ライブラリー調製の自動化
当社のライブラリー調製ポートフォリオを網羅する自動化手法
エラーを最小化し、ハンズオンタイムを短縮し、より高いスループットを実現
ライブラリー調製の自動化
自動リキッドハンドリングシステムは、ラボが効率を高めながら一貫した結果を得て維持するのに役立ちます。また、自動化により、追加のハンズオンタイムを必要とせずにスループットを迅速にスケーリングすることもできます。
オートメーションパートナー
イルミナは、主要な自動化ベンダーと提携し、主力システムでライブラリー調製キットの自動化メソッドの提供を支援しています。自動化の知識とライブラリー調製およびシーケンスの専門知識を組み合わせることで、NGS構成の自動化システムのための貴重なソリューションを生み出すことができます。
イルミナ認定メソッド
イルミナの認定メソッドは、ほとんどのライブラリー調製ポートフォリオで利用できます。これらの手法は、当社のパートナーが開発、テスト、配布、所有、サポートしています。イルミナは、メソッドのパフォーマンスとデータ品質を確保するためにデータを確認します。
ベンダーが開発した手法
ベンダーが開発した手法とは、パートナーによって開発されたものの、イルミナによるデータレビューを受けていない手法です。これらの方法は下の表に記載されていますが、イルミナ認定識別子はありません。
ライブラリー調製自動化パートナーチャート
下のチャートおよび関連する凡例を参照して、イルミナがどのメソッドに適格かを判断してください。
パートナーの文書を表示するには、チャート上部のパートナー名をクリックしてください。
イルミナ認定（イルミナの解析では、これらの方法で調製されたライブラリーは手動で調製されたものと同等に機能することが示されている）
| アジレント | ベックマン・コールター | エッペンドルフ | ハミルトン | PerkinElmer | テカン | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| イルミナストランドトータルRNA | Biomek i7 | epMotion 5075t | NGSスター | シクロン | ドリームプレップ | |
| イルミナストランドmRNA | Biomek i7 | epMotion 5075t | NGSスター | シクロン | ||
| Illumina RNA Prep with Enrichment | BravoオプションA | Biomek i7 | epMotion 5075t | NGSスター | シクロン | |
| イルミナDNA PCRフリー | Biomek i5 Biomek i7 |
epMotion 5075t | NGSスター | シクロン Zephyr |
ドリームプレップ Freedom EVO NGS |
|
| Illumina DNA Prep | BravoオプションB BravoオプションA |
Biomek FXp Biomek iシリーズ NGeniuS |
epMotion 5075t | NGSスター | シクロン | Freedom EVO NGS |
| Illumina DNA Prep with Enrichment | BravoオプションB BravoオプションA |
Biomek FXp Biomek iシリーズ |
epMotion 5075t | NGSスター | シクロン | Freedom EVO NGS |
| Nextera XT DNA | BravoオプションB | Biomek FXp Biomek iシリーズ |
epMotion 5075t | NGSスター | シクロン | Freedom EVO NGS |
| AmpliSeq for Illumina * | Biomek i5 | epMotion 5075t epMotion 5073 |
NGSスター NGSスターレット |
シクロン | ||
| TruSight Oncology 500HT | Biomek i7 | NGS STARと96 MPH/SBS STAR MOA | ||||
| TruSight Oncology 500 | Biomek NXp Biomek i5 |
NGS STAR/SBS STAR LSA NGSスターレット |
シクロン | |||
| TruSight Tumor 15 | Biomek 4000 | epMotion 5075t | Zephyr | |||
| TruSight Tumor 170 | Biomek NXp | NGSスター | ||||
| TruSeq DNA PCR-Free | BravoオプションB | Biomek FXp | epMotion 5075t | NGSスター | Sciclone NGSおよびNGSx | Freedom EVO NGS |
| TruSeq Nano DNA | BravoオプションB | Biomek FXp Biomek iシリーズ |
epMotion 5075t | NGSスター | Sciclone NGSおよびNGSx | Freedom EVO NGS |
| TruSeq Stranded mRNA | BravoオプションB BravoオプションA |
Biomek FXp Biomek iシリーズ |
epMotion 5075t | NGSスター | Sciclone NGSおよびNGSx | Freedom EVO NGS |
| TruSeq Stranded Total RNA | BravoオプションB | Biomek FXp | epMotion 5075t | NGSスター | Sciclone NGSおよびNGSx | Freedom EVO NGS |
2022年1月より、HamiltonはTruSight Oncologyライブラリー調製用のNGS STAR構成をSBS STAR LSAとして参照します。既存のイルミナ認定メソッドはすべて下位互換性があり、この変更は名前のみのものであるため、このシステムで引き続き実行されます。
*自動化プラットフォームに関連するより高いデッドボリューム要件や、元の試薬メーカーによるオーバーフィル量の変動に対応するために、1キットあたりの最大ライブラリー数を調製する場合、複数のAmpliSeq for Illuminaキットが必要になる場合があります。
自動ライブラリー調製ワークフローの例
Agilent Fragment Analyzerシステムによる核酸品質の評価
Fragment Analyzerは、単離された核酸と調製されたライブラリーの品質と量を正確に評価し、シーケンス中のクラスター生成を最適化します。システムオプションは、ロースループットとハイスループットの両方のラボに対応します。
ダウンロードハイスループットメタゲノミクスのための自動化されたNextera DNA Flex Library Prep（現在のIllumina DNA Prep）ワークフロー
合理化された自動化されたワークフローにより、非常に均一なライブラリーが生成され、種同定、メタゲノムプロファイリング、およびde novoゲノムアセンブリのための優れたデータが得られます。
ダウンロード
TruSight Oncology 500ハイスループットの自動化
ベックマン・コールター社とハミルトン社の自動化手法により、ライブラリー調製を合理化し、一貫性を持たせています。
Hamilton Tech Noteを読むベックマン・コールター社のテクニカルノートを読む
ラボでハイスループットシーケンスを採用
ハイスループットシーケンスは、費用対効果の高い方法でデータ豊富なアプリケーションを実行し、より多くのサンプルを処理して統計的有意性を向上させることができます。より多くのデータに迅速にアクセスして、より多くの洞察を得ることができます。
詳細はこちらライブラリー調製の技術的ヒント
DNA／RNA単離の際の検討事項
ライブラリー調製前のDNAやRNAの精製時にコンタミネーションを予防する役に立つガイダンスをご覧ください。
dsDNAライブラリー濃縮
イルミナのライブラリー調製方法の一部について、ライブラリー濃度をng/µlからnMに変換する方法を学びます。
定量と品質管理
シーケンスランを成功させる最終ライブラリーの定量と検証の方法をご覧ください。