トランスクリプトームの完全な全体像

コーディングおよびノンコーディング領域から最大限の転写産物を捉える

トータルRNA シーケンス

TruSeq Stranded Total RNAによるトータルRNAシーケンス(全トランスクリプトーム解析)により、コーディングRNAおよび複数のノンコーディングRNAを含むトランスクリプトームの完全な全体像が得られます。また、高感度かつ高精度で発現を定量化でき、同様にトランスクリプトームの既知および新規の特長を同定することができます。

Ribo-Zeroケミストリーは豊富なRNA種を効率的に除去し、分解した転写産物、および良質な転写産物どちらについてもライブラリー作成ができます。Total RNAシーケンス(Total RNA-Seq)は、正常サンプルおよび低品質/FFPEサンプル双方を最適にカバーします。

トータルRNA-SeqはコーディングRNAおよび複数のノンコーディングRNAを解析し、トランスクリプトームの全体像を示します。

  • 既知および新規特長双方の捕捉
  • 研究者は広範囲な転写産物全体でバイオマーカーを同定することが可能
  • 対象となる表現型のより包括的な理解
  • 幅広いダイナミックレンジにわたるトランスクリプトームのプロファイリングが可能
Advantages of Total RNA Sequencing

ボストン大学医学センターの肺専門医、救命救急医のDr. Avrum Spiraは、肺障害の診断および治療のためのバイオマーカーを開発するために、全ゲノム遺伝子発現アレイを用いて臨床サンプルを解析することを目標として研究室を始めました。今日、Dr. Spiraの研究室では、トータルRNA-Seqを使って発現アレイでは検出できない可能性のある新規で稀な転写産物を解明しています。
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全ゲノムアレイからトータルRNAシーケンスへの移行

イルミナはライブラリー調製からデータ解析や生物学的解釈に至るまでのプロセス全体を単純化する統合化トータルRNA-Seqワークフローを提供します。

ワークフローが合理化かつ統合されているだけでなく、イルミナのSequence by Synthesis (SBS)ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、全世界のシーケンスデータの約90%を生み出しています*。*

以下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。

Ribo-Zeroを用いたTruSeq Stranded Total RNAサンプル調製キット
ストランド情報を精確に測定することで、全トランスクリプトームの全体像が得られます。FFPE RNAサンプルとの互換性があります。
NeoPrepライブラリー調製システム

イルミナのすべてのシーケンスプラットフォーム向けに、簡単に高品質なNGSライブラリーを調製するシステムです。

トータルRNA-Seqライブラリー調製キットの比較

ニーズに最適なキットを探すことができます。

NextSeqシリーズ

全ゲノム、エクソーム、またはトランスクリプトームのシーケンスに適した自由度を備えた性能と使いやすさ。1ランあたりトータルRNAサンプル3~10を実現。

HiSeq 2500システム

1ランあたりトータルRNAサンプル8~96のシーケンスを実現する性能と効率性。

HiSeq 3000/HiSeq 4000システム

高スループットRNA-Seqで、ヒトトランスクリプトームに関しHiSeq 3000では1ランあたり50、HiSeq 4000では100を実現。

プラットフォーム比較ツール

シーケンスプラットフォームを比較して、検査室およびアプリケーションそれぞれに合った最良のシステムを特定するためのツール。

シーケンス試薬

各イルミナシーケンスシステムに適したシーケンス試薬、フローセル、およびバッファーを含むキットを選択してください。

RNA Expressアプリ

STARアライナーでRNAシーケンスをアラインし、アラインしたリードを遺伝子に対応付けした後で、DESeq2により差異的遺伝子発現を実行します。

TopHat Alignmentアプリ

リードのマッピング、リファレンス遺伝子および転写産物の存在量の推定、変異コール、オプションの融合遺伝子コールの各機能があります。

Cufflinks AssemblyおよびDifferential Expression (DE)アプリ

新規転写産物のアセンブリと新規およびリファレンス転写産物の差異的遺伝子発現を実行します。

Broad IGV

MITおよびハーバードのBroad研究所によって開発されたゲノムブラウザーで、複雑な変異解析用のNGSデータを表示します。

Genomatix Pathway System(GePS)

単一遺伝子または遺伝子のリストに、パスウェイ、疾患、組織、低分子に関するアノテーションデータを関連付けます。

iPathway Guide

差異的遺伝子発現、薬物間相互作用、および疾患解析。

BaseSpace CloudまたはOnsite

NGSデータの解析と管理のためのイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。

NextBio Research

研究者の疾患機序、薬剤標的、およびバイオマーカーの特定を支援するキュレーションされた、増大しつつあるゲノムデータライブラリー。

がん研究:変異検出
がん研究:変異検出

がんは多数の遺伝的変化を蓄積しますが、通常、腫瘍の進行を進めるものはほんのわずかです。トータルRNA-Seqを用いてコーディングRNAおよびノンコーディングRNA双方のバイオマーカーの遺伝子発現変化をモニタリングすることで、腫瘍分類および進行に影響を及ぼす変異の種類を解明するのに役立てることができます。
がんRNAシーケンス >>

アグリゲノム:ディープトランスクリプトームシーケンス
アグリゲノム:ディープトランスクリプトームシーケンス

植物には大きな反復性のゲノムがあるため、低発現の遺伝子をシーケンスすることが困難である可能性があります。ウルトラディープRNAシーケンスではde novoシーケンスとリシーケンスの両方を用いて、大きなトランスクリプトームの植物を研究します。
アグリゲノムにおけるRNA-Seq >>

複雑な疾患:RNA-Seqによるバイオマーカーの同定
複雑な疾患:RNA-Seqによるバイオマーカーの同定

様々な形のncRNAの存在は、急速に増加する複雑な疾患により示唆されてきました。全トランスクリプトームRNAシーケンスによって、研究者は1回の解析でコーディングRNAおよび多数のノンコーディングRNAの研究が可能となり、複雑な疾患の生物学的全体像を捉え、広範なバイオマーカー候補について検討することができます。
複雑な疾患研究におけるRNA-Seq >>

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* データはイルミナにて公的データベースをもとに計算(2015)