Infinium Global Diversity Array-8 Kit

臨床研究用バリアントの卓越したカバレッジと、遺伝型スクリーニング用に最適化された多民族ゲノムワイドなコンテンツを組み合わせたBeadChip。

1週間に約1,728サンプル

サンプルスループット

アレイあたり8サンプル

サンプル数

1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量：最大175,000。

マーカー数

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Infinium Global Diversity Array-8キットは、製造中止となったInfinium Multi-Ethnic Global、Multi-Ethnic AMR/AFR、Multi-Ethnic EUR/EAS/SASキットに代わる推奨品です。Global Diversity Arrayは、Multi-Ethnic Kitsの最新版です。

概要

Infinium Global Diversity Array 8-Kit（GDA）BeadChipは、最適化された多民族のゲノムワイドなコンテンツを備えた強力で費用対効果の高いアレイです。

主な特長

  • さまざまなアプリケーションに対応する臨床研究バリアントを幅広くカバーする最新版

  • 最適化されたコンテンツにより研究の多様性を実現

  • ハイスループットでスケーラブルなワークフローにより、ユーザーは、データを迅速に収集し、レポートすることが可能となります

All of Usプログラムによって選択

GDAは、このNIHプレシジョンメディシンイニシアチブによって信頼されるマイクロアレイの市販版で、>1M0万人の人々からデータを収集して健康転帰を改善します。

バリアントカバレッジの最大化

ゲノムの集団横断的インピュテーションカバレッジのための高密度一塩基多型（SNP）グローバルバックボーンにより、多様な母集団におけるポリジェニックリスクスコアの開発と遺伝的構造の特徴付けが可能になります。

 

多民族コンテンツ

ロバストなゲノムワイドスキャフォールドは、アメリカ大陸のアフリカ系集団における喘息に関するコンソーシアム（CAAPA）およびゲノミクスと疫学を使用した人口構造（PAGE）との共同研究を通じて、世界的な集団における一般的なバリアントおよび低頻度のバリアントにタグ付けするように設計されました。コンテンツには、> 11K0のアフリカ系全ゲノムシーケンスと、アメリカ大陸全体の集団が含まれます。

 

 

仕様

Assay type Infinium LCG
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Instruments iScan System
Method Genome-Wide Genotyping Array
Nucleic acid type DNA
Specialized sample types Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva
Species category Human
Technology Microarray
Variant class Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs)
インプット量 200 ng DNA
サンプルスループット 1週間に約1,728サンプル
サンプル数 アレイあたり8サンプル
マーカー数

1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量：最大175,000。
説明 8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。

必要な製品

選択したキットサイズを一度にランするサンプル数に合わせます。各キットは1つのバッチとして処理され、複数の実験に分けられるように設計されていません。ロースループットバッチを複数処理する場合は、複数の小型キットを注文してください。

DesignStudioを使用してコンテンツをカスタマイズするか、コンソーシアムブースターとして利用可能なオプションのアドオンコンテンツのリストから選択できます。ブースターアドオンコンテンツが利用可能です：

  • 神経変性疾患（約7.5万SNP）

  • 腫瘍学（～9万SNP） 

  • キャリアスクリーニング（解釈のためのIgentify社とのパートナーシップ）

在庫状況と価格については、担当営業にご確認ください。

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アプリケーション

Infinium Global Diversity Array-8 Kitは、集団規模の遺伝子研究、バリアントスクリーニング、プレシジョンメディシン研究向けに最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツを備えた強力で費用対効果の高いBeadChipです。  

ワークフローの例

1
コンテンツを選択

Infinium Global Diversity Array

2
処理とスキャン
3
追跡、分析、およびレポート

関連するアプリケーションとメソッド

ハイスループットジェノタイピング

マイクロアレイを用いた大規模なジェノタイピングにより、大規模なコホートまたは母集団における疾患リスクに関連するバリアントを同定することができます。

全ゲノム関連解析

全ゲノム関連解析（GWAS）により、疾患に関連する遺伝的バリアントを発見し、特徴付けることが可能になります。

ファーマコゲノミクス

ファーマコゲノミクスは、ヒトゲノムの変異が薬物反応にどのように影響するかを研究し、副作用と医療費の削減に役立ちます。

ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

比較する

Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 v2.0 Kit Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8
Assay type Infinium LCG Infinium LCG Infinium HTS Infinium LCG
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Instruments iScan System iScan System iScan System iScan System iScan System
Method Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array, Cytogenomic Array
Nucleic acid type DNA DNA DNA DNA DNA
Specialized sample types Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva Blood Blood, FFPE Tissue, Buccal Swabs, Saliva
Species category Human Human Human Human Human
Technology Microarray Microarray Microarray Microarray
Variant class Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Chromosomal abnormalities, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)
インプット量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA
サンプルスループット 1週間に約1,728サンプル 1週間に約1,728サンプル 1週間に約5,760サンプル
サンプル数 アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり24サンプル アレイあたり8サンプル アレイあたり8サンプル
マーカー数

1,825,277の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量：最大175,000。

 合計1,933,117マーカー、カスタムアドオン容量175,000

654,027の固定マーカー。カスタムマーカーアドオン容量： 最大100,000。 
説明 8サンプルのInfinium Global Diversity Arrayは、ゲノム全体で4,800を超える重要な遺伝子のターゲットカバレッジを提供します。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。

Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGxは、8サンプルのBeadChip上に構築されており、>190万のマーカーを含んでいます。ファーマコゲノミクス（PGx）研究用に市販されている最も包括的なジェノタイピングマイクロアレイであり、疾患や多様性の研究やその他のアプリケーションにも対応しています。  

Infinium Global Screening Array-24 Kitは、最適化された多民族ゲノムワイドコンテンツ、キュレーションされた臨床研究バリアント、およびQCマーカーを組み合わせることで、集団規模の遺伝学、トランスレーショナル研究、バリアントスクリーニング研究、プレシジョンメディシン研究を可能にする経済的な次世代ジェノタイピングアレイです。

 Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 BeadChipは、キャリアスクリーニング研究を拡張し、Global Diversity Arrayのバックボーンに45,000を超えるインパクトの高いマーカーを備えています。Igentify Analyzeソフトウェアは解析を簡素化し、主要な障害に対する高い検出率を可能にします。 8サンプルのInfinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8は、ゲノム全体で4,800を超える主要な遺伝子を広範囲にターゲットとしています。BeadChipには約180万個のマーカーが含まれており、疾患に関連する領域で高いエクソンカバレッジを実現し、高精度のコピー数バリエーションコールと平均分解能1.5 Mbを提供します。

選択ツール：

ライブラリー調製＆アレイキットセレクター

ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。

遺伝子パネルとアレイファインダー

目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。

DesignStudioカスタムアッセイデザインツール

DesignStudioは、カスタムシーケンスプローブのデザインと注文、カスタムジェノタイピングアレイアッセイの作製に役立つウェブベースのアッセイデザインツールです。

図

Infinium Global Diversity Array content

内側のパイは、ゲノムワイドカバレッジ、臨床研究、品質管理（QC）のために選択されたアレイの割合を示しています。外側のリングは、1kGP2に存在するユニークなバリアントに対する重み付けされた参照グローバル対立遺伝子頻度を示しています。カウントは、固有のバリアントを表します。

Global Diversity Arrayの臨床研究コンテンツ

コンテンツは、科学的に認知されたデータベースから専門的に選択され、臨床研究アプリケーションのための非常に有益なアレイを作成しました。バリアント数は変更される場合があります。

Global Diversity Arrayの幅広いファーマコゲノミクスマーカー

CPICガイドラインとPharmGKBデータベースに基づいて選択されます3。PGx公開データベースバリアント、PharmGKB、PharmVar、CPICにアノテーションされたバリアント。ゲノムワイドPGxカバレッジには、ターゲットインピュテーションタグSNPおよびCPICレベルA CNVタグを含む拡張ADME遺伝子またはCPICレベルA遺伝子に位置するマーカーが含まれます。

Global Diversity Arrayの疾患カテゴリーを幅広くカバー

（A）ClinVar米国医科遺伝学およびゲノミクス大学（ACMG）アノテーションに従って、病理分類の範囲別に分類されたバリアント。（B）ClinVarデータベース内のカテゴリー別のGlobal Diversity Array臨床研究コンテンツ。バリアント数は変更される場合があります。

Global Diversity Array上のQCマーカー

アレイ上のQCバリアントは、性別判定、大陸の祖先、ヒトの同定など、サンプル追跡のためのさまざまな機能を可能にします。

リソース

イルミナポリジェニックリスクスコアソリューション

イルミナのPolygenic Risk Scoreソリューションは、トランスレーショナル研究者向けの包括的で実装しやすく、汎用性の高いゲノム解析ツールセットです。

固定コンテンツ (4)

Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (16 samples)

20031669

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには2つのBeadChipと、16のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Discounts:

Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (48 Samples)

20031810

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度で切断可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには6つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (96 samples)

20031811

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、12個のBeadChipと、96個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (384 Samples)

20031812

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには48個のBeadChipと、384個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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追加製品 (4)

Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (16 Samples)

20031813

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには2つのBeadChipと、16のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (48 Samples)

20031814

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、6つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (96 Samples)

20031815

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、臨床的に重要なバリアントやファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、12個のBeadChipと、96個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (384 Samples)

20031816

Global Diversity Array（GDA）は、All of U.S. Precision Medicine Initiativeとのコラボレーションにより構築された、高密度でカスタマイズ可能なジェノタイピングツールです。GDAは、他に類を見ないデータ品質、強力な多民族的カバレッジ、および臨床的に重要なバリアントとファーマコゲノミクスマーカーの広範なカバレッジを提供します。各キットには、48個のBeadChipと、384個のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

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カスタマイズ

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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お問い合わせ

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よくある質問（FAQ）

Infinium GDAは、イルミナのヒトアレイポートフォリオの中で、バリアントカバレッジあたりのコスト効率が最も高く、ジェノタイピング投資に対するリターンを最大化するプレシジョンメディシンプログラムに最適です。Infinium GDA with Enhanced PGx Contentは、PGx研究に利用できる最も包括的なマイクロアレイで、市販されているすべてのマイクロアレイと比較できます。1 違いの詳細については、 Infinium GDA with Enhanced PGx Content製品ページを参照してください。

ポリジェニックリスクスコア（PRS）は、特定の複雑な状態または疾患の発症リスクを高める遺伝子変異の総数を表します。Global Diversity Array 8-Kitにより、研究者は、多様な集団におけるPRS評価を開発することを可能にします。　 ポリジェニックリスクスコアの詳細はこちら。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

Infinium XT iSelect-96 Kit

非ヒトには最大100,000の単一または複数種のカスタムバリアント、ヒトには50,000のカスタムバリアントの生産規模のジェノタイピングを可能にする包括的なマイクロアレイソリューションです。

Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

CpGアイランド、遺伝子、エピゲノムワイド関連解析用エンハンサーを広範囲にカバーする頑強なメチル化プロファイルマイクロアレイ。

参考文献

  1. 社内計算データにより イルミナ社 2021年3月。

  2. 1000 Genomes Project.  1000 genomes.org. 2021年8月24日アクセス。

  3. PharmGKB, The Pharmacogenomics Knowledgebase.  www.pharmgkb.org. 2021年8月4日にアクセス。

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