使いやすいプラットフォームでNGSのパワーをあなたのラボへ
ベンチトップシーケンサーは、柔軟でアクセスしやすい設計で次世代シーケンサー（NGS）の性能をユーザーに提供します。これらのシステムは、事前設定された解析ワークフローを含む簡潔な運用で構築されています。初心者であっても、経験豊富なNGSユーザーであっても、NGSを社内に持ち込んで、さまざまなアプリケーションにわたってターゲットシーケンスを実行できるようにします。
ベンチトップシーケンサーは、ロースループットアプリケーション、ミッドスループットアプリケーション、および大規模な研究前のライブラリー品質管理（QC）のためのコスト効率の高いソリューションを提供します。
シーケンスプロジェクトを外部委託するユーザーにとって、NGSを社内に導入するために、ベンチトップシーケンサーに投資することには、いくつかの利点があります。
お客様のニーズに応じて、ベンチトップシーケンスシステムは、ロースループットまたはミッドスループットの構成を特徴として、優れたデータ品質と精度を実現しながら幅広いアプリケーションをサポートします。
出力：144メガベース（Mb）～30ギガベース（Gb）
ランあたりのシングルエンドリード数: 100万～1億
アウトプット：10 Gb ～ 540 Gb
ランあたりのシングルエンドリード：7,500万～18億
ベンチトップシーケンサーは、幅広い範囲のアプリケーションとスループットをサポートします。お客様のラボのニーズに最適なNGSシステムを選択するための、ステップバイステップガイドをご覧ください。
ベンチトップシーケンスシステムの購入を検討する際に考慮すべき重要な要素には、ラボで最もよく使用するアプリケーションと、生成されたデータの解析方法があります。
手法とアプリケーションは、ロースループットまたはミッドスループットのベンチトップシーケンサーが必要かどうかの判断に役立ちます。小さな全ゲノム、微生物メタゲノム、ターゲット遺伝子シーケンスに主に興味がある場合は、ロースループットのベンチトップシーケンサーが適しています。全エクソームシーケンスやシングルセルシーケンスなどの手法については、ミッドスループットのベンチトップシーケンサーを検討します。
解析に関する目標は、シーケンスプラットフォームを選択する場合の重要な検討事項です。初心者ユーザーには、装置上またはクラウド内で利用可能な、ユーザーフレンドリーな事前設定された解析パイプラインが役立つ可能性があります。経験豊富なユーザーであれば、より広範なインフォマティクスパイプラインとの装置の互換性を利用したり、独自のものを構築したりできます。
お客様のラボが最初のNGSシーケンサーを取得しているか、またはスケールアップの準備ができているかにかかわらず、イルミナはシンプルな操作、柔軟でスケーラブルなシーケンス、直感的データ解析を備えた実績のあるベンチトップシーケンシング システムを提供しています。 オンボードクラスター形成と最小限のメンテナンスを含むシンプルで思慮深いデザインが、これらのシーケンサーを際立たせています。
MiSeq i100シリーズは、初心者や経験豊富なユーザーが、簡単な操作と統合データ解析でNGSに簡単にアクセスできます。4時間という高速なランタイムで、同日の結果を受け取り、これまでにない速さで発見を推し進めます。
NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは柔軟性と拡張性に優れているため、シングルセル、全エクソーム、RNAシーケンスのようなアプリケーションを模索するサイエンティストを支援します。2,150件を超えるシステムが世界中の市場に出荷されています。それらの特徴は、シンプルなランセットアップ、最小限のタッチポイント、DRAGENソフトウェア内蔵等、柔軟なインフォマティクスソリューションです。
新規 |
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| 主な仕様 |
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| 出力範囲a | 144 Mb～1.2 Gb | 1.65～7.5 Gb | 300 Mb～15 Gb | 1.5～30 Gb | 10～540 Gb |
| キット構成の数 | 5 | 5 | 9 | 10 | 14 |
| ランタイム（範囲） | 9.5～19時間 | 5～24時間 | 5.5〜56時間 | 4〜15.5時間 | 8～44時間 |
| ランあたり最大リード数（シングルリード） | 4M | 25M | 25M | 1億 | 1.8B |
| 最大リード長 | 2 x 150 bp | 2 x 150 bp | 2 x 300 bp | 2 x 300 bp | 2 x 300 bp |
| 主なアプリケーション | |||||
| 小規模全ゲノムシーケンス （微生物、ウイルス） 細菌、ウイルス、その他の微生物の全ゲノムをシーケンスします。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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サポートされているアプリケーション
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| ターゲットDNAシーケンス ターゲット遺伝子シーケンスパネルは、与えられたサンプル中の特定の変異を解析するのに有用なツールです。 |
小さなターゲットパネルによる主なアプリケーション* |
小さなターゲットパネルによる主なアプリケーション* |
小さなターゲットパネルによる主なアプリケーション* |
小さなターゲットパネルによる主なアプリケーション* |
小さなターゲットパネルによる主なアプリケーション* |
| mRNAシーケンス poly-Aキャプチャーを用い、、メッセンジャーRNA濃縮後の遺伝子発現の高感度で正確な測定。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| トータルRNAシーケンス コーディングRNAと複数のノンコーディングRNAを解析し、トランスクリプトームの全体像を把握することができます。 |
サポートされているアプリケーション
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主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| 16S rRNAシーケンス 複雑な微生物叢や研究が困難な環境からの細菌を同定して比較するための培養不要の手法です。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| 全エクソームシーケンス 遺伝子のコーディング領域を解析して遺伝的バリアントを同定するDNA技術です。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| メタゲノムのプロファイリング （ショットガンメタゲノミクス、メタトラスクリプトミクス９ 数千もの生物を並行してシーケンスします。培養不可能な微生物や少量の微生物を同定したり、細菌、ウイルス、あるいはその他の微生物の全ゲノムの微生物の多様性を評価したりします。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| ATAC-Seq ゲノム全体のクロマチンアクセシビリティを決定するための定評のある手法です。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| メチル化シーケンス シーケンサーを用いたDNAメチル化解析により、高いカバレッジ密度と柔軟性を実現し、エピジェネティクス研究を強化します。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| ターゲットプロテオミクス 特定のタンパク質を分析し、生物学的システムにおける機能と相互作用を理解します。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| シングルセルシーケンス より大きな組織を構成する、明確な細胞ニッチを見出します。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| 空間解析 組織切片内の転写活性の包括的なマップを取得します。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| リキッドバイオプシー研究 非侵襲的ながんバイオマーカーとしてセルフリー血中循環腫瘍DNAを調べます。 |
サポートされているアプリケーション
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サポートされているアプリケーション
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| 免疫レパートリーシーケンス 免疫細胞受容体を解読し、免疫システムの多様性と応答性を理解します。 |
主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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主なアプリケーション
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| 大規模全ゲノムシーケンス （ヒト） subetenoゲノムの広範なシーケンス。 |
サポートされているアプリケーション
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*小さなターゲットパネル < 50 genes, large targeted panels > 50の遺伝子。 |
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References
ラボに最適なベンチトップシーケンサーを選定する際には、優れた実績を持つベンダーを選ぶことが重要です。イルミナは、より多くのサイエンティストに成長し続けるゲノムコミュニティに参加していただけるよう革新を追求し続け、そして、その実績が他のどのシーケンス会社よりも多く採用される要因となっています。
これらのビデオや記事で、他の研究者たちがイルミナベンチトップシーケンスシステムを使用した体験談をご紹介します。
この動画では、NextSeq 2000システムの堅牢性について、さらに、スロバキア・コメニウス大学サイエンスパークのDr Tomas Szemesのチームをどのようにサポートし、これまでのシーケンスの取り組みを倍増できたかについてご紹介します。
この入門動画で、ゲノムサーベイランス、CRISPRスクリーニング、シングルセルRNA-Seqなどに、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムを使用した研究者たちの声をお聞きください。
この記事では、Dr Philip SupplyがMiSeqシステムを使用して広範な耐性、伝播、進化のパターンを評価し、無症候性の感染拡大の原因となっている多剤耐性結核株を同定する方法について説明します。
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References
