ベンチトップシーケンサー

使いやすいプラットフォームでNGSパワーをあなたのラボへ

ラボベンチトップ上のMiSeq i100

ベンチトップシーケンスはシンプルさと性能を融合

ベンチトップシーケンサーは、柔軟でアクセスしやすい設計で次世代シーケンサー(NGS)の性能をユーザーに提供します。操作のシンプルさを追求し、あらかじめ設定された解析ワークフローを備えたこれらのシステムは、初心者から経験豊富なNGSユーザーまでが社内でNGSを導入し、さまざまな用途でターゲットシーケンスを実行できるようにします。

ベンチトップシーケンサーは、ロースループットやスループットのアプリケーションや、大規模研究前のライブラリー品質管理(QC)において、コスト効率の高いソリューションを提供します。

scientist using NextSeq 2000

シーケンスをコントロールする

シーケンスプロジェクトを外部委託するユーザーにとって、NGSを社内に導入するために、ベンチトップシーケンサーに投資することには、いくつかの利点があります。

  • 1サンプルあたりのシーケンスコストの低減化
  • ターンアラウンドタイムを短縮し、より早く結果を得る
  • データの管理とプライバシーの維持

ベンチトップシーケンサーの種類

お客様のニーズに応じて、ベンチトップシーケンスシステムは、ロースループットまたはミッドスループットの構成を備え、優れたデータ品質と高い精度を実現しながら幅広いアプリケーションをに対応します。

ロースループットベンチトップシステム

出力:144メガベース(Mb)~30ギガベース(Gb)
1ランあたりのシングルエンドリード数: 100万~1億

  • ロースループットからミッドスループットでのターゲットシーケンスに最適
  • ターゲットサンプルための迅速なワークフロー
  • 大規模プロジェクト前のパイロット研究や、ライブラリーQCに最適

ミッドスループットベンチトップシステム

アウトプット:10 Gb ~ 540 Gb
1ランあたりのシングルエンドリード数:7,500万~18億

  • 空間解析やシングルセルシーケンスなど、新しいアプリケーションに幅広く対応する柔軟性
  • ベンチトップの設置面積を維持しながら、より広い出力範囲を実現
  • 二次解析パイプラインが、装置に含まれる場合があります

正しいベンチトップシーケンサーを見つける

ベンチトップシーケンスシステムの購入を検討する際に考慮すべき重要な要素には、ラボで最もよく使用するアプリケーションと、生成したデータをどのように解析するかです。

アプリケーションとサンプル数にデータ出力を一致させる

ロースループットまたはミッドスループットのベンチトップシーケンサーのどちらが必要かは、手法とアプリケーションによって決まります。主に小さな全ゲノム、微生物メタゲノム、ターゲット遺伝子シーケンスに興味がある場合は、ロースループットのベンチトップシーケンサーが適しています。全エクソームシーケンスやシングルセルシーケンスなどの手法には、ミッドスループットのベンチトップシーケンサーをご検討ください。

データの解析方法を決定する

解析の目的は、シーケンスプラットフォームを選択する場合の重要な検討事項です。初心者ユーザーには、装置内またはクラウド内で利用可能な、ユーザーフレンドリーで事前設定された解析パイプラインが役立つ可能性があります。経験豊富なユーザーであれば、より広範なインフォマティクスパイプラインと装置の互換性を利用したり、独自パイプラインを構築したりすることができます。

注目のイルミナベンチトップシーケンサー

初めてNGSシーケンサーを導入するラボでも、スケールアップの準備が整ったラボでも、イルミナはシンプルな操作性、柔軟でスケーラブルなシーケンス、直感的データ解析を備えた実績のあるベンチトップシーケンスシステムを提供しています。  オンボードクラスター形成と最小限のメンテナンスを含むシンプルで洗練されたデザインが、これらのシーケンサーの大きな特徴です。

MiSeq i100シリーズ

MiSeq i100シリーズは、シンプルな操作性と統合されたデータ解析機能により、初心者から経験豊富なユーザーまでが簡単にNGSを利用できるようにします。最短4時間という高速なランタイムで、その日のうちに結果がでるため、これまで以上に迅速な探索が可能になります。

NextSeq 1000システムとNextSeq 2000システム

NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは柔軟性と拡張性に優れているため、シングルセル、全エクソーム、RNAシーケンスのようなアプリケーションを模索するサイエンティストを支援します。2,150件を超えるシステムが世界中の市場に出荷されています。その特徴は、シンプルなランセットアップ、最小限のタッチポイント、DRAGENソフトウェア内蔵等、柔軟なインフォマティクスソリューションです。

定評のあるイルミナのベンチトップシーケンスシステムを比較

 
主なアプリケーション
 
サポートされているアプリケーション

*小さなターゲットパネル < 50 genes, large targeted panels > 50の遺伝子。

   

NEW

 
 

主な仕様

iSeq 100システム

MiniSeqシステム

MiSeqシステム

MiSeq i100シリーズ

NextSeq 1000 & 2000システム

出力範囲 144 Mb~1.2 Gb 1.65~7.5 Gb 300 Mb~15 Gb 1.5~30 Gba 10~540 Gb
キット構成の数 5 5 9 10 14
ランタイム(範囲) 9.5~19時間 5~24時間 5.5〜56時間 約4~15.5時間 8~44時間
ランあたり最大リード数(シングルリード) 4M 25M 25M 100M 1.8B
最大リード長 2 x 150 bp 2 x 150 bp 2 x 300 bp 2 x 300 bp 2 x 300 bp
主なアプリケーション
小規模全ゲノムシーケンス

(微生物、ウイルス)

細菌、ウイルス、その他の微生物の全ゲノムをシーケンスします。

主なアプリケーション
主なアプリケーション
主なアプリケーション
主なアプリケーション
サポートされているアプリケーション
ターゲットDNAシーケンス

ターゲット遺伝子シーケンスパネルは、与えられたサンプル中の特定の変異を解析するのに有用なツールです。

小さなターゲットパネルを使用した主なアプリケーション*

小さなターゲットパネルを使用した主なアプリケーション*

小さなターゲットパネルを使用した主なアプリケーション*

小さなターゲットパネルを使用した主なアプリケーション*

小さなターゲットパネルを使用した主なアプリケーション*

mRNAシーケンス

poly-Aキャプチャーを用い、、メッセンジャーRNA濃縮後の遺伝子発現の高感度で正確な測定。

     
主なアプリケーション
主なアプリケーション
トータルRNAシーケンス

コーディングRNAと複数のノンコーディングRNAを解析し、トランスクリプトームの全体像を把握することができます。

   
サポートされているアプリケーション
主なアプリケーション
主なアプリケーション
16S rRNAシーケンス

複雑な微生物叢や研究が困難な環境からの細菌を同定して比較するための培養不要の手法です。

   
主なアプリケーション
主なアプリケーション
主なアプリケーション
全エクソームシーケンス

遺伝子のコーディング領域を解析して遺伝的バリアントを同定するDNA技術です。

     
サポートされているアプリケーション
主なアプリケーション
メタゲノムのプロファイリング

(ショットガンメタゲノミクス、メタトラスクリプトミクス9

数千もの生物を並行してシーケンスします。培養不可能な微生物や少量の微生物を同定したり、細菌、ウイルス、あるいはその他の微生物の全ゲノムの微生物の多様性を評価したりします。

     
サポートされているアプリケーション
主なアプリケーション
ATAC-Seq

ゲノム全体のクロマチンアクセシビリティを決定するための定評のある手法です。

     
サポートされているアプリケーション
主なアプリケーション
メチル化シーケンス

シーケンサーを用いたDNAメチル化解析により、高いカバレッジ密度と柔軟性を実現し、エピジェネティクス研究を強化します。

     
サポートされているアプリケーション
主なアプリケーション
ターゲットプロテオミクス

特定のタンパク質を分析し、生物学的システムにおける機能と相互作用を理解します。

     
主なアプリケーション
主なアプリケーション
シングルセルシーケンス

より大きな組織を構成する、明確な細胞ニッチを見出します。

     
サポートされているアプリケーション
主なアプリケーション
空間解析

組織切片内の転写活性の包括的なマップを取得します。

       
主なアプリケーション
リキッドバイオプシー研究

非侵襲的ながんバイオマーカーとしてセルフリー血中循環腫瘍DNAを調べます。

     
サポートされているアプリケーション
サポートされているアプリケーション
免疫レパートリーシーケンス

免疫細胞受容体を解読し、免疫システムの多様性と応答性を理解します。

   
主なアプリケーション
主なアプリケーション
主なアプリケーション
大規模全ゲノムシーケンス

(ヒト)

全ゲノムの網羅的なシーケンス。

       
サポートされているアプリケーション
 

iSeq 100システムの詳細

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NextSeq 1000および2000システムの詳細

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実績のあるテクノロジーとサポートで、安心してNGSをラボに導入

ラボに最適なベンチトップシーケンサーを選ぶ際には、優れた実績を持つベンダーを選ぶことが重要です。イルミナは、革新を追求し続けることで、サイエンティストの皆様が成長し続けるゲノミクスコミュニティに参加することを支援しています。その確かな性能により、イルミナ他のどのシーケンス企業よりも多くの論文で引用されています。

421,000本以上のシーケンスに関する論文1
世界中で10,000台以上のMiSeqシステムを導入
世界中で2,150台以上のNextSeq 1000システムおよびNextSeq 2000システムを導入
年間3000回以上のトレーニング
24時間365日のリモートテクニカルサポート
150か国以上でサービスを提供

サイエンティストの話を聞く

これらの動画や記事では、イルミナのベンチトップシーケンスシステム使用時のエクスペリエンスについて他の人の声を聞くことができます。

薬剤耐性菌の発生源を探る

この記事では、Dr Philip SupplyがMiSeqシステムを使用して広範な耐性、伝播、進化のパターンを評価し、無症候性の感染拡大の原因となっている多剤耐性結核株を同定する方法について説明します。

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注釈

  1. *社内資料(Illumina, Inc. 2023)