MiniSeqシーケンスシステムのアプリケーションと手法

アクセシブルなクロスメソッドの柔軟性

DNAとRNAアプリケーションのためのシーケンスメソッド間の容易な移行

MiniSeq flow cell

主要なアプリケーションと手法

ターゲットDNAシーケンスにより、研究者は専門家が選択したコンテンツの固定パネルやカスタムのユーザー定義の遺伝子パネルを使用して、特定の遺伝子セットや関連する遺伝子領域に集中することができます。次世代シーケンサー(NGS)のパワーに焦点を当てることで、ターゲットシーケンサーは高い精度と再現性で費用対効果の高い体系的なバリアント検出を可能にします。  

呼吸器病原体アプリケーションノートを読む

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アッセイと調製の設計
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シーケンス
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解析

MiniSeqシステムは、ランあたり最大50の小さなゲノムをシーケンスし*、最小の生物のゲノムを詳細に表示します。小規模全ゲノムシーケンス(WGS)は、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノミクスにおけるアプリケーションのための微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を可能にします。このアプローチでは、細菌培養や手間のかかるクローニング手順は必要ありません。

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ライブラリー調製
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シーケンス
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解析

*5 Mbゲノム、30×カバレッジ、2 × 150 bpリード長、Nextera XT Library Prep Kit、およびMiniSeq Reagent High Output 300サイクルキットに基づきます。

MiniSeqシステムを使用したターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)により、数十から数千のターゲットの遺伝子発現を同時に測定できます。 MiniSeqシステムは、ユーザー定義のパネルをサポートし、遺伝子、アイソフォーム、スプライスジャンクション、cSNP、融合遺伝子をターゲットにします。専門家が選定したコンテンツの事前定義されたパネルは、主要なシグナル伝達経路と細胞プロセスを対象としています。1ランあたりシーケンス1~384ターゲットRNAサンプル。

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アッセイと調製の設計
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シーケンス
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解析

65ターゲット、1000×カバレッジ、1 × 50 bpリード長、TruSeq Targeted RNA Expressionカスタムパネルキット、およびMiniSeq試薬高出力75サイクルキットに基づきます。

その他のアプリケーションと方法

16Sメタゲノムシーケンス

16SリボソームRNA(rRNA)遺伝子を培養不要の方法でシーケンスし、複雑で研究が困難な微生物叢や環境からの細菌を同定して比較します。

De novoシーケンス

どの動物種にも利用できるリファレンスシーケンスがなく、新規ゲノムの高速で正確な特性評価を可能にします。

シーケンスによるジェノタイピング(GBS)

新しい植物や動物のSNPを発見し、低コストの遺伝子スクリーニング手法でジェノタイピング研究を行います。

生殖細胞系列変異解析

がんの遺伝性リスクの増加との関連が既知または疑われる遺伝子を評価します。

病原体の同定と解析

NGSを活用して、研究アプリケーション用のウイルス、バクテリア、真菌、寄生虫を検出し、特徴づけます。

小規模RNAの発見とプロファイリング

microRNAなどの小さなRNA種を単離してシーケンスし、遺伝子サイレンサーや転写後制御におけるノンコーディングRNAの役割を研究します。

ターゲット遺伝子シーケンス

遺伝子プロファイリング研究用に事前に設計されたパネルまたはカスタム設計されたパネルを使用して、特定の遺伝子または関心のあるゲノム領域を選択してシーケンスします。

他者による本装置の使用方法

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