ターゲットDNAシーケンスにより、研究者は特定の遺伝子セットまたは関連する遺伝子領域に集中することができ、費用対効果の高い体系的なバリアント検出が可能になります。次世代シーケンサー(NGS)は、多数のサンプルを同時シーケンスするために使用でき、カバーされる遺伝子の数と、関連する遺伝子をカバーする自信の両方を高めます。
ターゲットシーケンスアプリケーションの例:
5~7時間
一回の実行で数種~数百種の遺伝子を範囲とするターゲットに使用するための、高度にマルチプレックス化されたポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づくワークフロー
2時間未満
シーケンスランの作成、ランのステータス監視、データ解析のためのオンプレミス型ソフトウェアソリューションです。
NGSデータの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスクラウドコンピューティング環境。
研究者がヒトゲノムデータから生物学的に重要なバリアントを迅速に同定できるようにします。
小規模ゲノムシーケンスは、公衆衛生、疫学、疾患研究のための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を提供します。細菌培養を必要と せずに、研究者は何千もの小規模生物を並行してシーケンスできます。
従来のアプローチとは異なり、NGSを用いた小規模なゲノムシーケンス研究は、手間のかかるクローニングステップに依存しません。 小さなゲノムDNAライブラリーは、わずか2日で調製、シーケンス、解析できます。MiniSeqランあたり最大 50の小さなゲノムをシーケンスします。
1.5時間未満
小さなゲノム、PCR アンプリコン、およびプラスミドのシーケンスライブラリーを90分未満で調製し、DNAインプットの必要性を低く抑えます。
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物の種まで、広範囲のアプリケーション用の迅速な統合ワークフロー。
2~3時間
装置上のデータ解析を自動的に実行します。リードをアライメントし、小さなゲノムの全ゲノムシーケンスのためのバリアント解析を実行します。
Tell-ReadおよびTell-Linkアプリは、de novo WGSのアセンブリの読み取りと作成を行います。
*MiniSeqシステム上の小さな全ゲノムシーケンスは、5 Mbゲノム、30xカバレッジ、2 x 150 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、MiniSeq Reagent High Output 300サイクルキットに基づくサンプルあたりの推定コストです
MiniSeqターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)ソリューションを使用した遺伝子発現プロファイリングにより、数十から数千のターゲットを同時に測定できます。MiniSeqシステムは、遺伝子、アイソフォーム、スプライスジャンクション、cSNP、融合遺伝子をターゲットとするユーザー定義のパネルをサポートします
専門家が選定したコンテンツの事前定義されたパネルは、主要なシグナル伝達経路と細胞プロセスをターゲットにしています。MiniSeqランあたり1~384のターゲットRNAサンプルをシーケンスします。
約1時間
RNAサンプルの装置上のデータ解析を自動的に実行します。リードを アライメントし、相対発現を定量化します。
BaseSpace TruSeq Targeted RNA アプリ
BaseSpace Sequence Hubのサンプルデータセットを見る:
MiniSeqターゲットRNAデータ
*MiniSeqシステム上のターゲットRNAシーケンスは、65ターゲット、1000xカバレッジ、1 x 50 bpリード長、TruSeqターゲットRNA発現カスタムパネルキット、MiniSeq試薬高出力75サイクルキットに基づくサンプルあたりの推定コストです
BeadChipから、ゲノム、トランスクリプトーム、またはエピゲノム研究のためのライブラリーの準備、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、すべて1か所で必要な情報にアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
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