プロテオミクス
プロテオミクスによる生物学的システムの構造と機能の研究
NGSによりプロテオミクスを探求
プロテオミクスとは？
プロテオミクスは、生物学的システムにおけるタンパク質の研究を目的とした、学問の一分野です。トランスクリプトーム活性は、ゲノム情報に基づき、アミノ酸のシーケンスをコード化する遺伝子を変換し、タンパク質を生成します。プロテオームとしても知られる生物内のタンパク質のセット全体が、細胞の構造と機能に関する複雑だが重要な情報の源です。この分野の進歩により、疾患、バイオマーカー、治療法開発をよりよく理解するための画期的な発見がなされます。
次世代シーケンサー（NGS）がゲノミクスとトランスクリプトミクスにかつてないスピード、精度、拡張性をもたらしたのと同様に、このテクノロジーは現在、タンパク質の研究に応用されています。
プロテオミクスは、マルチオミクスプロファイリングにどのように活用されているのでしょうか？
他のオミクステクノロジーと結合したタンパク質の検出と同定により、細胞がどのように機能し、どのように活性化しているか包括的に捉えることができます。1つの遺伝子から多くの異なるタンパク質が得られるため、あらゆる分析オプションは、多くの研究分野でターゲットや治療法を同定するための洞察として豊富な情報を提供します。
遺伝子発現とタンパク質を定量する同時アプローチ
サイエンティストは、シングルセルにおけるメッセンジャーRNAとタンパク質発現を同時に測定する新しいマルチオミクスアプローチを提示し、これまでに見られなかった免疫細胞のサブセットを発見するための土台を築いています。
白血病におけるゲノミクスとプロテオミクスで明らかになった複雑なダイナミクス
シングルセルゲノミクスがタンパク質測定と組み合わされ、白血病腫瘍の不均一性が明らかになる過程をお読みください。
ゲノムワイド関連データを用いたヒトの脳のプロテオミニムス
プロテオミクスとゲノムワイド関連データが結び付き、アルツハイマー病の病因と治療ターゲットに対する新たな洞察が得られる過程をご覧ください。
Partek Flowによるプロテオミクスおよびゲノム解析
使いやすいインターフェースを備えた Partek Flowソフトウェアは、包括的なゲノムおよびプロテオミクスデータ解析を提供します。Somalogicデータ用のADATファイル、Olinkデータ用の.txtファイル、マスサイトメトリーデータまたはあこや空間プロテオミクスデータ用の.txt(.csv)/.fcsファイルをインポートし、さまざまな探索的データ解析プロセスを実行できます。
Partekを使用すると、以下のことができます。
- 希望する特性を持つサンプル/セル/機能にデータをフィルター
- 欠損データの補完
- データのノーマライズ
- 寸法削減の実施
- クラスター解析の実施
補足資料
解析特異性を備えたマルチプレックスハイスループットプロテオミクス
この技術メモでは、Olink Exploreとイルミナシーケンスシステムを活用して、バイオマーカーと創薬研究のためのハイスループットタンパク質プロファイリングを行う方法をご紹介します。
FFPE組織切片の空間プロテオゲノミクス
このアプリケーションノートでは、NanoString GeoMx Digital Spatial ProfilerとイルミナNGSテクノロジーを用いて、星細胞腫と膠芽腫の組織構造を明らかにする方法を詳述します。
Th1分極細胞における固有の分子シグネチャーの検出
イルミナのNGSおよびBioLegend TotalSeq抗体により、バルクおよびシングルセルシーケンスを最適化してTh1細胞をプロファイリングします。