MiSeq Reporter Software

MiSeq Reporter内蔵データ解析ソフトウェア

シンプルな装置内データ解析

MiSeq Reporter ソフトウェアは二次データ解析を実行し、MiSeq シーケンサーにプリインストールされています。リアルタイム解析ソフトウェアによるシーケンスラン中に装置で生成されたベースコールを処理します。

リアルタイム解析の完了時に MiSeq Reporterが自動的に起動します。各ゲノムおよびサンプルのアライメント、構造多型、およびコンティグアセンブリーに関する情報が生成されます。サンプルシートで指定されている解析ワークフローに基づいて解析が実行されます。

直感的なグラフィック形式のデータ

MiSeq Reporterは、一次および二次解析データと各サンプルのクオリティおよびカバレッジに関する情報を、シンプルかつ直感的なグラフィック形式で提供します。

プリインストールされたデータベースとリファレンスゲノム

ほとんどのワークフローでは、アライメントを実行するためにリファレンスゲノムが必要です。MiSeq Reporterには、いくつかのデータベースとゲノムがプリインストールされています。

データベース: ヒト用miRbase、ヒト用dbSNP、ヒト用refGene

ゲノム: シロイヌナズナ、ウシ(Bos taurus)、 大腸菌 株DH10b、ヒト(Homo sapiens)ビルドhg19、マウス(Mus musculus)、ラット(Rattus norvegicus)、 黄色ブドウ球菌、および酵母(Saccharomyces cerevisiae)

独自のリファレンスゲノムを高速フォーマット(*.fastaまたは*.fa)でアップロードすることもできます。

コンピューターの要件

MiSeq ReporterはWindowsのサービスとして実行され、ウェブブラウザを使用して表示されます。MiSeqシステムが次のランを実行中にデータを解析する場合は、別のコンピューターに別のソフトウェアのコピーをインストールできます。

その他の要件については、 MSRのコンピューティング要件 に関するサポートページをご覧ください。

MiSeq Reporterをダウンロードするかサポートを受ける

MiSeq Reporterの最新バージョンで導入された変更点を確認し、最新バージョンをダウンロードしてください。または、MiSeq Reporterのテクニカル サポート情報にアクセスします。

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