Small RNAのプロファイリングと探索に対応した
ターゲット解析法

低分子RNAやmiRNAなどを広範囲に捉える精度よく正確なSmall RNA-Seq

Small RNAシーケンス

次世代シーケンサーが進化を続けるなか、イルミナのSmall RNAシーケンス(Small RNA-Seq)のマルチプレックス性能も向上し、スループットも高くなりました。Small RNA-Seqは、低分子RNAの探索およびプロファイリングの両アプリケーションにおける優れた感度とダイナミックレンジを備えており、数千の低分子RNAおよびmiRNAシーケンスを明らかにすることができます。

Small RNA-Seqでは、新規miRNAおよび他の低分子ノンコーディングRNAの探索、1塩基の解像度をもとにしたisomiR変異の特徴づけ、既知配列および構造情報を必要としない低分子RNAまたはmiRNA解析が可能です。TruSeq Small RNA Library Prep Kitはサイズ選択のカスタム化に対応しており、17~35ヌクレオチドのSmall RNAの検討や、あらゆるサンプル中の全Small RNAの差異的遺伝子発現解析が可能です。

スイカズラのmicroRNAは、A型インフルエンザウイルスに効果を発揮する成分です。

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スイカズラ、miRNA、インフルエンザ

トータルRNAから直接miRNAシーケンスライブラリーを調製し、ノンコーディングRNAの役割を解析できます。

  • 転写後制御の表現型に対する寄与の把握
  • 新規バイオマーカーの同定
  • 低分子RNAおよびmiRNA全範囲のキャプチャー

エピジェネティクスは、DNAシーケンスの変化を伴わずに生じる、遺伝子制御における遺伝性変化を研究する領域です。この研究領域では、DNAとタンパク質の相互作用、DNAメチル化、Small RNAによる遺伝子制御などが検討されます。イルミナは、エピジェネティックな変化や遺伝子制御の検討のために、頑健で使いやすくコスト効率に優れたソリューションをもたらす幅広いエピジェネティクス解析ツールを提供しています。

イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析および生物学的解釈までのプロセス全体を容易にする、シンプルな低分子RNAシーケンスワークフローを提供します。

ワークフローが合理化かつ統合されているだけでなく、イルミナの1塩基合成反応(SBS:sequencing by synthesis)ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産出されています。*

下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。

TruSeq Small RNA Library Prep Kit

トータルRNAから直接miRNAシーケンスライブラリーを調製できるシンプルかつコスト効率に優れたソリューション。

ライブラリー調製キット選択ツール ライブラリー調製キット選択ツール

プロジェクトの種類、スタート物質、分析法またはアプリケーションに基づき、ニーズに最適なキットをお探しください。

MiSeqシリーズ

特化に関する性能。ターゲットシーケンスと小さいゲノム解析のためのスピードと簡易性1ランあたり低分子RNAサンプル1~5を実現。

NextSeqシリーズ

自由度の高い性能。一般的なゲノム解析向きのスピードと使いやすさ。1ランあたり低分子RNAサンプル25~80を実現。

HiSeqシリーズ

生産性に優れた性能。低コストかつ大容量で多彩なアプリケーションに対応する高スループットシーケンサー。1ランあたり低分子RNAサンプル60~792を実現。

プラットフォーム比較ツール

シーケンスプラットフォームを比較し、研究室およびアプリケーションに最適なシステムをお探しください。

シーケンス試薬

イルミナのシーケンスシステム用のシーケンス試薬、フローセル、バッファーが同梱されているキットをご覧ください。

MiSeq ReporterおよびBaseSpaceでは、Small RNAアプリを使用できます。

miRNAs Analysisアプリ

2つの条件下で差異的遺伝子発現が認められるmiRNAを検出可能です。アダプタートリミング、リードカウントなどを実行します。

Broad IGV

MITおよびハーバード大学によって開発された、NGSによる複雑な多型解析データを表示するゲノムブラウザー。

Genomatix Pathway System (GePS)

単一遺伝子または遺伝子のリストに、パスウェイ、疾患、組織、低分子に関するアノテーションデータを関連付けます。

iPathway Guide

差異的遺伝子発現、薬物相互作用、および疾患の解析。

BaseSpace CloudまたはOnsite

NGSデータの解析と管理のためのイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。

NextBio Research

拡大し続けている、疾患機序、薬剤標的、およびバイオマーカーを特定するためのキュレーション済みゲノムデータライブラリー。

がん研究:変異検出
がん研究:変異検出

貴重な腫瘍サンプルを高感度で解析し、1細胞あたりのシングルコピーレベルで変異を検出したい場合があります。Small RNAシーケンスでは、がんトランスクリプトーム中のmiRNAおよび他の低分子ノンコーディングRNAの探索およびプロファイリングを、きわめて高いカバレッジで実施できます。
がんトランスクリプトーム >>

複雑な疾患:RNA編集
複合疾患:RNA編集

自然免疫系、獲得免疫系、CNS、およびさまざまな疾患の細胞に固有のmiRNA発現プロファイルが存在します。NGSベースのプロファイリングでは、RNA編集プロセスや変異イベントに関する情報など、迅速かつ高スループットなmiRNAトランスクリプトーム解析が実現します。高カバレッジの低分子RNAシーケンスにより、新規miRNA種の探索や低頻度変異の同定が可能です。
遺伝子発現プロファイリングおよび制御 >>

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低分子RNAシーケンスのベストプラクティスに関するウェビナー
Small RNAシーケンスのベストプラクティスに関するウェビナー

Small RNAライブラリー調製、シーケンス、および基礎データ解析の考慮事項。

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タッチパネル操作のインフォマティクス
タッチパネル操作のインフォマティクス

NGSデータを容易に解析、保管、共有できるユーザーフレンドリーなツールにアクセスしてください。

詳細はこちらから
TruSeq低分子RNAライブラリーキットのFAQ
TruSeq Small RNA Library KitのFAQ

Small RNA-Seqについてよくある質問に対する回答をご覧ください。

詳細はこちらから
NextSeq 500システムによるRNA-Seq
NextSeq 500システムによるRNA-Seq

自由度とコスト効率に優れたRNAシーケンスソリューションにより、生物学に関する理解が深まります。

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* データはイルミナにて公的データベースをもとに計算(2015)