ライブラリー調製の自動化

イルミナのライブラリー調製製品シリーズ全般で利用可能な自動化オプションを活用することで、エラーを最小限に抑え、ハンズオンタイムを短縮し、さらなるハイスループットを実現します

Scientist starting library prep automation sequence

ライブラリー調製の自動化

自動リキッドハンドリングシステムの導入により、ラボでは作業効率を向上させながら、安定した実験結果を得ることができます。NGSライブラリー調製の自動化を活用することで、ハンズオンタイムを短縮しながらスループットを迅速にスケーリングすることができます。

イルミナは主要ベンダーと提携して、イルミナのライブラリー調製キットの自動化プロトコールを開発しています。そのため、パートナーの自動化に関する知見とイルミナのライブラリー調製およびシーケンシングの専門知識を活かしつつ、お客様に最適なNGSソリューションを提供することができます。

自動ライブラリー調製プロトコールの種類

イルミナ認定

イルミナ認定手法とは、イルミナのパートナーが開発し、テストを実施し、配布し、権利を保有し、かつサポートしている手法のことを指します。この場合、イルミナは、認定手法の性能とデータ品質を確保するためにデータの評価を行います。

ベンダー開発

ベンダー開発手法とは、自動化パートナーが開発した手法のうち、イルミナによるデータ評価を受けていないものを指します。

イルミナのライブラリー調製と互換性のある自動化プラットフォーム

どのライブラリー調製キットがどのリキッドハンドリングプラットフォームで自動化されているかを確認するか、またはイルミナの認定済みおよび/またはベンダーが開発した特定のプラットフォームのメソッドを見つけてください。

イルミナライブラリー調製製品

イルミナ認定メソッドによるプラットフォーム

ベンダーが開発した手法を用いたプラットフォーム

AmpliSeq for Illumina

AmpliSeqケミストリーaは、1回のランで数個から数百個のターゲットをマルチプレックス化されたPCRベースのワークフローで処理することができます。

  • Beckman Coulter: Biomek i5 
  • Eppendorf: epMotion 5075t 
  • Revvity: SciClone
  • Eppendorf: epMotion 5073
  • Hamilton: NGS STAR
  • Hamilton: NGS STARlet

a. 自動化プラットフォームに伴うデッドボリュームの増加要件や、元の試薬メーカーによる充填量のバリエーションに対応するため、キットごとに最大数のライブラリーを調製する際には、複数のAmpliSeq for Illuminaキットが必要になる場合があります。

COVIDSeq Assay (96 samples)

このロースループット~ミッドスループットのNGSアッセイにより、あらゆる規模のラボで、新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。

  • ご利用いただけません
  • Agilent: Bravo Option A
  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Tecan: Fluent DreamPrep
COVIDSeq Test (RUO Version)

このハイスループットのNGSアッセイにより、ラボは新しいSARS-CoV-2変異株の出現および有病率を特定して追跡することができます。

  • ご利用いただけません
  • Agilent: Bravo Option A
  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Tecan: Fluent DreamPrep
Illumina DNA PCR-Free Prep

高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データが得られる、効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフローです。

  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Revvity: Zephyr
  • Tecan: DreamPrep
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Beckman Coulter: Biomek i5
  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • ご利用いただけません
Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションに対応する、高速で、統合されたライブラリー調製のワークフローです。

  • Beckman Coulter: Biomek FXp
  • Beckman Coulter: Biomek iSeries
  • Beckman Coulter: NGeniuS
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Tecan: DreamPrep
  • Agilent: Bravo Option A
  • Agilent: Bravo Option B
Illumina DNA Prep with Enrichment

幅広いターゲットシーケンスアプリケーションに対応する、シーケンス対応DNAライブラリーを備えた高速で統合されたワークフローです。

  • Beckman Coulter: Biomek iSeries
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Agilent: Bravo Option A
  • Agilent: Bravo Option B
  • Beckman Coulter: Biomek FXp
Illumina RNA Prep with Enrichment

幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフローです。

  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Revvity: SciClone
  • Agilent: Bravo Option A
  • Hamilton: NGS STAR
Illumina Stranded mRNA Prep

ストランド情報の高精度な測定により、タンパク質コーディングトランスクリプトームの正確で偏りのない検出を実現するための、迅速で費用対効果の高いワークフローです。 

  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Revvity: SciClone
  • Hamilton: NGS STAR
Illumina Stranded Total RNA

研究における優れた柔軟性により、コーディングトランスクリプトームとノンコーディングトランスクリプトーム全体にわたる明確で包括的な解析を実現するための、合理化されたRNA-Seqソリューションです。

  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Tecan: DreamPrep
Nextera XT DNA

低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAシーケンス用のDNAライブラリーを調製するための90分のワークフローです。

  • Beckman Coulter: Biomek FXp
  • Beckman Coulter: Biomek iSeries
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: SciClone
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Agilent: Bravo Option B
TruSight Oncology 500

FFPE組織からのすべての主要なバリアントクラスと遺伝子シグネチャー(TMB、MSI、HRD*)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルで、包括的なゲノムプロファイリングを実現するアッセイです。

*HRDは、TruSight Oncology 500 HRDキットをTruSight Oncology 500に追加した場合にのみ利用できます。日本ではご利用いただけません。

  • Beckman Coulter: Biomek NXp
  • Beckman Coulter: Biomek i7
  • Hamilton: NGS STAR/SBS STAR LSAa
  • Beckman Coulter: Biomek i5
  • Hamilton: NGS STARlet
  • Revvity: Sciclone

a. 2022年1月をもって、Hamiltonは、TruSight Oncology 500ライブラリー調製用のNGS STAR構成の名称をSBS STAR LSAに変更しました。既存のイルミナ認定手法はすべて下位互換性があり、このシステムで引き続き実行可能です。

TruSight Oncology 500 High Throughput

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSI)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルで、包括的ゲノムプロファイリングを実現する、さらなるスケーラビリティを備えたアッセイです。

  • Beckman Coulter Biomek i7
  • Hamilton NGS STAR with 96 MPH/SBS STAR MOAa
  • ご利用いただけません

a. 2022年1月をもって、Hamiltonは、TruSight Oncology 500 High Throughputライブラリー調製用のNGS STAR構成の名称をSBS STAR LSAに変更しました。既存のイルミナ認定手法はすべて下位互換性があり、このシステムで引き続き実行可能です。

TruSeq DNA Nano

全ゲノムシーケンスのライブラリーを生成し、少量のDNAしか得られないサンプルを効率的に調べます。

  • Beckman Coulter: Biomek FXp
  • Beckman Coulter: Biomek iSeries
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: Sciclone NGS and NGSx
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Agilent: Bravo Option B
TruSeq DNA PCR-Free

複雑なゲノムを正確かつ包括的にカバーする、シンプルで包括的な全ゲノムシーケンス(WGS)ライブラリー調製です。

  • Beckman: Coulter Biomek FXp
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Revvity: Scicione NGS and NGSx
  • Agilent: Bravo Option B
  • Hamilton: NGS STAR
  • Tecan: Freedom EVO NGS
TruSeq Stranded mRNA

mRNAからシーケンスライブラリーを調製し、ストランド特異的情報でコーディングトランスクリプトームを明確に把握します。

  • Beckman Coulter: Biomek FXp
  • Beckman Coulter: Biomek iSeries
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: Sciclone NGS and NGSx
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Agilent: Bravo Option A
  • Agilent: Bravo Option B
TruSeq Stranded Total RNA

ヒト、マウスおよびホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織を含むさまざまな生物種やサンプルタイプに対応した、ロバストで高度にスケーラブルな全トランスクリプトーム解析(RNA-Seq)ソリューションです。

  • Beckman Coulter: Biomek FXp
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Hamilton: NGS STAR
  • Revvity: Sciclone NGS and NGSx
  • Tecan: Freedom EVO NGS
  • Agilent: Bravo Option B
TruSight Tumor 15

固形腫瘍において、15個の通常変異遺伝子をシンプルかつ迅速なワークフローで評価するためのフォーカスされたNGSパネルです。

  • Beckman Coulter: Biomek 4000
  • Eppendorf: epMotion 5075t
  • Revvity: Zephyr
  • ご利用いただけません
TruSight Tumor 170

固形腫瘍に関連する170の遺伝子をターゲットとする包括的なNGSアッセイです。

  • Beckman Coulter: Biomek NXp
  • Hamilton: NGS STAR
  • ご利用いただけません

主な自動ワークフロー:全ゲノムシーケンス

事前設定されたラボ情報管理システム(LIMS)プロトコールにより、サンプルの追跡、ランの管理、および実運用への移行を実現します。互換性のあるロボットリキッドハンドラーを活用して、高速ハイスループットシーケンスとデータ解析のためのライブラリーを調製します。

1
ワークフローの管理
2
ライブラリー調製をする
3
シーケンス
4
解析

自動化プラットフォームに関する情報と文書

イルミナのパートナーが提供する自動リキッドハンドリングプラットフォームの詳細をご覧ください。特定のイルミナライブラリー調製キットの自動化方法については、パートナーが作成した文書をご覧ください。

自動ライブラリー調製の例

COVIDSeqワークフローの自動化

COVIDSeq AssayおよびCOVIDSeq テスト(RUO)ワークフローは、さまざまな自動化ソリューションと互換性があり、8~96のサンプルのバッチサイズに構成可能です。

詳細情報が必要ですか?

自動化パートナーとイルミナ認定手法の詳細については、お問い合わせください。