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NextSeq 550シーケンスシステムの仕様

高精度シーケンスとアレイスキャン

リード長と複数出力構成を調整可能

NextSeq550

様々なリード長用フローセル当たりのアウトプットa

リード長 NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システムハイ出力キット
1 × 75 bp N/A 25～30 Gb
2 × 75 bp 16.25～19.5 Gb 50～60 Gb
2 × 150 bp 32.5～39 Gb 100～120 Gb

a. サポートされるクラスター密度（フィルターを通過する129～165 k/mm²クラスター）のIllumina PhiXコントロールライブラリーに基づきます。実際の性能パラメーターは、サンプルタイプ、サンプル品質、フィルターを通過するクラスターによって異なる場合があります。すべてのNextSeq 550システムキットはペアエンドに対応しています。

主要アプリケーションの予想サンプルスループット

NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システムハイ出力キット
3エクソーム 1つの全ヒトゲノム
12のエンリッチメントパネル 12エクソーム
96のアンプリコンパネル 16トランスクリプトーム

フローセル当たりのパスフィルターリード

  NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システムハイ出力キット
シングルリード ≤ 130M ≤ 400M
ペアエンドリード ≤ 260 M ≤ 800 M

クオリティスコアa

リード長 NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システムハイ出力キット
1 × 75 bp N/A > Q30より80%高い塩基
2 × 75 bp > 2 × 75 bpでQ30より80%高い塩基 > Q30より80%高い塩基
2 × 150 bp > 2 × 150 bpでQ30より75%高い塩基 Q30以上の塩基が75%超

a. クオリティスコアは、ベースコーリングにおけるエラー確率の予測です。Q30超の塩基のパーセンテージは全体のランの平均です。

ランタイム

リード長 NextSeq 550システム中出力キット NextSeq 550システムハイ出力キット
1 × 75 bp N/A 11時間
2 × 75 bp 15時間 18時間
2 × 150 bp 26時間 29時間

アレイスキャンパラメーター

アレイ アレイあたりのスキャン時間 サンプルあたりのスキャン時間
Infinium MethylationEPIC BeadChip 40分 5分
Infinium CytoSNP-850K BeadChip 40分 5分

装置の仕様

NextSeq 550 System specifications
  • 発光ダイオード（LED）
    波長

    （レーザーダイオード780 nm、クラスIIIb）
    緑色510～525 nm、赤色645～655 nm
  • 寸法
    幅 × 奥行 × 高さ
    53.3 cm × 63.5 cm × 58.4 cm
    （21.0インチ × 25.0インチ × 23.0インチ）
  • 重量
    83 kg（183 lb）
  • 木枠重量
    151.5 kg（334 lb）
詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

Sequence by Synthesis（SBS）ケミストリー

NextSeq 550システムは、実績のあるイルミナの合成によるシーケンス（SBS）テクノロジーを利用して、複数のアプリケーションに高精度のデータと堅牢な性能を提供します。SBS法では、蛍光標識したヌクレオチドを使用する可逆的ターミネーター法により、伸長しているDNA鎖に取り込まれる塩基を1塩基単位で検出します。

2-Channel SBS

NextSeq 550システムは、オリジナルのイルミナ4チャネルSBSテクノロジーよりも高速なデータ生成のために、2チャネルの合成シーケンス（SBS）を活用し、同じ高いデータ精度を実現します。