SBSテクノロジーの利点
堅牢な性能とデータ品質
Illumina sequencing by synthesis（SBS）は、世界中のシーケンスデータの生成を担う次世代シーケンス（NGS）テクノロジーです。 SBSケミストリーは、エラーのない最高のリード1の収量を実現し、ゲノム全体の堅牢な塩基コールを可能にします。イルミナSBSテクノロジーの品質と性能の利点は、結果に自信を与えます。
実績のある塩基コーリング精度
SBSケミストリーは、単一塩基の伸長とヌクレオチドの競合的付加により、高精度シーケンスを実現します。SBSは、Q30を超えるシーケンスされた塩基の割合が最も高く、塩基が誤って呼び出された確率が0.1%であることを示す品質スコアです。この実績のある精度は、主要なNGSプラットフォームの中で偽陽性、偽陰性、およびミスコールを最小限に抑え、プロジェクト効率を向上させます。2
ゲノム全体にわたる偏りのないカバレッジ
最適化されたSBS試薬は、反復的またはGCリッチなスパンなど、シーケンスが難しいゲノム領域でも均一なカバレッジと精度を保証します。SBSは塩基ごとの可逆的ターミネーターケミストリーを使用しており、イオン半導体やピロシーケンス技術で見られるホモポリマーエラーを事実上排除します。SBSはハイブリダイゼーションやライゲーションベースのケミストリーで見られる高いGCバイアスも回避します。2
ペアエンドシーケンスによる高品質のアライメント
SBSではペアエンドシーケンスが可能です。両端からDNAライブラリー断片をシーケンスし、高品質のシーケンスデータを生成します。各リードペア間の距離は既知であるため、ペアエンドシーケンスはアライメントとゲノムアセンブリを向上させます。リードペアとしてアライメントされたシーケンスにより、構造バリアント、遺伝子融合、転写アイソフォームの正確な検出が可能になります。
プッシュボタンインフォマティクス
BaseSpace Sequence Hubは、バイオインフォマティクスの経験の有無にかかわらず、どのような研究者でもNGSデータ解析を行えるユーザーフレンドリーなツールです。
BaseSpaceの詳細はこちらあらゆるスループットやスケールでコスト効率が高い
SBS試薬、光学系、フローセルのイノベーションにより、イルミナシーケンサーの能力がさらに向上しました。最近の進歩の例を以下に示します。
- 2チャネルSBSの高速な画像検出とデータ処理により、ロースループットのアプリケーションでもNGSのコスト効率が向上します。
- パターン化フローセルテクノロジーは、1,000ドルのヒトゲノムを可能にする超高スループットとスケールでシーケンスを強化します。
- 1チャネルSBS、またはイルミナの半導体シーケンス法は、SBSとCMOSテクノロジーを組み合わせることで、iSeq 100システムの装置コストを削減し、NGSを簡素化します。
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参考文献
- 業界をリードするNGSプラットフォームの上位3つの比較に基づく。社内計算データにより イルミナ株式会社 2016年。
- Ross MG, Russ C, Costello M, et al. シーケンスデータにおけるバイアスの特性化と測定。Gen Biol 2013;14:R51