NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
TruSight Oncology 500 HRDが発売されました。ロバストかつ精確な相同組換え修復欠損(HRD)評価により、包括的ゲノムプロファイリングを可能にします。日本ではご利用いただけません。
TruSight Oncology 500(TSO 500)は、FFPE組織からの包括的ゲノムプロファイリング(CGP)を可能にするNGSアッセイです。
523の遺伝子をターゲットとし、すべてのDNAおよびRNAバリアントタイプ(SNV、CNV、Indel、融合遺伝子)のほか、MSI、TMBおよびHRD)を評価†
ハイブリッドキャプチャーケミストリーと高度なバイオインフォマティクスで正確な結果を提供
オプションの自動化キットと手法により、ハンズオンタイムを短縮*
ハイスループット設定でも利用可能
ガイドラインや臨床試験に沿った500を超える腫瘍横断型バイオマーカーを評価し、1回のアッセイで陽性バイオマーカーを見つける可能性を高めます。オプションのアドオンHRDキットでゲノム不安定性を評価します。†
Illumina Connected Analyticsにより、即時利用可能なDRAGEN二次解析パイプラインと統合された手動または自動ワークフローを使用して、オンプレミスサーバーまたはクラウドで4~5日で結果が得られます。イルミナのConnected Insights‡やPierianなど、複数のオプションを使用して、洞察にアクセスし、レポート作成を行うことができます。
*TSO 500 HRDでは利用できません。
†HRD は、TruSight Oncology 500 HRDキットをTruSight Oncology 500に追加した場合にのみ利用できます。日本ではご利用いただけません。
‡国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。
TruSight Oncology 500製品ラインで臨床研究の疾患関連バイオマーカーを同定します。
TruSight Oncology 500
FFPE腫瘍組織から関連DNAおよびRNAがんバイオマーカーを評価します。ゲノム不安定性スコア(GIS)を評価するアクセサリーキットが追加され、これにはHRDが含まれます。†
TruSight Oncology 500 High Throughput
TruSight Oncology 500と同じパネル内容と組織インプットタイプを用いて、一度に最大192のサンプルをバッチ処理できます。
TruSight Oncology 500アッセイと同様のDNAパネル内容で、リキッドバイオプシーを介した血漿中の血中循環腫瘍DNA(ctDNA)を解析します。
アッセイ時間 | サンプルから結果まで4~5日 |
---|---|
Automation capability | Liquid handling robot(s) |
自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
Cancer type | Pan-cancer, Solid tumor |
コンテンツ仕様 | 523の遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94 Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。 オプションのTruSight Oncology 500 HRDキット(日本ではご利用いただけません)には、Myriad Geneticsによる包括的ゲノム不安定性スコア(LOH+TAI+LST)により相同組換え欠損を評価するための、約25,000のSNPが含まれます。 |
説明 | FFPE組織からの包括的ゲノムプロファイリングを可能にし、NextSeq 550システムまたはNextSeq 550Dx システム(研究(RUO)モード)で実行し、一度に最大8サンプルをバッチ処理できるアッセイ。 |
ハンズオンタイム |
自動ワークフロー約2.5時間。 手動ワークフロー約10.5時間。 |
インプット量 | DNA 40 ngおよび/またはRNA 40 ng |
システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer |
手法 | Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment |
マルチプレックス | 最大8プレックス |
Nucleic acid type | DNA, RNA |
Specialized sample types | FFPE tissue |
Species category | ヒト |
テクノロジー | イルミナシーケンサー |
バリアントクラス | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Novel transcripts, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants |
TSO 500のランには、以下が必要です。
DRAGENバリアントコーリングパイプラインで解析するには、以下が必要です。
最終レポートを生成するには、以下が必要です。
TruSight Oncology 500は、FFPE腫瘍サンプルの包括的ゲノムプロファイリングを可能にし、より少ないサンプルで幅広いバイオマーカーを評価し、単一遺伝子または小規模パネルアッセイよりも多くの結果をもたらします。
TruSight Oncology 500アッセイ
装置 | Recommended number of samples | Read length |
---|---|---|
NextSeq 500 System | 8 samples per run (high output flow cell), 100M paired-end reads, 3,500× coverage |
2 × 101 bp |
NextSeq 550Dx in Research Mode | 8 samples per run (high output flow cell), 100M paired-end reads, 3,500× coverage |
2 × 101 bp |
私たちのがん臨床研究ソリューションでは、正確なゲノム情報を提供しており、研究所では複数の遺伝子を1回の試験で解析できます。
次世代シーケンサー(NGS)ベースのがんシーケンス法は、単一遺伝子およびアレイベースのアプローチと比較して、より短い時間でより多くの情報を提供します。
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パンフレット PDF 6 MB
TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High Throughput | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |||
---|---|---|---|---|---|
アッセイ時間 | サンプルから結果まで4~5日 | サンプルから結果まで4~5日 | 精製された核酸からバリアントレポートまで<4日 | ||
Automation capability | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) | ||
自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | ||
Cancer type | Pan-cancer, Solid tumor | Pan-cancer, Solid tumor | Pan-cancer, Solid tumor | ||
コンテンツ仕様 | 523の遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94 Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。 オプションのTruSight Oncology 500 HRDキット(日本ではご利用いただけません)には、Myriad Geneticsによる包括的ゲノム不安定性スコア(LOH+TAI+LST)により相同組換え欠損を評価するための、約25,000のSNPが含まれます。 | 523の対象遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。 |
合計1.94 Mbのパネルサイズに対する523遺伝子(完全コード配列)をターゲットとして選択。 • 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ:TMBおよびMSI • ガイドラインの適用範囲:複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅 • 臨床試験のカバレッジ:600件を超える臨床試験(2023年2月現在、Pierian臨床ナレッジベースに基づく) |
||
説明 | FFPE組織からの包括的ゲノムプロファイリングを可能にし、NextSeq 550システムまたはNextSeq 550Dx システム(研究(RUO)モード)で実行し、一度に最大8サンプルをバッチ処理できるアッセイ。 | NovaSeq 6000 システムまたはNovaSeq 6000Dx システム(研究(RUO)モード)を使用した合理化されたワークフローから、ガイドラインおよび>1,000件の臨床試験における主要なバイオマーカーを同定するためのハイスループットの包括的なNGSアッセイ。免疫腫瘍学バイオマーカーのMSIおよびTMBのカバレッジが含まれます。 | 液体生検サンプル(血漿からのctDNA)の包括的ゲノムプロファイリングにより、がん研究アプリケーション用の固形腫瘍のプロファイリングのための非侵襲的方法を提供します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する洞察を提供します。 | ||
ハンズオンタイム |
自動ワークフロー約2.5時間。 手動ワークフロー約10.5時間。 |
自動ワークフロー約2.5時間。 手動ワークフロー約10.5時間。 |
ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間 | ||
インプット量 | DNA 40 ngおよび/またはRNA 40 ng | DNA 40 ngおよび/またはRNA 40~80 ng | cfDNA 20 ng(血漿4 ml) | ||
システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer | NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System | NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System | ||
手法 | Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment | Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment | Targeted DNA sequencing, Target enrichment | ||
マルチプレックス | 最大8プレックス | 最大16プレックス(SPフローセル)、32プレックス(S1フローセル)、72プレックス(S2フローセル)、192プレックス(S4フローセル) | NovaSeq X: 4 on 1.5B, 24 on 10B, NovaSeq 6000: 8 on S2, 24 on S4 using Xp-4-Lane workflow, 192 indexes maximum | ||
Nucleic acid type | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA | ||
Specialized sample types | FFPE tissue | FFPE tissue | Circulating tumor DNA, Blood | ||
Species category | ヒト | ヒト | ヒト | ||
テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | ||
バリアントクラス | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Novel transcripts, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants | Gene fusions, Somatic variants, Novel transcripts, Structural variants, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
腫瘍横断型:BRAF、NTRK1、NTRK2、NTRK3、RET、MSI、TMB | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
重要なバイオマーカーを持つ遺伝子* | 潜在的に重要なバイオマーカーを持つ遺伝子† | ||||||||||
乳房 |
BRCA1 | BRCA2 | ERBB2 | ESR1 | PALB2 | PIK3CA | 180 | ||||
結腸 |
ERBB2 | KRAS | NRAS | 166 | |||||||
骨 |
EGFR | ERG | ETV1 | ETV4 | EWSR1 | FEV | FLI1 | FUS | H3F3A | HEY1 | 140 |
IDH1 | MDM2 | NCOA2 | SMARCB1 | ||||||||
肺 |
ALK | EGFR | ERBB2 | KRAS | MET | NUTM1 | ROS1 | 223 | |||
黒色腫 |
KIT | NRAS | ROS1 | 172 | |||||||
卵巣 |
BRCA1 | BRCA2 | FOXL2 | 149 | |||||||
CNS‡ |
APC | ATRX | CDKN2A | CDKN2B | EGFR | H3F3A | HIST1H3B | HIST1H3C | IDH1 | IDH2 | 140 |
MYCN | PTCH1 | RELA | TERT | TP53 | |||||||
前立腺 |
AR | ATM | BARD1 | BRCA1 | BRCA2 | BRIP1 | CDK12 | CHEK1 | CHEK2 | FANCL | 151 |
FGFR2 | FGFR3 | PALB2 | RAD51B | RAD51C | RAD51D | RAD54L | |||||
甲状腺 |
HRAS | KRAS | NRAS | RET | TERT | 165 | |||||
子宮および子宮頸部 |
BRCA2 | EPC1 | ERBB2 | ESR1 | FOXO1 | GREB1 | JAZF1 | NCOA2 | NCOA3 | NUTM2A | 138 |
NUTM2B | PAX3 | PAX7 | PHF1 | POLE | SMARCA4 | SUZ12 | TP53 | YWHAE | |||
その他の固形腫瘍 |
ALK | APC | ARID1A | ASPSCR1 | ATF1 | ATIC | BAP1 | BCOR | BRCA1 | BRCA2 | 152 |
CAMTA1 | CARS | CCNB2 | CDK4 | CDKN2A | CIC | CITED2 | CLTC | COL1A1 | COL6A3 | ||
CREB1 | CREB3L1 | CREB3L2 | CSF1 | CTNNB1 | DDIT3 | DDX3X | DNAJB1 | DUX4 | EED | ||
EGFR | ERBB2 | ERG | ETV1 | ETV4 | ETV6 | EWSR1 | FEV | FGFR2 | FGFR3 | ||
FLI1 | FOXL2 | FOXO1 | FOXO4 | FUS | GLI1 | HEY1 | HGF | HMGA2 | IDH1 | ||
KRAS | LEUTX | MAML3 | MDM2 | MYB | MYOD1 | NAB2 | NCOA2 | NF1 | NFATC2 | ||
NFIB | NR4A3 | NRAS | NUTMI | NUTM2A | NUTM2B | PALB2 | PATZ1 | PAX3 | PAX7 | ||
PDGFB | PDGFRA | PRKACA | PRKD1 | RANBP2 | ROS1 | SDHA | SDHB | SDHC | SDHD | ||
SMARCB1 | SS18 | SSX1 | SSX2 | SSX4 | STAT6 | SUZ12 | TAF15 | TCF12 | TERT | ||
TFE3 | TFEB | TFG | TP53 | TPM3 | TPM4 | TRAF7 | TSPAN31 | VGLL2 | WT1 | ||
WWTR1 | YAP1 | YWHAE | ZC3H7B |
この表に記載されている遺伝子とバイオマーカーは、パネルに含まれるすべての遺伝子のサブセットです。全遺伝子リストについては、TruSight Oncology 500データシートを参照してください。
*現在の医薬品ラベルまたはガイドラインにリンクされた重要なバイオマーカーを持つ遺伝子。
† 臨床試験での存在に基づく潜在的に重要なバイオマーカーを持つ遺伝子。
‡ CNS、中枢神経系。
参考文献
1. 社内計算データ Illumina, Inc. 2023.
TruSight Oncology 500 HRD Kit (24 samples)
20076480
TruSight Oncology 500 HRD Kit(HRD濃縮試薬を含みます。ライブラリー調製またはシーケンスコ...
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TruSight Oncology 500 DNA Kit (48 samples)
20028213
最大48のDNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬が含まれます。NextSeq 500/550シ...
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TruSight Oncology 500 DNA Kit, For Use with NextSeq (48 samples)
20028214
最大48のDNAサンプル、16のインデックス、NextSeq 500/550シーケンス試薬を調製および濃縮するための試薬...
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TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle, (16 indexes, 24 samples)
20028215
最大24のDNAおよびRNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬が含まれます。NextSeq 50...
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TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle, for use with NextSeq (16 indexes, 24 samples)
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最大24のDNAおよびRNAサンプル、16のインデックス、NextSeq 500/550シーケンス試薬を調製および濃縮す...
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TruSight Oncology 500 DNA Kit plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 Samples)
20032624
Pierian Clinical Genomics Workspaceを使用して、最大48のDNAサンプル、16のインデ...
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TruSight Oncology 500 DNA Kit for Use with NextSeq plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 Samples)
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最大48のDNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬、Pierian Clinical Genom...
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TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle plus Velsera interpretation report (16 indexes, 24 Samples)
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Pierian Clinical Genomics Workspaceを使用して、最大24のDNAおよびRNAサンプル、...
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最大24のDNAおよびRNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬、Pierian Clinical...
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TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit (16 indexes, 64 Samples)
20045504
最大64のDNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬が含まれます。NextSeq 500/550シ...
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TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit, For Use with NextSeq (16 indexes, 64 Samples)
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最大64のDNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬、およびNextSeq 500/550シーケン...
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TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit plus Pierian interpretation report (16 indexes, 64 samples)
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Pierian Clinical Genomics Workspaceを使用して、最大64のDNAサンプルと16のインデ...
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最大64のDNAサンプルと16のインデックスを調製および濃縮するための試薬、Pierian Clinical Genom...
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TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit (16 indexes, 32 Samples)
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Pierian Clinical Genomics Workspaceを使用して、最大32のDNAおよびRNAサンプル、...
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TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit, For Use with NextSeq (16 indexes, 32 Samples)
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TruSight Oncology 500 Training (DNA, optional HRD) - Customer Site
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TruSight Oncology 500ワークフローの必須ステップをユーザーに理解してもらうための、顧客サイトでの3日...
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TruSight Oncology 500 Training (DNA and RNA, optional HRD) - Customer Site
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TruSight Oncology 500ワークフローの必須ステップをユーザーに理解してもらうための、3.5日間の顧客サ...
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Illumina Connected Insights‒Training and Onboarding
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Informatics Professional Services
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Illumina DRAGEN Server v3
20040619
初年度Avance Exchangeサポートが含まれます。年間DRAGENライセンスの購入が必要です。
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Illumina DRAGEN Server v4
20051343
初年度Avance Exchangeサポートが含まれます。年間DRAGENライセンスの購入が必要です。
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DRAGEN TruSight Oncology 500 HRD Analysis Software, On-Premise
20073738
TSO 500 HRD用オンプレミス解析ソフトウェアのライセンスが同梱されています。
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ICA Basic Annual Subscription
20044874
Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription...
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ICA Professional Annual Subscription
20044876
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Illumina Analytics - 1 iCredit
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iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyti...
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Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
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Illumina Analytics - 5,000 iCredits
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Illumina Analytics - 50,000 iCredits
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Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyti...
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Illumina Connected Insights-Annual Subscription
20090137
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Illumina Connected Insights‒Oncology Genome Equivalent Sample-VCF
20090138
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アッセイの主な違いはスケールです。TruSight Oncology 500は、NextSeq 550またはNextSeq 550Dx システム(研究(RUO)モード)で実行され、一度に最大8つのサンプルをバッチ処理できます。TruSight Oncology 500 HTは、NovaSeq 6000システムまたはNovaSeq 6000Dx システム(研究(RUO)モード)で実行され、一度に16~192のサンプルのバッチ処理が可能で、より高いサンプルスループットへのスケーラビリティを提供します。その他の違いについては、このページの比較表を参照してください。
解析は、2 x 101 bpの最小リード長に最適化されています。75 bpまでの短いリード長でも許容される可能性がありますが、完全には検証されていません。
はい、ベンダーが開発した手法でTruSight Oncology 500ワークフローを自動化できます。
イルミナのDRAGEN二次解析プラットフォームは、非DRAGENオプションの2倍の速度でより高いバリアントコール精度を実現します。1 精度の向上により、サンプルQC、複雑なバリアント、小さなバリアント、融合遺伝子、スプライスバリアント、およびBRCA1/BRCA2を呼び出すエクソンレベルのCNVで高いパフォーマンスを実現します。DRAGENパイプラインは、HRD同定用のTruSight Oncology 500 HRDアッセイとも互換性があります。
はい、ご自身のソフトウェアで解析できます。ただし、その場合は、イルミナからテクニカルサポートを直接提供することはできません。
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)およびその他のがん研究サンプルからの507の遺伝子カバレッジを提供する、包括的な融合遺伝子検出を提供。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSI)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現し、スケーラビリティを強化します。
固形腫瘍に関連する170の遺伝子をターゲットとする包括的な次世代シーケンサー(NGS)アッセイ。
ライブラリー調製とターンアラウンドタイムを高速化するシングルチューブSLIMamp とワークフローを利用した、DNAコンテンツを組み合わせた58遺伝子汎がんパネル。
血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋組織など、多種多様なRNAサンプルタイプを用いる遺伝子発現・バリアント検出・融合検出の研究のために、1,385のがん遺伝子をターゲットとします。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
フォームにご記入いただくと、TruSight Oncology 500初回購入プログラムに関する情報を受け取ることができます。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。
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