ターゲットRNAシーケンス

RNAサンプル中の遺伝子発現と遺伝子融合の解析のために、関心のある特定の転写産物のシーケンスに焦点を当てる

ターゲットRNAシーケンスの紹介

ターゲットRNAシーケンス(RNA-Seq)は、選択した特定の転写産物だけをシーケンスすることで高精度な結果が得られる手法です。定量的情報と定性的情報の両方を提供します。ターゲットRNA-Seqは、エンリッチメントまたはアンプリコンベースのアプローチのいずれかによって達成することができ、どちらも目的とする遺伝子群にフォーカスして遺伝子発現解析を可能にします。また、エンリッチメントアッセイは、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織を含む多くのサンプルタイプで、既知および新規両方の遺伝子融合パートナーを検出する機能も提供します。

ターゲットエンリッチメントRNA-Seqの利点

RNAエンリッチメントは、定量的な発現情報のほか、小規模バリアントや遺伝子融合の検出を行います。RNAエンリッチメントは以下を特徴としています。

FFPE組織などの難しいサンプルに対応

低インプット(10 ngのトータルRNAまたは20~100 ngのFFPE RNAが必要)

既知の融合遺伝子パートナーと新規の融合遺伝子パートナーの両方を検出

幅広いダイナミックレンジで遺伝子発現をプロファイリング

RNA sequencing methods guide cover. Close up image of a female scientist pipetting clear liquid into tube; NextSeq 1000/2000 reagent cartridge and sample plate on the lab bench.

RNAシーケンス手法ガイド

このガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのソリューションを提供します。Illumina RNA-Seqワークフローは、ライブラリー調製、シーケンス、データ解析を統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。

ターゲットアンプリコンRNA-Seqの利点

RNA発現パネルは、関心のあるRNAシーケンスに焦点を合わせるように設計することも、完全に最適化され実験的に検証されたパネルにカスタムコンテンツを追加することもできます。

関心のある転写産物を測定するための、非常に正確で特異的な方法を提供

発現差解析、アリル特異的発現の測定、および遺伝子融合検証のための定性的および定量的情報を提供

数十から数千に及ぶターゲットを同時に測定

低品質またはFFPE由来のRNAサンプルに対応

Female scientist holding a single pipette in one hand and a tube in the other.

RNA-Seq向けライブラリー調製

イルミナの充実したRNA-Seqライブラリー調製ポートフォリオには、豊富なrRNAの除去機能が含まれているため、トランスクリプトームの高価値な部分に集中することができます。

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補足資料

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