MiSeq Reporterトレーニング
データの解析方法とサポートされるワークフローについて学びます。
MiSeq Reporter内蔵データ解析ソフトウェア
MiSeq Reporterソフトウェアは二次データ解析を実行し、MiSeqシーケンサーにプレインストールされています。Real Time Analysisソフトウェアによるシーケンスラン中に装置上で生成されたベースコールを処理します。
リアルタイム解析が完了すると、MiSeq Reporterが自動的に起動します。各ゲノムとサンプルに対するアライメント、構造バリアント、コンティグアセンブリに関する情報を生成します。サンプルシートで指定されたワークフローに基づいて解析を行います。
MiSeq Reporterは、一次解析および二次解析のデータ、ならびに各サンプルの品質およびカバレッジ情報を、シンプルで直感的なグラフィック形式で提供します。
データの解析方法とサポートされるワークフローについて学びます。
データベース: ヒト用miRbase、ヒト用dbSNP、ヒト用refGene
ゲノム: Arabidopsis thaliana、牛(Bos taurus)、 大腸菌 株DH10b、ヒト(Homo sapiens)ビルドhg19、マウス(Mus musculus)、ラット(Rattus norvegicus)、 黄色ブドウ球菌、および酵母(Saccharomyces cerevisiae)。
独自のリファレンスゲノムを高速フォーマット(*.fastaまたは*.fa)でアップロードすることもできます。
MiSeq Reporter(MiSeq Reporter)に関心のあるリファレンスゲノムを追加する方法を学びます。
MiSeq ReporterはWindowsサービスとして実行され、ウェブブラウザで閲覧できます。MiSeqシステムが次のランを実行中にデータを解析したい場合は、別のコンピューターに別のソフトウェアのコピーをインストールすることができます。
その他の 要件については、MiSeq Reporterコンピューティング 要件サポートページを参照してください。
MiSeq Reporterの最新バージョンで導入された変更を確認し、最新バージョンをダウンロードしてください。または、MiSeq Reporterテクニカルサポート情報にアクセスしてください。