移送ステップで効率が向上し、時間を節約できる一方、LIMSソフトウェアの更新はプロセス全体をサポートします。新しいフォーマットをサポートし、ハンズオンタイムを短縮するために、一部のアクセサリーハードウェアの更新が必要になります。 

Infinium XT iSelect-96 Kitソリューションは、自動化ワークフローを使用してInfiniumラボの規模拡大を目指すお客様をサポートするよう設計および最適化されています。試薬の使用を最適化するには、BeadChipを1回処理するために96サンプルをバッチ処理し、ランごとに少なくとも1152サンプルをバッチ処理する必要があります。年間< 50Kサンプルを処理するラボは、エンドユーザーのターンアラウンドタイムを延長し、自動化の調達による設備投資を正当化できない可能性があります。 
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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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