NGSのラボへの導入の理由
ラボにNGS機能を導入
コスト削減と幅広い研究能力を活用
規模とディスカバリーパワーの拡大
ゲノミクス研究の規模とディスカバリーパワーを拡大することを目的に、NGSへの移行が進んでいます。ベンチトップシーケンスシステムはシンプルで、そのためNGS装置はあらゆる規模のラボで利用できるようになりました。このアクセシビリティにより、NGSの導入が選択されています。NGSシステムがラボ内にあることは、高品質で再現性のあるデータへの投資であり、貴重な生物学的洞察につながると考えられています。
稼働開始後間もないラボやリソースが限られている場合は、実験をコアラボに委託することでNGSを開始することができます。コアラボはエンドツーエンドのサポートを提供し、実験デザインで協働し成功を確実にします。
数十年の経験を持つイルミナは、アクセスを増やし、ワークフローと解析を簡素化することで、ラボ内でのNGSの簡単で迅速な採用を可能にします。
主要な研究分野でのNGSの使用
NGSは、多様なサンプルタイプに対して発表されているさまざまな手法を用いて、さまざまな生物学的疑問に対する答えを追求する上で重要な役割を果たします。NGSは、プロテオーム、トランスクリプトーム、エピゲノム、ゲノムなどの複数の生物学的な「オメ」を偏りなく調査できます。NGSでは、マルチオミクスと呼ばれる複数の「オメ」を一度に調べる組み合わせアプローチも達成可能です。
一般的なNGS手法とアプリケーションには、以下のものがあります。
ターンアラウンドタイムの短縮
ラボ内のベンチトップシーケンスにより、サンプルとデータの制御とターンアラウンドタイムの改善が可能となり、またNGSのパワーを活用して実験をより迅速に完了することができます。
高い費用対効果
シーケンスコストを削減することで、NGSの費用対効果はかつてないほど高まっています。1回の実験で、数千のターゲット領域にわたるバリアントと発現パターンを単一塩基の分解能まで同定できるため、従来のあまり包括的ではない方法よりもはるかに費用対効果が高く、またスケーラブルです。1-5
シンプルなワークフロー
イルミナのユーザーフレンドリーでスケーラブルな内蔵ソフトウェアソリューションが、解析をこれまで以上に容易にします。当社の統合ソフトウェアポートフォリオは、受賞歴のある精度を備えた安全で汎用性の高いソリューションであり、ウェットラボとドライラボでデータを接続しています。
サンプルとデータの制御
NGSプロジェクトやサンプルをより厳密に管理することで、ゲノムデータのプライバシーを強化し、高品質で再現性のあるデータを得ることができます。
NGSの有用性を拡大し、研究を加速
大規模で組み合わせリードとカウント機能により、より広い視野から開始することができ、その結果研究の範囲と影響を拡大できます。
ラボでシーケンスを開始
NGSは、研究の範囲と深度を拡大し、多様なサンプルタイプに対して発表されているさまざまな手法とアプリケーションのディスカバリーパワーを高めます。ベンチトップシーケンサーはシンプルかつアクセシビリティが高いため、NGSの最初の導入方法として最適です。
以下は、NGSを初めて導入する場合のシーケンサーの推奨例です。
MiSeqシステム
MiSeqシステムでは、NGSワークフローが簡素化されているため、初心者もNGSに迅速かつ確実にアクセスできます。10,000を超えるシステムを世界市場に出荷しているMiSeqシステムは、市場最大規模のベンチトップ型システムの設置基盤を有しています。10万超の査読付き論文に引用されており6、10年以上にわたって信頼を得てきました。
NextSeq 1000および2000システム
NextSeq 1000およびNextSeq 2000 システムは、柔軟性と拡張性に優れており、シングルセル、全エクソーム、RNAシーケンスのようなアプリケーションを探るサイエンティストを支援します。2,000を超えるシステムが世界市場に出荷されており、シンプルなランセットアップ、最小限のタッチポイント、DRAGENソフトウェア内蔵等、柔軟なインフォマティクスソリューションを特徴としています。
イルミナが選ばれる理由
イルミナは、サンプル調製から解析まで、幅広い製品を有する最大のシーケンスエコシステムを提供する、シーケンスの実績のあるリーダーです。グローバルなインフラとサポートにより、あらゆる段階でのサポートを提供します。
イルミナとタッグを組むことで、最先端のテクノロジーを得られるだけではなく、同じ目標と結果を持つコミュニティに参加することができます。イルミナは、最も多く引用されているシーケンス企業です。
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イルミナ製品サポート
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最新の研究をリードし、ベストプラクティスを共有することで、科学を共に前進させるコミュニティの一員になりましょう。
イルミナのパートナーになる
イルミナのパートナーシップは、NGSへのアクセスを拡大し、新しいアプリケーションやテクノロジーを開拓し、革新的なスタートアップ企業に資金を提供しています。
NGS購入ガイド
この包括的なガイドでは、研究目標とラボのニーズを評価することで、意思決定プロセス全体について手順を追って説明します。
- NGSシステムを購入する前に尋ねるべき重要な質問
- シーケンスおよびデータ解析プラットフォームの主な考慮事項
- NGS購入者のチェックリスト
補足資料
NGSコストに関する考慮事項
NGSのコストは急速に減少し、これまで以上に利用しやすくなっています。予算計画に役立つよう、コストに関する考慮事項とリソースをご用意しました。
財務ソリューション
イルミナの財務サービスは、迅速で簡単、そして手頃な価格の融資およびリースプログラムを提供しています。イルミナがサポートするソリューションとリースパートナーネットワークにより、それぞれのニーズに合ったオプションを提供できます。
チュートリアルとオンライントレーニング
NGSの主な概念を理解するのに役立つチュートリアルを多数ご用意しています。ライブラリー調製、シーケンス、およびデータ解析のベストプラクティスについて、順を追って説明します。
参考文献
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- Rivas Ma, Beaudoin M, Gardet a, et al. Deep resequencing of GWaS loci identifies independent rare variants associated with inflammatory bowel disease. Nat Genet. 2011;43(11):1066-1073. doi:10.1038/ng.952
- König K, Peifer M, Fassunke J, et al. Implementation of amplicon Parallel Sequencing Leads to Improvement of Diagnosis and therapy of Lung Cancer Patients. J Thorac Oncol. 2015;10(7):1049-1057. doi:10.1097/JtO.0000000000000570
- Shendure J, Ji h. Next-generation DNA sequencing. Nat Biotechnol. 2008;26(10):1135-1145. doi:10.1038/nbt1486 Schuster SC. Next-generation sequencing transforms today's biology. Nat Methods. 2008;5(1):16-18. doi:10.1038/nmeth1156
- *社内資料（Illumina, Inc. 2023）