次世代シーケンサー(NGS)と呼ばれる超並列シーケンシング技術は、生物科学に革命をもたらしました。超高速スループット、スケーラビリティ、スピードにより、NGSは研究者にさまざまなアプリケーションを実行させ、これまで不可能だったレベルの生体システムの研究を可能にします。
今日の複雑なゲノム研究の課題には、従来のDNAシーケンス技術の能力を超える深い情報が要求されています。次世代シーケンサーはそのギャップを埋め、これらの疑問を解決するための日常的な研究ツールとなっています。
次世代シーケンサー(NGS)は、超高スループット、スケーラビリティ、スピードを提供する大規模並列シーケンステクノロジーです。このテクノロジーは、DNAまたはRNAの全ゲノムまたはターゲット領域におけるヌクレオチドの順序を決定するために使用されます。NGSは生物科学に革命をもたらし、ラボがこれまでにないレベルでさまざまなアプリケーションを実行し、生物システムを研究することを可能にしました。
今日の複雑なゲノムの課題には、従来のDNAシーケンス技術の能力を超える深い情報が要求されています。NGSはそのギャップを埋め、これらの疑問を解決するための日常的なツールとなっています。
次世代シーケンサーテクノロジーは、サイエンティストが課題とし解明しうる疑問の内容を一変させました。革新的なNGSサンプル調製キットとデータ解析オプションにより、幅広いアプリケーションが実施できます。例えば、次世代シーケンサーでは以下が可能になります:
イルミナNGSテクノロジーには、古典的なサンガー法とは根本的に異なるアプローチが用いられています。Sequencing by Synthesis(SBS)ケミストリーが利用されており、この手法ではDNA鎖の複製のたびに付加される標識ヌクレオチドを大規模並列方式で追跡します。
次世代シーケンサーテクノロジーでは、DNAシーケンスデータを大量に生成することができます。また、従来のサンガーシーケンシングより費用がかからず、時間も節約できます。1、2イルミナのシーケンスシステムは、装置の種類と設定により、1回のランで300キロベースから数テラベースまでの範囲のデータ出力を実現します。
次世代シーケンステクノロジーの詳しい解説では、ゲノム科学の進化、シーケンステクノロジーにおける大きな進展、主な手法、イルミナシーケンス手法の基本などをご説明します。
解説をダウンロード次世代シーケンサーワークフローにはライブラリー調製、シーケンス、データ解析の3つの基本ステップがあります。
ライブラリー調製プロセスがどのように機能するかを学び、回答を迅速に得られる画期的なテクノロジーについて探ります。
ワークフローの効率を高めながら、幅広いスループットのニーズとサンプルタイプに対応するキットについて理解を深めましょう。
BeadChipから、ゲノム、トランスクリプトーム、またはエピゲノム研究のためのライブラリーの準備、シーケンサーの選択、解析、サポートまで、すべて1か所で必要な情報にアクセスできます。研究用途に応じて特別に設計された包括的なガイドを使用して、ラボに最適なツールを選択してください。
アクセスガイドヒトゲノムプロジェクトは、キャピラリー電気泳動ベースのサンガーシーケンス法を利用して、10年の歳月と30億ドル近くの費用が投入されました。
その一方、次世代シーケンサーは大規模全ゲノムシーケンス(WGS)をより利用しやすく、より実践的なものにします。サイエンティストがヒトゲノム全体を1回のシーケンス実験で解析したり、何千から何万ものゲノムを1年でシーケンスしたりすることを可能にします。
NGSベースのRNA-Seqは、マイクロアレイなどの従来のテクノロジーの非効率さと価格の壁を打ち破る、強力な方法です。マイクロアレイによる遺伝子発現解析では、低シグナル領域でのノイズによる影響と高シグナル領域でのシグナル飽和による影響があります。
一方、次世代シーケンサーは個別のデジタルシーケンスのリードカウントを定量するため、実質的にダイナミックレンジを広げることができます。3,4,5
ターゲットシーケンスではNGSの力にフォーカスし、遺伝子のサブセットや特定の対象ゲノム領域を効率よく、またコスト効率よくシーケンスします。NGSは高い拡張性があり、特定の実験ニーズに合わせて解像度レベルを調節することができます。複数のサンプルで浅くスキャンをするか、特定の領域に存在する希少なバリアントを見つけるために少数のサンプルで深いシーケンスを実施するかを選択できます。
詳細はこちら:
最近のイルミナ次世代シーケンサーテクノロジーの飛躍的進歩には、以下のようなものがあります:
異なる分野のサイエンティストが次世代シーケンサーを使用して、どのように画期的な発見を行っているのかをご覧ください。
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ゲノミクス、トランスクリプトミクス、エピジェネティクス、プロテオミクスのデータを組み合わせることで、疾患、細胞応答、発達に寄与する分子変化をより包括的に理解できるようになります。NGSを使用してマルチオミクス実験を行い、バイオマーカーの同定、遺伝型と表現型の関連付けなどを行います。
マルチオミクスの詳細はこちら以下のリソースは、次世代シーケンサー装置の購入を検討している場合に役立つガイドとなります。
リード長、カバレッジ、クオリティスコア、その他の実験的考察について学び、シーケンスランの実行計画を立てるのにお役立てください。
インタラクティブツールを利用して、カスタムNGSプロトコールを作成するか、プロジェクトに適した製品・手法をお選びください。
イルミナは、サイエンティストが研究を促進し、加速できるようにするベンチトップ型シーケンス ソリューションを提供します。
詳細はこちら国立がん研究所のDr. Michael Kellyが、基礎科学とトランスレーショナル研究の両方におけるシングルセルおよび空間テクノロジーの使用について語ります。
専門家が、がん研究の進歩におけるNGSの成果と課題の概要を解説します。また、統合マルチオミクスアプローチが将来のがん診断と治療にどのように使用できるかについて説明します。
Dr. Arryn Craneyが、微生物臨床研究ラボのNGS導入のオプションと呼吸器病原体シーケンスのハンズオン経験について語ります。
RNA-Seqは、次世代シーケンサー(NGS)を使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
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