Illumina UD Indexes

ユニークデュアル(UD)インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。

2025年1月30日は、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A–D(カタログ番号20027213、20027214、20042666、20042667)およびIDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A–D(カタログ番号20040553、20040554、20040555、20040556)が注文可能になる最終日です。 

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A–D(カタログ番号20091654、20091656、20091658、20091660)およびIllumina RNA UD Indexes Sets A–D(カタログ番号20091655、20091657、20091659、20091661)への移行を推奨します。 

概要

Illumina UD Indexesにより、データ品質を損なうことなく、ラン1回あたりのサンプルのシーケンスを大幅に増加させます。

主な特長

  • 384のユニークデュアルインデックス(UDI)でマルチプレックスを行うことによりシーケンスコストを削減

  •  インデックスホッピングのレベルと効果を最小化

  • 解析中のデマルチプレックス精度を向上

  • 1回のランで複数のサンプルを同時にシーケンスすることでスループットを向上

機能拡張

マルチプレックスのためのライブラリー調製時にUDIを使用することで、イルミナのシーケンスプラットフォーム全体で、最も正確なデマルチプレックスとシーケンスを確かなものにします。お客様のニーズを満たすため、イルミナは、装置とライブラリー調製キットの両互換性を拡張するUDIを提供しています。


仕様


必要な製品

別途、ライブラリー調製、濃縮、およびプローブパネルの試薬を注文する必要があります。

互換性のあるライブラリー調製キット:
Illumina RNA UD Indexes Set A-D and IDT for Illumina RNA UD Indexes Set A-D

  • Illumina Stranded Total RNA Library Prep
  • Illumina Stranded mRNA Library Prep

Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A-D and IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A-D

  • Illumina DNA Prep
  • Illumina DNA Prep with Enrichment
  • Illumina DNA PCR-Free Prep
  • Illumina RNA Prep with Enrichment
  • Illumina RNA Prep
  • Nextera XT DNA Library Preparation Kit

IDT for Illumina TruSeq RNA UD Indexes v2

  • TruSeq Stranded mRNA
  • TruSeq Stranded Total RNA

IDT for Illumina TruSeq DNA UD Indexes v2

  • TruSeq DNA Nano
  • TruSeq DNA PCR-Free
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ユニークデュアルインデックスは完全にユニークインデックスを持つ

リソース

サムネール

インデックスホッピングの洞察 | イルミナウェビナー

このウェビナーでは、Gary Schroth, PhDがインデックスホッピングについて紹介し、ライブラリーのベストプラクティスに従ってインデックスホッピングレベルを最小化する方法と、ユニークデュアルインデックスの組み合わせを使用してインデックスホッピングリードを削除する方法について解説します

ユニークデュアルインデックスは、他のインデックス戦略に比べても最も高い精度で、サンプルあたりのコストやシーケンスライブラリーを削減します。

サムネール

シーケンス:合成によるシーケンス(SBS)の紹介

Sequence by Synthesis(SBS)テクノロジーを含むイルミナの次世代シーケンサーワークフローを3次元の詳細でご覧ください。サンプル調製からクラスター形成、独自のSBSプロセスによるシステムフローセルでのシーケンス、BaseSpace Sequence Hubでのデータ解析まで、さまざまな作業が可能です。

インデックススイッチングに関連するシーケンスリードの誤割り当てを回避するためのヒントとベストプラクティス。

インデックスアダプター (18)

Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091655

Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples) には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

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Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091657

Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

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Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091659

Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

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Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091661

Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040553

96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040554

96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040555

96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040556

96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040871

96サンプルにラベルを貼るのに十分な96、8 bpのインデックスを含み、TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022371内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96サンプルのラベリングに十分な96個の8 bpのインデックスを含み、TruSeq NanoおよびTruSeq PCR-Free Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022370内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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選択中の製品一覧

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よくある質問(FAQ)

イルミナアダプターシーケンスドキュメントには、インデックス付きアダプターシーケンスとその他すべてのアダプターシーケンスがリスト化されています。

はい。アンカープレートは、RNAライブラリー調製キットに必要であり、Illumina RNA UD Indexes Sets A-DおよびIDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A-Dにすでに含まれています。

インデックスホッピングのレベルは、Illumina DNA/RNA UD Indexesで変わりませんが、インデックスホッピングされたリードは、バイオインフォマティクス的にデマルチプレックスデータから除去することができます。

ユニークデュアルインデックスは、ライブラリー調製中に、DNAの各断片の両端に完全にユニークで無関係なインデックス配列を追加します。これにより、シングルランにおいて、多数のライブラリーをプーリングし、同時にシーケンスできます。他のインデックス手法と比較して、ユニークデュアルインデックスは、ホップされたリードをフィルタリングすることでインデックスホッピングを軽減します。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500 High Throughput

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSI)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現し、スケーラビリティを強化します。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

製品情報のリクエスト

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